アルカリハロバチルス・アルカロフィルス

アルカリハロバチルス・アルカロフィルス
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	バシロタ
クラス：	バチルス
注文：	ナデシコ目
家族：	バチルス科
属:	アルカリハロバチルス
種：	A.アルカロフィルス
二名法名
	アルカリハロバチルス・アルカロフィルス; (ヴェダー、1934) パテル & グプタ 2020

アルカリハロバチルス・アルカロフィルス（旧称バチルス・アルカロフィルス）は、グラム陽性の桿菌の一種です。この種の菌株は、高アルカリ性の廃水から分離されています。A .アルカロフィルスは、土壌や動物の糞尿から分離され、40℃、pH9～10.5（おそらくそれ以上）で生育する中程度の耐塩性を持つ偏性好アルカリ菌です。^[1]^[2]

この種は、バチルス属の多系統性を解明するための系統ゲノム研究の結果、2020年にアルカリハロバチルス属に移されました。^[3]

ゲノム

A. alcalophilus 株AV1934のドラフトゲノムは4,348,660 bp で、3,745 個の予測タンパク質が含まれています。ゲノムの G+C 含有量は 37.2% です。別のドラフトゲノムには 4,095 個の予測遺伝子と 4,063 個の予測タンパク質が含まれています。^[4]

参考文献

^ Ntougias, S; Zervakis, GI; Ehaliotis, C; Kavroulakis, N; Papadopoulou, KK (2006 年 5 月)。「アルカリ性 2 相オリーブ工場廃棄物から分離された細菌の生態生理学と分子系統学」。微生物学研究。157 (4): 376–85。doi : 10.1016/ j.resmic.2005.09.010。PMID 16307869。
^ Lewis, RJ; Kaback, E.; Krulwich, TA (1982). 「Bacillus alcalophilus の非アルカリ性変異の多面的特性」.微生物学. 128 (2): 427–430. doi : 10.1099/00221287-128-2-427 .
^ Patel, Sudip; Gupta, Radhey S. (2020-01-01). 「バチルス属の多系統性を解明するための系統ゲノムと比較ゲノムの枠組み：バチルス属の6つの新属、Peribacillus gen. nov.、Cytobacillus gen. nov.、Mesobacillus gen. nov.、Neobacillus gen. nov.、Metabacillus gen. nov.、およびAlkalihalobacillus gen. novの提案」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (1): 406–438. doi : 10.1099/ijsem.0.003775 . ISSN 1466-5026.
^ アティ O、ジャヤプラカシュ A、シャー H、ポールセン IT、森野 M、高橋 Y、鳴海 I、サチダナンダム R、佐藤 K、伊藤 M、クルルウィッチ TA (2014)。「1934年にヒトの糞便から分離された古典的なアルカリ性物質であるバチルス・アルカロフィラスAV1934のゲノム配列草案」。ゲノム発表。2 (6)。土井：10.1128/genomeA.01175-14。PMC 4241669。PMID 25395643。

さらに読む

Liu, Yihan; Zhang, Tao; Zhang, Zhimeng; Sun, Tongyi; Wang, Jianling; Lu, Fuping (2014). 「指向性進化による Bacillus alcalophilus アルカリプロテアーゼの低温適応性の向上」。Journal of Molecular Catalysis B: Enzymatic。106 : 117–123。doi : 10.1016/ j.molcatb.2014.05.005。

外部リンク

BacDive の Bacillus alcalophilus のタイプ株 - 細菌多様性メタデータ

[1] Ntougias, S; Zervakis, GI; Ehaliotis, C; Kavroulakis, N; Papadopoulou, KK (2006 年 5 月)。「アルカリ性 2 相オリーブ工場廃棄物から分離された細菌の生態生理学と分子系統学」。微生物学研究。157 (4): 376–85。doi : 10.1016/ j.resmic.2005.09.010。PMID 16307869。

[2] Lewis, RJ; Kaback, E.; Krulwich, TA (1982). 「Bacillus alcalophilus の非アルカリ性変異の多面的特性」.微生物学. 128 (2): 427–430. doi : 10.1099/00221287-128-2-427 .

[3] Patel, Sudip; Gupta, Radhey S. (2020-01-01). 「バチルス属の多系統性を解明するための系統ゲノムと比較ゲノムの枠組み：バチルス属の6つの新属、Peribacillus gen. nov.、Cytobacillus gen. nov.、Mesobacillus gen. nov.、Neobacillus gen. nov.、Metabacillus gen. nov.、およびAlkalihalobacillus gen. novの提案」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (1): 406–438. doi : 10.1099/ijsem.0.003775 . ISSN 1466-5026.

[pmid25395643-4] アティ O、ジャヤプラカシュ A、シャー H、ポールセン IT、森野 M、高橋 Y、鳴海 I、サチダナンダム R、佐藤 K、伊藤 M、クルルウィッチ TA (2014)。「1934年にヒトの糞便から分離された古典的なアルカリ性物質であるバチルス・アルカロフィラスAV1934のゲノム配列草案」。ゲノム発表。2 (6)。土井：10.1128/genomeA.01175-14。PMC 4241669。PMID 25395643。