分析プロファイルインデックス

分析プロファイルインデックス（API ）は、生化学検査に基づく細菌の分類システムです。このシステムは、臨床上重要な細菌の特定を迅速化するために開発されました。インデックスから既知の種を特定する場合にのみ使用できます。^[1]取得されるデータは表現型特性です。多座位配列タイピングや全ゲノム配列決定などのDNA配列ベースの方法は、細菌種や株の特定にますます使用されています。これらの新しい方法は、臨床現場でのAPI検査の使用を補完したり、置き換えたりするために使用できます。

分析プロファイルインデックス（API）は、1970年代に米国のAnalytab Products Inc.のPierre Janinによって発明されました。 ^[2] APIテストシステムは現在、bioMérieuxによって製造されています。^[3] APIシリーズは、実行が複雑で読み取りが難しいと考えられていた既存の技術を標準化し、小型化したバージョンを導入しました。

同定は微生物学的培養によってのみ可能である。API 試験紙は、通常、接種された微生物による炭水化物の発酵またはタンパク質やアミノ酸の異化に関連する酵素活性を検出するために、酸化還元基質、電気発生基質、発光基質などの脱水基質を含むウェルから構成される。細菌懸濁液を使用して各ウェルを再水和し、試験紙を培養する。培養中、代謝によって色の変化が生じるが、これは自然に生じるか、試薬を追加することで明らかになる。たとえば、炭水化物が発酵すると、ウェル内のpH が低下し、pH 指示薬の色の変化によってそれが示される。すべての試験結果がまとめられてプロファイル番号が取得され、その後、市販のコードブック (またはオンライン) のプロファイル番号と比較され、細菌種の同定が決定される。^[4]

検査を始める前に、培養した細菌が腸内細菌科細菌であることを確認する必要があります。これは、シトクロムコキシダーゼの迅速酸化酵素検査によって行われます。腸内細菌科細菌は通常、酸化酵素陰性です。つまり、電子伝達系で酸素を電子受容体として使用しないか、電子を酸素に伝達するために別のシトクロム酵素を使用します。^[5]培養物が酸化酵素陽性と判定された場合、細菌種を正しく識別するために別の検査を実施する必要があります。API-20Eは、グラム陰性細菌科腸内細菌科のメンバーを区別することに特化しています。^{[6] [7]}別のAPIシステムであるAPI-Staphは、ブドウ球菌属、ミクロコッカス属、および関連生物を含むグラム陽性細菌に特化しています。^[7]

API 20E/NEシステムは、グラム陰性細菌を迅速に識別するために設計された、広く使用されている生化学検査システムです。具体的には、腸内細菌科 (API 20E) と非腸内細菌科 (API 20NE) の 2 つのグループを対象としています。このシステムは、生化学的活性に基づいて細菌を識別する臨床微生物学および環境研究で特に役立ちます。

• テスト ストリップ:このシステムは、それぞれ異なる脱水基質を含む 20 個の小さな反応チューブ (マイクロチューブ) を含むプラスチック ストリップで構成されています。
• 再水和と接種:テストを実行するには、マイクロチューブを細菌懸濁液で再水和します。各マイクロチューブは、テスト対象の細菌に特有の酵素活性または炭水化物発酵を検出するように設計されています。
• インキュベーション:接種後、ストリップは一定期間、通常は 18 ～ 24 時間、指定された温度 (多くの場合 35 ～ 37°C) でインキュベートされます。インキュベーション中、細菌は基質と相互作用し、反応が起こると目に見える色の変化が生じます。
• 結果の読み取り:培養後、各チューブの色の変化を観察して結果を解釈します。色の変化は陽性または陰性の反応を示します。反応のパターンを参照データベースと比較し、微生物を特定します。
• 識別:各反応は数値でスコア付けされ、累積スコアがプロファイル番号を形成します。このプロファイル番号は、データベースまたは識別ソフトウェアを通じて生物を識別するために使用されます。

• 米国特許庁、特許番号3936356 [1]
• APIシステム：腸内細菌科の同定のためのマルチチューブマイクロメソッド、PBスミス、KMトムフォールデ、DLローデン、A.バロウズ疾病管理センター、ジョージア州アトランタ30333 [2]