ユートピア文書

Utopia Documentsは、Utopiaツールセットの一部である、セマンティックで科学的なWeb対応PDFリーダーです。Utopia Documentsは無料でダウンロードできます。^{[1] [2] [3] [4] [5]}

Utopiaは、Webリソースとメタデータへのリンクを提供します。^[6] UtopiaはPDFリーダーですが、通常は静的なPDFを完全にWeb対応にすることで（ユーザーがオンラインである限り）、HTMLコンテンツとのWeb接続のギャップを埋めます。

2014 年 6 月 2 日以降、Utopia Documents はライセンスを変更し、GPLv3 に基づく オープン ソースになりました。

Utopia Documents v. 3.1 は、Microsoft Windows (XP、Vista、Windows 7)、Mac ( OS X 10.6 (Snow Leopard) 以上)、Linux (ベータ版) で利用できます。

Utopia Documents は、 Adobe Acrobat Reader や Mac の Preview アプリケーションなど、他のPDFリーダーと同じように使用できます。アプリケーションのワークスペースは 3 つのメイン ペインに分かれています (折りたたむことができます)。左側には PDF ファイル自体が表示され、下部には「ページャ」が表示され、右側にはサイドバーが表示されます。ページャを使用すると、ドキュメントを前後にスキャンしたり、ページ間をすばやく移動したりできます。Utopia Documents はあらゆる PDF ファイルの表示に使用できますが、このソフトウェアは生物医学および生化学分野の学術論文のリーダーとして真価を発揮します。

• Windows、Mac、Linux で利用可能な無料の PDF リーダー (ベータ版)
• 文書がレンダリングされるときにその内容の固有の「指紋」を作成することで文書を認識し、機関リポジトリに保存された原稿バージョンであっても、それを記事の任意のバージョンに関連付けます。
• フィンガープリントは、とりわけ重要な印刷特性および書誌特性（著者、図、参考文献など）に基づいて作成されます。PDF は、「印刷された資料のデジタル複製から関連知識への入り口へと変換され、研究コミュニティに分析ツール、外部リソース、文献への集中的なインタラクティブ アクセスを提供します」
• ハイライトされたテキストからさまざまなデータソース、科学情報、検索ツールへの直接リンク
• 記事の影響力の指標（例：altmetrics）が利用可能な場合は含まれ、読者が記事データを閲覧できるようにします。
• 研究者が非公開コメントを投稿したり、論文について公開討論したりできるコメント機能
• 表をスプレッドシートにエクスポートし、数値表を散布図に変換する「トグル」
• 生命科学、生物医学、生化学の科学分野に最適化
• 外部サービスに依存しており、インターフェースに表示されるプラグインを介してアクセスされ、データの処理と分析のための「セマンティック コア」によって仲介されます。

Utopia Documents では次のデータ ソースにアクセスし、表示する関連コンテンツがあるたびに自動的にアクティブ化されます。

• アルトメトリック
• 知識
• クロスレフ
• ドライアド（リポジトリ）
• GPCRD Gタンパク質共役受容体も参照
• メンデレー
• 核RDB
• 出版元
• 反映する
• 王立化学協会
• サイバイト
• セマンティック生化学ジャーナル
• シェルパ/ロメオ