バーギー細菌分類学マニュアル

バーギー細菌分類学マニュアルは、原核生物の同定、特に細菌種の同定において、あらゆる特徴的な側面を用いて行う主要な資料である。

このマニュアルは、バーギーの細菌分類マニュアルの後に出版されたものですが、後者は未知細菌の同定ガイドとして今も出版されています。^{[ 1 ]} 1923年にデイビッド・ヘンドリックス・バーギーによって初めて出版されたこのマニュアルは、細菌を構造的および機能的属性に基づいて分類し、特定の科に分類するために使用されます。しかし、このプロセスは近年、より経験的なものになっています。 ^{[ 2 ]}

『細菌と古細菌の分類概要』は、マニュアル第2版から分類群名を索引化した派生出版物です。^{[ 3 ]} 2018年9月までは、Bergey's Manual Trustのウェブサイトから無料で入手できました。^{[ 4 ]}ミシガン州立大学は、NamesforLifeの記録を索引化した代替バージョンを提供しています。^{[ 5 ]}

全5巻からなるBMSBは、2015年以降、継続的に更新されるオンライン書籍であるBergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria （BMSAB）に正式に置き換えられた。 ^{[ 6 ]}

巻セットの名称が「系統細菌学」に変更されたのは1980年の新契約によるもので、この新スタイルには「生物間の関係」が含まれ、全体的に「範囲が拡大」された。この新スタイルは、1984年に刊行が開始された4巻セット^{[ 7 ]}に採用された。各巻の情報は以下のように分類されている。

第 1 巻には、「医学的および産業的に重要」とみなされるすべてのタイプのグラム陰性細菌に関する情報が含まれていました。第 2 巻には、すべてのタイプのグラム陽性細菌に関する情報が含まれていました。第 3 巻では、残りのわずかに異なるすべてのグラム陰性細菌と古細菌を扱っています。第 4 巻には、糸状放線菌およびその他の類似の細菌に関する情報が含まれています。^{[ 8 ]}

現在の巻は、以前の巻とは大きく異なり、多くの上位分類群は表現型ではなく、プロテオバクテリア内の綱のように、16S系統発生のみに基づいて定義されています。^{[ 9 ]}

現在のグループ分けは以下のとおりです。

• 第1巻（2001年）：古細菌と深く分岐した光合成細菌^{[ 10 ]}
• 第2巻（2005年）：プロテオバクテリア―3冊に分かれています。
  • 2A: 入門エッセイ^{[ 9 ]}
  • 2B:ガンマプロテオバクテリア^{[ 11 ]}
  • 2C: プロテオバクテリアのその他のクラス^{[ 12 ]}
• 第3巻（2009年）：フィルミクテス門^{[ 13 ]}
• 第 4 巻 (2011 年):バクテロイデテス、スピロヘータ、テネリクテス(モリクテス)、アシドバクテリア、フィブロバクテレス、フソバクテリア、ディクチョグロミ、ジェマティモナデテス、レンズファエラエ、疣贅菌、クラミジア、およびプランクトミセテス^{[ 14 ]}
• 第5巻（2部構成）（2012年）：放線菌^{[ 15 ]}

バーギー・マニュアル・トラストは、バーギー細菌分類マニュアルとその関連参考書の出版を支援するために1936年に設立されました。また、同トラストは、細菌分類学に多大な貢献をした個人を表彰するため、バーギー賞とバーギー・メダルを授与しています。これらの賞は、トラストとマニュアルの出版社であるシュプリンガー社からの資金援助によって共同で運営されています。

Bergey's Manual TrustとJohn Wiley & Sons, Inc.は、オンライン百科事典Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB)を共同出版しています。2019年、Trustは、ゲノム分類データベース(GTDB)が提供する分類を使用して、BMSABに系統ゲノム学を含めることを決定しました。^{[ 16 ]}

『内科学年報』は、これらの巻を「明快に書かれ、正確で読みやすい」ものであり、「特に分類学に興味のある人向けに設計されている」と評した。^{[ 17 ]}

• バーギーズ・マニュアル・トラストのホームページ
• バーギーのマニュアルによる識別フローチャート
• 書籍情報