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 ヒト胎盤コラーゲンIVの非コラーゲン（NC1）ドメインの1.9-A結晶構造は、新しいタイプの共有結合性メトキシリン架橋による安定化を示している。 | |||||||||
| 識別子 | |||||||||
| シンボル | C4 | ||||||||
| パム | PF01413 | ||||||||
| ファム一族 | CL0056 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| 頭いい | C4 | ||||||||
| プロサイト | PDOC00031 | ||||||||
| メロプス | C47 | ||||||||
| SCOP2 | 1hra / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 2.A.16 | ||||||||
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分子生物学では、IV型コラーゲンC4ドメイン（またはIV型コラーゲンNC1ドメイン）は、IV型コラーゲンのC末端に存在する重複ドメインです。各IV型コラーゲンには、N末端に25アミノ酸の短い7Sドメイン、C末端に約230アミノ酸の球状非コラーゲンC4ドメインが隣接する長い三重らせんコラーゲンドメインが含まれています。プロトマーアセンブリでは、3つの鎖のC4ドメインが相互作用してC4トリマーを形成し、三重らせん形成のために鎖を選択して登録します。ネットワークアセンブリでは、2つのプロトマーのC4トリマーが相互作用してC4ヘキサマー構造を形成し、プロトマーを選択して接続します。[1] [2] [3]
コラーゲン IV C4 ドメインには 12 個のシステインが含まれており、それらはすべてジスルフィド結合に関与しています。主にベータ鎖からなる三次構造に折り畳まれます。コラーゲン IV C4 ドメインは、C1-C6、C2-C5、および C3-C4 のペアを含む 3 つの鎖内ジスルフィド結合によって安定化された、同様に折り畳まれた 2 つのサブドメインで構成されています。各サブドメインは、コンパクトなジスルフィド安定化三角形構造を表し、そこから指のようなヘアピンループが、同じサブドメインまたはサブドメインをしっかりと締め付ける隣接鎖の不完全な6 鎖ベータシートに突出しています。 [1] [2] [3]
参考文献
- ^ ab Than ME、Henrich S、Huber R、Ries A、Mann K、Kuhn K、Timpl R、Bourenkov GP、Bartunik HD、Bode W (2002 年 5 月)。「ヒト胎盤コラーゲン IV の非コラーゲン (NC1) ドメインの 1.9-A 結晶構造は、新しいタイプの共有 Met-Lys 架橋による安定化を示している」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (10): 6607–12. doi : 10.1073/pnas.062183499 . PMC 124450 . PMID 12011424。
- ^ ab Sundaramoorthy M、Meiyappan M、Todd P、Hudson BG (2002 年 8 月)。「NC1 ドメインの結晶構造。基底膜における IV 型コラーゲンの集合の構造的基礎」。J . Biol. Chem . 277 (34): 31142–53. doi : 10.1074/jbc.M201740200 . PMID 11970952。
- ^ ab Vanacore RM、Shanmugasundararaj S、Friedman DB、Bondar O、Hudson BG、Sundaramoorthy M (2004 年 10 月)。「コラーゲン IV の alpha1.alpha2 ネットワーク。非共有結合力と Met-Lys 架橋の欠如による非コラーゲン性ドメイン 1 の強化された安定化」。J . Biol. Chem . 279 ( 43): 44723–30。doi : 10.1074 /jbc.M406344200。PMID 15299013。