Rho利用サイト

Rho利用部位は、略称rutとしても知られ、細菌のRNA配列で、rho因子と呼ばれるタンパク質の結合部位として機能するターミネーター領域の上流にあります。この配列は、細菌のrho依存性DNA転写終結に必要です。rut部位の共通の特徴は、シトシンが豊富でグアニン残基が少ないことですが、これらの配列は異なる遺伝子で大きく異なり、相同性はほとんどありません。^[1]

そのようなサイトを予測するためのアルゴリズムがいくつか開発されている。^{[2] [3]}