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SNPSTRは、 1つ以上のSNPと1つのマイクロサテライト（STR）から構成される複合遺伝子マーカーです。常染色体SNPSTRは、互いに500塩基対以内にSNPとマイクロサテライトを含み、2002年に発見されました。[1]最近では、ヒトを含む5つのモデルゲノムのすべてのSNPSTRを含むデータベースが作成されました。[2]
使用法と重要性
過去の人口動態イベントに関する集団遺伝学的推論を導き、選択の影響を検出するのに適した遺伝子マーカーへの関心は広まり、高まっています。一塩基多型 ( SNP ) とマイクロサテライト(またはショートタンデムリピート、STR) は、どちらも欠点があるにもかかわらず、人類の集団史の分析で大きな注目を集めています。そのため、これら 2 つのマーカーを組み合わせることで、より良い結論が得られる可能性があると考えられています。
参照
参考文献
- ^ Mountain JL、Knight A.、Jobin M.、Gignoux C.、Miller A.、Lin AA、Underhill PA SNPSTR：集団の歴史と突然変異のプロセスを推測するための経験的に導出され、迅速に分類された常染色体ハプロタイプ。Genome Res. 2002;12:1766-1772。
- ^ AGRAFIOTI I AND STUMPF MPH (2007)「SNPSTR: 複合マイクロサテライト-SNPマーカーのデータベース」核酸研究35(データベース号):71–75。