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バイオインフォマティクスにおける「シュレッディング」とは、組み立てられた遺伝子配列を、通常500～750塩基対（bp）の短い配列に分解するプロセスを指します。これは一般的に、短く断片化された配列を用いて、様々な解析手法やバイオインフォマティクス技術を再適用するために行われます。また、 DNAサンプルを切断し、ゲル電気泳動にかけることで各鎖を解析し、病気の治療法を見つけるための研究にも役立てられます。
DNAを断片に切断するために最も一般的に使用されるツールまたは酵素はCAS9です。クラスター化された規則的に間隔を置いた短い回文配列（CRISPR）-Cas9は、特定の場所で遺伝物質を変更、除去、または追加することを可能にします。CRISPR-Cas9は、ガイドRNA（gRNA）と酵素（Cas9）で構成されています。この酵素は、間違いなく、目的どおりにDNAを切断することができます。CASXやCAS3など、切断に役立つ他の多くの酵素もあります。CAS3は切断ツールですが、CAS9ほど正確ではなく、ランダムなDNA鎖が削除される可能性があります。
DNA（デオキシリボ核酸）は、ロザリンド・フランクリンによって初めて発見されました。彼女は、複数のX線を撮影し、「X」字型の図を見つけることで、生物種にDNAが存在することを発見しました。しかし、彼女自身はDNAの存在以外、その詳細をほとんど知りませんでした。彼女は数年後、大量のX線被曝が原因で亡くなりました。その後、ジェームズ・ワトソンとフランシス・クリックは、ロザリンドの発見を基にさらに研究を進め、DNAの構造を解明しました。彼らは、X線分析の結果、DNAが二重らせん構造であることを初めて明らかにしたのです。
時が経つにつれ、DNA断片が発見された。研究者たちはまず、非常に単純な生物のDNAを研究した。これは、ヒトのDNA鎖が、はるかに単純な遺伝子を持つショウジョウバエのような生物に比べて非常に複雑であるためである。科学者たちは、単純な遺伝子を用いて様々な実験を行い、より複雑な遺伝子へと研究を進めていった。彼らは、特定の遺伝子を切断して、何が起こるかを観察した。
シュレッディングのプロセスは、ヒトゲノムプロジェクトの解析フェーズで何度か成功裏に使用されました。[ 1 ]ヒトゲノムプロジェクトの最初のフェーズは「ショットガンフェーズ」と呼ばれています。このフェーズでは、ヒト染色体は 1) 同じサイズの DNA セグメントに分割され、次に 2) さらに小さな DNA セグメントに細分化されます。全体的な目標は、テスト実行できるように、DNA セグメントを小さなサイズにすることです。