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| 臭化物ペルオキシダーゼ | |||||||||
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 Corallina pilulifera由来の臭素ペルオキシダーゼ 12 量体、バナジウム臭素ペルオキシダーゼの例( PDB : 1UP8 ) | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 1.11.1.18 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | BRENDAエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZyme ビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイク | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
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臭化物ペルオキシダーゼ（EC 1.11.1.18、ブロモペルオキシダーゼ、ハロペルオキシダーゼ（曖昧）、好酸球ペルオキシダーゼ）は、系統名が臭化物：過酸化水素酸化還元酵素である酵素ファミリーです。これらの酵素は、次の化学反応を触媒します：[1] [2] [3]
- HBr + H 2 O 2 HOBr + H 2 O
HOBr は強力な臭素化剤です。海洋環境で観察される多くの有機臭素化合物は、この酸化された臭素との反応生成物です。
紅藻類と褐藻類（紅藻類と褐藻類）の臭素ペルオキシダーゼにはバナデート（バナジウム臭素ペルオキシダーゼ）が含まれています。バナジウムは生物学において珍しい補因子です。[4]この酵素ファミリーのおかげで、海洋資源からさまざまな臭素化天然物が単離されています。
関連するクロロペルオキシダーゼ酵素は塩素化に影響します。ハロペルオキシダーゼの命名法では、ブロモペルオキシダーゼは典型的には塩化物をまったく酸化できません。たとえば、好酸球ペルオキシダーゼは塩化物よりも臭化物を好むようですが、塩化物を利用できるため、ブロモペルオキシダーゼとは見なされません。
Muricidae（旧Murex ）属のカタツムリは、ティリアンパープルの染料を生成するのに使われる臭素ペルオキシダーゼを持っている。この酵素は臭化物に非常に特異的で物理的に安定しているが、活性部位の金属については特徴付けられていない。2019年現在[アップデート]、カタツムリのゲノムにおいてそのような酵素に特定の遺伝子は割り当てられていない。[5]このような活性は、おそらく共生するバチルス細菌によって提供される。[6]特定された酵素は、α/β加水分解酵素スーパーファミリーに属し、同様の臭素ペルオキシダーゼの構造はPDB :3FOBとして利用可能である。これは、Ser 99、Asp 229、およびHis 258の触媒トライアドで機能し、金属補因子を必要としない。[7]
追加資料
- De Boer, E.; Tromp, MGM; Plat, H.; Krenn, GE; Wever, R (1986)。「海洋褐藻類のハロペルオキシダーゼ活性に必須の元素としてのバナジウム(V) - Laminaria saccharina由来のバナジウム(V)含有臭化ペルオキシダーゼの精製と特性解析」。Biochim . Biophys. Acta . 872 (1–2): 104–115. doi :10.1016/0167-4838(86)90153-6。
- トロンプ MG、オラフソン G、クレン BE、ウィーバー R (1990 年 9 月)。 「Ascophyllum nodosum 由来のバナジウムブロモペルオキシダーゼのいくつかの構造的側面」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - タンパク質構造と分子酵素学。1040 (2): 192–8。土井：10.1016/0167-4838(90)90075-q. PMID 2400770。
- Isupov MN、Dalby AR、Brindley AA、Izumi Y、Tanabe T、Murshudov GN、Littlechild JA (2000 年 6 月)。「紅藻 Corallina officinalis 由来の 12 量体バナジウム依存性ブロモペルオキシダーゼの結晶構造」。Journal of Molecular Biology。299 ( 4): 1035–49。doi :10.1006/jmbi.2000.3806。PMID 10843856 。
- Carter-Franklin JN、 Butler A (2004年11 月)。「バナジウムブロモペルオキシダーゼ触媒によるハロゲン化海洋天然物の生合成」。アメリカ化学会誌。126 (46): 15060–6。doi :10.1021/ja047925p。PMID 15548002 。
- Ohshiro T, Littlechild J, Garcia-Rodriguez E, Isupov MN, Iida Y, Kobayashi T, Izumi Y (2004 年 6 月). 「バナジウム依存性ブロモペルオキシダーゼのハロゲン特異性の改変」.タンパク質科学. 13 (6): 1566–71. doi :10.1110/ps.03496004. PMC 2279980. PMID 15133166.
参考文献
- ^バトラー、 アリソン、ウォーカー、JV (1993)。「海洋ハロペルオキシダーゼ」。化学レビュー。93 (5): 1937–1944。doi :10.1021/cr00021a014。
- ^ Latham, Jonathan; Brandenburger, Eileen; Shepherd, Sarah A.; Menon, Binuraj RK; Micklefield, Jason (2018). 「合成に使用するためのハロゲナーゼ酵素の開発」。Chemical Reviews。118 ( 1 ): 232–269。doi : 10.1021 /acs.chemrev.7b00032。PMID 28466644 。
- ^ Vaillancourt, Frédéric H.; Yeh, Ellen; Vosburg, David A.; Garneau-Tsodikova, Sylvie ; Walsh, Christopher T. (2006). 「自然のハロゲン化触媒一覧: 酸化戦略が優勢」. Chemical Reviews . 106 (8): 3364–3378. doi :10.1021/cr050313i. PMID 16895332.
- ^ Butler, A.、「バナジウムハロペルオキシダーゼ」、Current Opinion in Chemical Biology、1998年、2、279-285。
- ^ Benkendorff, K (2013年4月23日). 「オーストラリアの海洋無脊椎動物Dicathais orbitaにおける天然物研究」. Marine Drugs . 11 (4): 1370–98. doi : 10.3390/md11041370 . PMC 3705410. PMID 23612370 .
- ^ Ngangbam, AK; Mouatt, P; Smith, J; Waters, DLE; Benkendorff, K (2019年5月3日). 「ムリ科軟体動物の鰓下腺から分離された臭素ペルオキシダーゼ産生バチルス属菌は、ティリアンパープル前駆体の生合成が可能」. Marine Drugs . 17 (5): 264. doi : 10.3390/md17050264 . PMC 6562550. PMID 31058830 . ジェンバンク AKQ77155.1。
- ^ 「寄託番号3FOB/IDP00046」。感染症構造ゲノム科学センター。 2019年5月31日閲覧。
外部リンク
- 米国国立医学図書館医学件名標目表(MeSH)の臭化物+ペルオキシダーゼ
