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| クロラシドバクテリウム | |
|---|---|
科学的分類 
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| ドメイン： | 細菌 |
| 門: | アシドバクテリオタ |
| クラス： | 「アシドバクテリア」 |
| 注文： | アシドバクテリア |
| 家族： | アシドバクテリア科 |
| 属: | 「クロラシドバクテリウム」 タンクとブライアント 2015 [1] |
| タイプ種 | |
| 「クロラシドバクテリウム・サーモフィラム」 タンクとブライアント 2015
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| 種[2] | |
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| 同義語 | |
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クロラシドバクテリウムはアシドバクテリオタ属の1属である。 [4]現在はアシドバクテリア科に分類されているが、系統学的証拠からはブラストカテリア属に属することが示唆されている。 [5]
これは2007年に発見された光合成細菌のグループであり、その同定により、クロロフィルベースの光合成を行うことができる細菌門の数が5から6に増加しました。[3] [6]
「カンディダトゥスクロラシドバクテリウム・サーモフィラム
生物「Candidatus Chloracidobacterium thermophilum」は、イエローストーン国立公園の温泉から採取された微生物マットのメタゲノム配列データのバイオインフォマティクス解析を通じて最初に検出されました。[7]その後、微生物マットサンプル中のSynechococcus属の阻害後に分離され、 C. thermophilum、Anoxybacillus属、およびMeiothermus属の共培養が起こりました。 C. thermophilum は、純粋に分離するために Midnight Medium (CTM) 培地に播種されました。細菌のゲノム配列決定により、硫酸塩を還元する酵素の遺伝子が含まれていないことが明らかになりましたが、還元された硫黄源に依存していました。研究者は、還元された硫黄源にアクセスするために、 Meiothermus属とAnoxybacillus属の共培養と相利共生関係を共有していると推測した可能性があります。さらに、細菌は好気性、中程度の好熱性、無酸素性、光従属栄養性であると判定されました。最終的に、彼らは、前培養分離には還元硫黄源、重炭酸塩、L-リジン、ビタミンB12が必要であることを発見した。[7]
系統発生
現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）[2]と国立生物工学情報センター（NCBI）[8]に基づいています。
参照
参考文献
- ^ Tank M、Bryant DA. (2015)。「Chloracidobacterium thermophilum gen. nov.、sp. nov.: 無酸素性微好気性クロロフォトヘテロトロフィックアシドバクテリウム」。Int J Syst Evol Microbiol . 65 : 1426–1430. doi : 10.1099/ijs.0.000113 . PMID 25667398。
- ^ ab AC Parte; et al. 「Chloracidobacterium」。命名法で定められた原核生物名のリスト（LPSN） 。 2022年9月9日閲覧。
- ^ ab Bryant DA, Costas AM, Maresca JA, Chew AG, Klatt CG, Bateson MM, et al. (2007年7月). 「Candidatus Chloracidobacterium thermophilum」: 好気性光栄養性アシドバクテリウム。Science . 317 (5837): 523–6. Bibcode :2007Sci...317..523B. doi :10.1126/science.1143236. PMID 17656724. S2CID 20419870.
- ^ NCBIの Chloracidobacterium のウェブページを参照してください。データは「NCBI 分類リソース」から抽出されました。国立生物工学情報センター。2007年 3 月 19 日閲覧。
- ^ Dedysh SN、 Yilmaz P. (2018)。「アシドバクテリア門の分類構造の改良」。Int J Syst Evol Microbiol。68：3796–3806。doi ： 10.1099 /ijsem.0.003062。PMID 30325293。
- ^ Raymond J (2008年2月). 「生命の樹の色づけ」. Trends in Microbiology . 16 (2): 41–3. doi :10.1016/j.tim.2007.11.003. PMID 18182293.
- ^ ab Tank M 、 Bryant DA (2015-03-27)。「光 従属栄養性アシドバクテリウム、Chloracidobacterium thermophilum の栄養所要量と成長生理学」。Frontiers in Microbiology。6 :226。doi : 10.3389 / fmicb.2015.00226。PMC 4376005。PMID 25870589。
- ^ Sayers; et al. 「Chloracidobacterium」。国立生物工学情報センター(NCBI) 分類データベース。 2022年9月9日閲覧。
- ^ 「The LTP」 。 2022年2月23日閲覧。
- ^ “LTP_all tree in newick format”. 2022年9月4日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2022年2月23日閲覧。
- ^ 「LTP_01_2022 リリースノート」(PDF) 。 2022年2月23日閲覧。
- ^ Dedysh SN、 Yilmaz P (2018)。「アシドバクテリア門の分類構造の改良」。Int J Syst Evol Microbiol。68：3796–3806。doi ： 10.1099 /ijsem.0.003062。PMID 30325293。
- ^ 「GTDBリリース07-RS207」。ゲノム分類データベース。 2022年6月20日閲覧。
- ^ "bac120_r207.sp_labels".ゲノム分類データベース. 2022年6月20日閲覧。
- ^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2022年6月20日閲覧。