Loading article…
ターゲット2035は、2035年までにヒトプロテオーム中のあらゆるタンパク質に対するオープンサイエンスの薬理学的調節因子を発見するための世界的な取り組みまたは運動です。 [1] [2] [3] この取り組みは、この運動が有機的に発展することを目的として、構造ゲノミクスコンソーシアムが主導しています。ターゲット2035は、タンパク質標的の治療可能性を高めたり、優先順位を下げたりすることに化学プローブが成功したことから生まれました。オープンアクセスの薬理学的ツールが利用できることは、特にダークプロテオームに対する創薬において、ほとんど満たされていない側面です。
最初の 5 年間は、特定のタンパク質またはタンパク質ファミリーの薬理学的ツールを発見するという同じ目標を持つ研究者が協力者を見つけ、それをオープン アクセス (知的財産による制約なし) にできるようにするメカニズムの構築 (以下のフェーズ 1) が含まれます。戦略目標の 1 つは、医薬品を公平に、手頃な価格で、迅速にベッドサイドに届けることを目指して、創薬パイプラインのコンポーネントに関する新しいオープン サイエンス プログラムを育成することです。 [4]フェーズ 1 では、ヒット ファインディングと特性評価における新しい (再) 出現の実現技術を歓迎するフレームワークも構築します。[5] [6] [7] [8]進捗状況に関する最新情報が公開されました。[9]
ターゲット2035は、国立衛生研究所（NIH）の未調査のキナーゼ、 GPCR、イオンチャネルを対象とした創薬可能なゲノムの解明イニシアチブ、ヒトSLCに関する革新的医薬品イニシアチブのRESOLUTEプロジェクト、革新的医薬品イニシアチブのオープンな生物学の実現と解放（EUbOPEN）、革新的医薬品イニシアチブの研究の進歩と創薬のためのターゲットの無制限の活用など、過去および現在の公的資金によるプログラムの成功を活用します。NIHは最近、再現不可能なデータによる数百億ドルの損失を軽減するために、データをオープンにするという約束を改めて表明しました。[10]
ターゲット2035は、化学プローブポータルやオープンサイエンスプラットフォーム（Just One Giant Labなど）と連携し、化学修飾子[11] [12] [13]のベストプラクティスとオープンサイエンスの利点についての認識と教育を広めます。
以下の計画案は白書に概説されている。[14]
フェーズ1
2020年から2025年までの第1フェーズは、協調的な世界的取り組みの基盤を構築するように構成され、現在の創薬可能なゲノム（約4,000種類のタンパク質）内のすべてのタンパク質ファミリーの主要な代表物質について、既存の薬理学的モジュレーターを収集、特徴付け、利用できるようにすること、および世界中の科学コミュニティーの原動力となるデータの収集、整理、普及、マイニングを促進するための重要かつ集中的なインフラストラクチャーを開発することを目指します。このフェーズでは、定量的なゲノム規模の生化学および細胞ベースのプロファイリングアッセイを連合コミュニティーに提供し、創薬可能性の定義を拡張する新技術の開発を調整するための集中施設も構築される可能性があります。この第1フェーズでは、キナーゼやエピジェネティクスファミリーなどの優先遺伝子ファミリーを網羅する化学ツールやケモゲノミクスライブラリを作成するための進行中の取り組みを補完し、拡張します。
ターゲット2035の開始から1年が経過し、これまでに文献で報告されているケモゲノミクス化合物に関するデータを収容するためのインフラストラクチャが整備されてきました。進捗状況のアップデートが最近公開されました。[15]新しい技術の開発に向けて、ターゲット2035は、ヒットファインディングの計算方法のベンチマークを目的とした新しいイニシアチブである計算ヒットファインディング実験の批判的評価（CACHE）を開始しました。[8]最初のコンペティション（LRRK2のWD40ドメインのリガンドの発見）は、2022年3月に開始されました。第1ラウンドの予測が提出されました。その間に、2回目のCACHEベンチマーク（Nsp13のRNA結合ドメインのリガンドの予測）の申請が掲載されました。
フェーズ2
2025年から2035年までの第2段階では、ゲノムにコード化された約20,000のタンパク質の90%以上に対する薬理学的モジュレーターの完全なセットを生成するために、新しいテクノロジーとインフラストラクチャを適用します。「ターゲット2035」は野心的に聞こえますが、そのコンセプトと実用性は、以下の成功パラメータを明らかにした多数のパイロットスタディに基づいて確固たる基盤の上に成り立っています。
- 製薬業界と連携して、比類のない専門知識、経験、資材、物流にアクセスします。
- 出力（ターゲット化学ツールプロファイル）の明確で定量的な品質基準を確立し、焦点を当てる
- プロジェクトをタンパク質ファミリーを中心に組織化する - これは、この大規模なプロジェクトをチームに分割する最も効率的で実用的かつ科学的に健全な方法です。
- 利益相反を排除または軽減し、法的負担を軽減し、コミュニティの参加を促進するために、明確なオープンサイエンスの原則を確立します。
参考文献
- ^ Carter AJ、Kraemer O、Zwick M、Mueller-Fahrnow A、Arrowsmith CH 、 Edwards AM（2019年11月） 。「ターゲット2035：ヒトプロテオームの調査」。Drug Discovery Today。24（11）：2111–2115。doi ：10.1016 /j.drudis.2019.06.020。PMID 31278990。
- ^ Mullard A (2019年9月). 「あらゆるタンパク質のためのプローブ」. Nature Reviews. Drug Discovery . 18 (10): 733–736. doi :10.1038/d41573-019-00159-9. PMID 31570852.
