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 NMR によって決定されたヒト Y ボックス タンパク質 1 (YB1) の一本鎖 DNA 結合コールド ショック ドメイン (CSD) の溶液構造 (最低エネルギー構造 10 個) | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | CSD | ||||||||
| パム | PF00313 | ||||||||
| ファム一族 | CL0021 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| プロサイト | PDOC00304 | ||||||||
| SCOP2 | 1mjc / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| 医療機器 | cd04458 | ||||||||
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分子生物学において、コールドショックドメイン（CSD）は、原核生物および真核生物のDNA結合タンパク質に見られる約70個のアミノ酸からなるタンパク質ドメインである。[1] [2] [3]このドメインの一部は、RNP-1 RNA結合モチーフと非常に類似している。[4]
大腸菌が37℃から10℃への温度低下にさらされると、4～5時間の誘導期が発生し、その後、成長が減速しながら再開されます。[5]誘導期には、コールドショックドメインを含む約13種類のタンパク質の発現が2～10倍に増加します。[6]コールドショック応答で誘導されるこれらのいわゆるコールドショックタンパク質は、最適成長温度よりも低い温度で細胞が生存するのを助けると考えられています。一方、熱ショック応答で誘導される熱ショックタンパク質は、おそらく染色体の凝縮と原核生物の核様体の組織化によって、最適温度よりも高い温度で細胞が生存するのを助けます。[5]
参考文献
- ^ Doniger J、Landsman D、Gonda MA、Wistow G (1992 年 4 月)。「N-ras の上流にある高度に保存された遺伝子 unr の産物には、DNA 結合モチーフと推定されるコールドショックドメイン (CSD) に類似した複数の反復配列が含まれています」。New Biol . 4 (4): 389–95. PMID 1622933。
- ^ Wistow G (1990年4月). 「コールドショックとDNA結合」. Nature . 344 (6269): 823–4. doi :10.1038/344823c0. PMID 2184368. S2CID 4307500.
- ^ Jones PG、Inouye M (1994 年 3 月)。「コールドショック反応 - ホットトピック」。Mol . Microbiol . 11 (5): 811–8. doi :10.1111/j.1365-2958.1994.tb00359.x. PMID 8022259。
- ^ Landsman D (1992年6月). 「RNA結合モチーフRNP-1はDNA結合コールドショックドメインに保存されている」. Nucleic Acids Res . 20 (11): 2861–4. doi :10.1093/nar/20.11.2861. PMC 336933. PMID 1614871 .
- ^ ab Obokata J, Ohme M, Hayashida N (1991年10月). 「Nicotiana sylvestris の推定グリシンリッチタンパク質 (19.7 kDa) をコードする cDNA クローンのヌクレオチド配列」. Plant Mol. Biol . 17 (4): 953–5. doi :10.1007/bf00037080. PMID 1912512. S2CID 11927654.
- ^ Tafuri SR、Wolffe AP (1990 年 11 月)。「アフリカツメガエル Y ボックス転写因子: 分子クローニング、機能分析、発達制御」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 87 (22): 9028–32. doi : 10.1073/pnas.87.22.9028 . PMC 55094 . PMID 2247479。