アポトーシス阻害ドメイン

利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要
ＰＤＢ	1c9q 、1e31 、1f3h 、1f9x 、1g3f 、1g73 、1i3o 、1jd4 、1jd5 、1jd6 、1m4m 、1nw9 、1oxn 、1oxq 、1oy7 、1q4q 、1qbh 、1sdz 、1se0 、1tfq 、1tft 、1tw6 、1xb0 、1xb1 、1xox 、2i3h 、2i3i

アポトーシス阻害ドメイン
アポトーシス阻害ドメイン
	ヒトBIRC2タンパク質のBIRドメインのNMR溶液構造。タンパク質は虹色の漫画図（N末端＝青、C末端＝赤）で表され、配位亜鉛は灰色の球で表されます。
識別子
シンボル	ビル
パム	PF00653
インタープロ	著作権
プロサイト	PS50143
SCOP2	1qbh / スコープ / SUPFAM
パム
利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要
ＰＤＢ	1c9q 、1e31 、1f3h 、1f9x 、1g3f 、1g73 、1i3o 、1jd4 、1jd5 、1jd6 、1m4m 、1nw9 、1oxn 、1oxq 、1oy7 、1q4q 、1qbh 、1sdz 、1se0 、1tfq 、1tft 、1tw6 、1xb0 、1xb1 、1xox 、2i3h 、2i3i

アポトーシス阻害ドメインは、IAPリピート、B aculovirus I nhibitor of apoptosis protein Repeat、またはBIRとも呼ばれ、アポトーシス、サイトカイン産生、染色体分離に関与するタンパク質に見られる構造モチーフです。^{[2] BIRを含むタンパク質は、}アポトーシス阻害タンパク質（IAP）またはBIR含有タンパク質（BIRPまたはBIRC）として知られ、BIRC1（ NAIP）、BIRC2（cIAP1）、BIRC3（cIAP2）、BIRC4（xIAP）、BIRC5（survivin）、BIRC6が含まれます。^[2]^[3]

BIRドメインはジンクフィンガードメインファミリーに属し、亜鉛イオンを配位する3つの保存されたシステインと1つの保存されたヒスチジンを含む、不変のアミノ酸残基を多数持つのが特徴です。^{[4]通常、4〜5個の}アルファヘリックスと3本鎖のベータシートで構成されています。

外部リンク

真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_BIR_II_1
真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_BIR_III_1
真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_BIR_III_2
真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_BIR_III_3
真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_BIR_III_4

参考文献

^ PDB : 1QBH ; Hinds MG、Norton RS、Vaux DL、Day CL (1999年7月)。「バキュロウイルスアポトーシス阻害剤(IAP)リピートの溶液構造」。Nat . Struct. Biol . 6 (7): 648–51. doi :10.1038/10701. PMID 10404221. S2CID 3194182.
^ ab Silke J、Vaux DL (2001 年 5 月)。「2 種類の BIR 含有タンパク質 - アポトーシスの阻害剤、または有糸分裂に必要」。J . Cell Sci . 114 (Pt 10): 1821–7。doi : 10.1242 /jcs.114.10.1821。PMID 11329368 。
^ Verhagen AM、Coulson EJ、Vaux DL (2001)。「アポトーシス阻害タンパク質とその関連物質：IAPとその他のBIRP」。Genome Biol . 2 (7): REVIEWS3009. doi : 10.1186/gb-2001-2-7-reviews3009 . PMC 139420. PMID 11516343 .
^ Birnbaum MJ、Clem RJ、Miller LK (1994 年 4 月)。「Cys/His 配列モチーフを持つポリペプチドをコードする核多角体病ウイルス由来のアポトーシス阻害遺伝子」。J . Virol . 68 (4): 2521–8. doi :10.1128/JVI.68.4.2521-2528.1994. PMC 236730. PMID 8139034 。

この記事にはパブリックドメインのPfamおよびInterPro : IPR001370からのテキストが組み込まれています。

[pmid10404221-1] PDB : 1QBH ; Hinds MG、Norton RS、Vaux DL、Day CL (1999年7月)。「バキュロウイルスアポトーシス阻害剤(IAP)リピートの溶液構造」。Nat . Struct. Biol . 6 (7): 648–51. doi :10.1038/10701. PMID 10404221. S2CID 3194182.

[pmid11329368-2] Silke J、Vaux DL (2001 年 5 月)。「2 種類の BIR 含有タンパク質 - アポトーシスの阻害剤、または有糸分裂に必要」。J . Cell Sci . 114 (Pt 10): 1821–7。doi : 10.1242 /jcs.114.10.1821。PMID 11329368 。

[pmid11516343-3] Verhagen AM、Coulson EJ、Vaux DL (2001)。「アポトーシス阻害タンパク質とその関連物質：IAPとその他のBIRP」。Genome Biol . 2 (7): REVIEWS3009. doi : 10.1186/gb-2001-2-7-reviews3009 . PMC 139420. PMID 11516343 .

[pmid8139034-4] Birnbaum MJ、Clem RJ、Miller LK (1994 年 4 月)。「Cys/His 配列モチーフを持つポリペプチドをコードする核多角体病ウイルス由来のアポトーシス阻害遺伝子」。J . Virol . 68 (4): 2521–8. doi :10.1128/JVI.68.4.2521-2528.1994. PMC 236730. PMID 8139034 。