- ^ Lowe D (2019年9月20日). 「Probes For Everything」. Science . 2021年4月22日閲覧。
- ^ Rubinstein YR、Robinson PN、Gahl WA、Avillach P、Baynam G、Cederroth H、他。 （2020年10月）。 「オープンサイエンスの事例：希少疾患」。ジャミアオープン。3 (3): 472–486。土井：10.1093/jamiaopen/ooaa030。PMC 7660964。PMID 33426479。
- ^ Fleming N (2018年5月). 「人工知能は創薬をどのように変えるのか」. Nature . 557 (7707): S55–S57. doi : 10.1038/d41586-018-05267-x . PMID 29849160.
- ^ Savage N (2021-05-27). 「AIの創薬ポテンシャルを活用する」Biopharma Dealmakers . doi : 10.1038/d43747-021-00045-7 . ISSN 2730-6275.
- ^ Satz AL、Kuai L、 Peng X（2021年5月）。「酵素および細胞標的に対するDNAエンコード化学ライブラリーの選択とスクリーニング」。Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters。39：127851。doi ： 10.1016 /j.bmcl.2021.127851。PMID 33631371。
- ^ ab Ackloo S, Al-awar R, Amaro RE, Arrowsmith CH, Azevedo H, Batey RA, et al. (2022-02-15). 「CACHE (Critical Assessment of Computational Hit-finding Experiments): A public-private partners benchmarking initiative to enable the development of computing methods for hit-finding」. Nature Reviews Chemistry : 1–9. doi : 10.1038/s41570-022-00363-z . ISSN 2397-3358. PMC 9246350 .
- ^ Müller S, Ackloo S, Al Chawaf A, Al-Lazikani B, Antolin A, Baell JB, et al. (2022年1月). 「Target 2035 - update on the quest for a probe for every protein」. RSC Medicinal Chemistry . 13 (1): 13–21. doi :10.1039/D1MD00228G. PMC 8792830. PMID 35211674 .
- ^ Kozlov M (2022年2月). 「NIHが地震に関する命令を発行：データを公開する」. Nature . 602 (7898): 558–559. doi : 10.1038/d41586-022-00402-1 . PMID 35173323.
- ^ 「化学プローブの検証に関するベストプラクティス」。
- ^ 「生物学的発見に不可欠なツールとしての化学プローブ」CellPress Webninar。
- ^ Quinlan RB、Brennan PE（2021 年6月）。「創薬のためのケモゲノミクス：オープンアクセス化学プローブからの臨床分子」。RSC化学 生物学。2 （3）：759–795。doi ：10.1039 / D1CB00016K。PMC 8341094。PMID 34458810。
- ^ 「ターゲット2035 – 全てのヒトタンパク質に対する薬理学的調節因子」（PDF）。target2035.net 。
- ^ Müller S, Ackloo S, Al Chawaf A, Al-Lazikani B, Antolin A, Baell JB, et al. (2022年1月). 「Target 2035 - update on the quest for a probe for every protein」. RSC Medicinal Chemistry . 13 (1): 13–21. doi : 10.1039/D1MD00228G . PMID 35211674.
外部リンク
- 公式サイト