シムサー

openSUSE 11上の SimThyr 3.1
原作者	ヨハネス・W・ディートリッヒ、ウラ・ミッツドルフ、レナーテ・ピッカート、ルドルフ・ホーアマン、ジョン・EM・ミッドリー
開発者	ルール大学ボーフム
初回リリース	2002年（22年前） （2002年）
安定リリース	4.0.6 / 2022年4月23日; 2年前 ( 2022-04-23 )
リポジトリ	ソースフォージ.net/p/simthyr/code/HEAD/tree/
書かれた	パスカルとオブジェクトパスカル
オペレーティング·システム	macOS、Windows、Linux
プラットフォーム	PowerPC、IA-32、x86-64、ARM、 m68k（レガシーバージョンのみ）
利用可能	イギリス英語、ドイツ語（SimThyr 2.0 以前のみ）
タイプ	生理学的シミュレーションのための無料の科学 アプリケーションソフトウェア
ライセンス	BSDスタイル
Webサイト	simthyr.sourceforge.net

SimThyr は、下垂体甲状腺フィードバック制御システム用の無料の連続動的 シミュレーション プログラムです。^[1]このオープン ソースプログラムは、甲状腺恒常性の非線形モデルに基づいています。^{[2] [3] [4]}時間領域でのシミュレーションに加えて、このソフトウェアはさまざまな感度分析方法をサポートしています。シミュレーション エンジンはマルチスレッドで、複数のプロセッサ コアをサポートしています。SimThyr はGUI を提供し、時系列の視覚化、フィードバック ループの定数構造パラメータの変更(特定の疾患のシミュレーションなど)、パラメータ セットのXMLファイル (ソフトウェアでは「シナリオ」と呼ばれます) としての保存、統計ソフトウェアに適したさまざまな形式でのシミュレーション結果のエクスポートが可能です。SimThyr は、教育目的とin-silico研究の両方を目的としています。^{[4] [5]}

甲状腺恒常性の基本モデルは、ミカエリス・メンテンの速度論、非競合的阻害、経験的に正当化された速度論的パラメータなど、基本的な生化学的、生理学的、薬理学的原理に基づいています。^{[1]このモデルは、健康な対照群と、}甲状腺機能低下症および甲状腺中毒症の患者コホートで検証されています。^[6]

複数の研究で、甲状腺機能の制御に関するin silico研究にSimThyrが使用されています。^{[7] [8]}

オリジナル版は、脈動性 TSH放出の生成に関する仮説を検証するために開発されました。^[9]その後のソフトウェアの拡張版は、視床下部-下垂体-甲状腺軸におけるTSH-T3シャントの仮説を展開するため、^{[10]甲状腺恒常性の計算パラメータ（} SPINA-GTおよびSPINA-GDを含む）の妥当性を評価するため^{[11] [12]および}非甲状腺疾患症候群につながる恒常性メカニズムを研究するために使用されました。^{[13] [14]}

SimThyrは、甲状腺刺激ホルモンの放出速度がT4以外の複数の因子によって制御されていること、また遊離T4とTSHの関係が甲状腺機能正常症、甲状腺機能低下症、甲状腺中毒症で異なる可能性があることを示すためにも使用された。^[15]

SimThyrは無料のオープンソースソフトウェアです。これによりソースコードが利用可能になり、基礎となるモデルの科学的な議論やレビューが容易になります。^{[16] [17]}さらに、無料で利用できるという事実は経済的な利益をもたらす可能性があります。^{[18] [19]}

このソフトウェアは、情報処理構造のほとんどの構造パラメータを変更できるエディタを提供します。^{[20]この機能により、甲状腺と下垂体のいくつかの機能的疾患のシミュレーションが可能になります。パラメータセットは、MIRIAMおよび}MIASE準拠のXMLファイルとして保存できます。

一方で、ユーザーインターフェースの複雑さや治療効果をモデル化する能力の欠如が批判されている。^[21]

• 視床下部-下垂体-甲状腺軸
• 甲状腺機能検査

• SimThyrプロジェクトの公式ウェブサイト
• Zenodoの厳選情報
• SciCrunchでキュレーションされた情報