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| ソルターゼA | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 3.4.22.70 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | BRENDAエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZyme ビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイク | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
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ソルターゼA（EC 3.4.22.70、SrtA、SrtAタンパク質、SrtAソルターゼ）は酵素です。[1] [2] [3]この酵素は細胞壁選別反応を触媒し、LPXTGモチーフを含む選別シグナルを持つ表面タンパク質がThrとGly残基の間で切断されます。
この酵素はペプチダーゼファミリー C60 に属します。
構造
ソルターゼAは、β7-β8鎖によって形成された疎水性溝を持つ8本鎖βバレルフォールドを有する。この溝は、β3-β4、β2-β3、β6-β7、およびβ7-β8ループに囲まれている。触媒システイン残基はこの溝に存在し、その後求核剤の結合を受け入れる。β3-β4ループにはカルシウム結合部位があり、β6-β7ループの残基に配位してカルシウムを結合する。このような結合によりβ6-β7ループの動きが遅くなり、ソルターゼの基質が結合してその活性が8倍に増加する。[4]
タンパク質工学における使用
ソルターゼAは、タンパク質のN末端とC末端にラベルを付加して翻訳後修飾するためのin vitroツールとして広く使用されています。これらのラベルには、ビオチン、蛍光体、架橋剤、多機能プローブなどがあります。[5]
どちらの場合も、1 つの分子は一端に LPXTG モチーフを含むように設計され、もう 1 つの分子は他端に (Gly)n モチーフを含むように設計されます。LPXTG モチーフが切断されると、ソルターゼは設計された分子とチオエステル中間体を形成します。次に、この中間体は (Gly)n を含む分子による求核攻撃によって分解され、介在する LPXT(Gly)n モチーフを介して 2 つの分子間の融合体を形成します。
タンパク質の N 末端標識を実現するために、LPXTG モチーフは標識の C 末端に位置するように設計されます。タンパク質は N 末端 (Gly)n を持つように設計されます。同じタンパク質の C 末端標識を実現するために、LPXTG モチーフはタンパク質の C 末端に位置するように設計されます。(Gly)n 分子は、その C 末端に標識を含むように設計されます。
最後に、タンパク質の N 末端と C 末端の両方を、異なる基質特異性のソルターゼを使用して標識できます。たとえば、化膿連鎖球菌由来のソルターゼ A は、LPXTA モチーフを認識して切断し、Ala ベースの求核剤を受け入れます。この SrtA は、LPXTG モチーフも認識して切断しますが、効率は低下します。ただし、Staph. A. ソルターゼ A は LPXTA 基質を認識しないため、LPXTA 配列と直交します。
さらに、ソルターゼAはタンパク質、タンパク質ドメイン、ペプチドを部分的に作成するためにも使用されています。[6]
参考文献
- ^ Ton-That H、Liu G、Mazmanian SK、Faull KF、Schneewind O (1999 年 10 月)。「ブドウ球菌の表面タンパク質を LPXTG モチーフで切断するトランスペプチダーゼであるソルターゼの精製と特性評価」。米国科学アカデミー紀要。96 (22): 12424–9。Bibcode : 1999PNAS ... 9612424T。doi : 10.1073 / pnas.96.22.12424。PMC 22937。PMID 10535938。
- ^ Zong Y、Bice TW、Ton-That H、Schneewind O、Narayana SV (2004 年 7 月)。「Staphylococcus aureus ソルターゼ A とその基質複合体の結晶構造」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 30): 31383–9。doi : 10.1074/jbc.m401374200。PMID 15117963。
- ^ Race PR、Bentley ML、Melvin JA、Crow A、Hughes RK、Smith WD、Sessions RB、Kehoe MA、McCafferty DG、Banfield MJ (2009 年 3 月)。「Streptococcus pyogenes ソルターゼ A の結晶構造: ソルターゼ機構への影響」。The Journal of Biological Chemistry 。284 ( 11 ) : 6924–33。doi : 10.1074/jbc.m805406200。PMC 2652338。PMID 19129180 。
- ^ Suree N、Liew CK、Villareal VA、Thieu W、Fadeev EA、Clemens JJ、Jung ME、Clubb RT (2009 年 9 月)。「Staphylococcus aureus のソーターゼ基質複合体の構造は、普遍的に保存された LPXTG ソーティング シグナルが認識される仕組みを明らかにする」。The Journal of Biological Chemistry。284 ( 36 ): 24465–77。doi : 10.1074/ jbc.M109.022624。PMC 2782039。PMID 19592495。
- ^ Popp MW、Antos JM 、Ploegh HL（2009年4月）。「ソルターゼ媒介ペプチド転移による部位特異的タンパク質標識」。タンパク質科学の最新プロトコル。第15章：15.3.1～15.3.9。doi ：10.1002/0471140864.ps1503s56。PMC 5551486。PMID 19365788。
- ^ Popp MW、 Ploegh HL（2011年5月）。「ペプチド結合の形成と破壊：ソルターゼを使用したタンパク質工学」。Angewandte Chemie。50 （ 22）：5024–32。doi ：10.1002/anie.201008267。PMID 21538739 。
外部リンク
- 米国国立医学図書館の医学件名標目表(MeSH)の Sortase+A
