レトロポゾン

レトロポゾンは、任意のRNA分子から逆転写された後に染色体に挿入される反復DNA断片です。

レトロポゾンとレトロトランスポゾンの違い

レトロトランスポゾンとは対照的に、レトロポゾンは逆転写酵素(RT) をコードすることはありません (ただし、下記参照)。したがって、それらは転位活性に関して非自律的要素です(トランスポゾンとは対照的です)。ヒトLINE1要素などの非長末端反復配列 (LTR) レトロトランスポゾンは、誤ってレトロポゾンと呼ばれることがあります。ただし、これは著者によって異なります。たとえば、Howard Temin は次のような定義を発表しました。レトロポゾンは RT をコードしますが、長末端反復配列(LTR) を欠いており、たとえば長散在要素(LINE) です。レトロトランスポゾンにも LTR があり、レトロウイルスはウイルス粒子 (ビリオン) としてパッケージ化されています。レトロシーケンスは RT を欠いている非自律的要素です。それらは、LINE などの自律的要素の機構の助けを借りてレトロポジションされます。例としては、短散在核要素(SINE) または mRNA 由来のレトロ (擬似) 遺伝子があります。^[2]^[3]^[4]

遺伝子重複

レトロポジションはヒトゲノムにおいて約10,000の遺伝子重複イベントを占め、そのうち約2～10%が機能的であると考えられます。^{[5]このような遺伝子は}レトロ遺伝子と呼ばれ、ある種のレトロポゾンを表します。

水平遺伝子伝達

典型的な出来事は、 c-Src遺伝子のスプライスされたpre-mRNA分子が、ラウス肉腫ウイルス（RSV）のプロウイルス祖先へ逆配置されたことである。逆配置されたc-src pre-mRNAには依然として1つのイントロンが含まれており、RSV内では現在v-Src遺伝子と呼ばれている。^[6]

参考文献

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[Makałowski_2019-4] Makałowski W、Gotea V、Pande A、Makałowska I (2019)。「転移因子：分類、同定、比較ゲノミクスのツールとしてのその使用」。Anisimova M（編）著。進化ゲノミクス。分子生物学の方法。第1910巻。クリフトン、ニュージャージー。pp. 185–86。doi ：10.1007 / 978-1-4939-9074-0_6。ISBN 978-3-8055-8341-1. OCLC 145014779. PMID 31278665.{{cite book}}: CS1 メンテナンス: 場所が見つかりません発行者 (リンク)

[Emerson2004-5] ^ Emerson JJ、Kaessmann H、 Betrán E、Long M (2004 年 1 月)。「哺乳類 X 染色体上の広範な遺伝子移動」。Science。303 ( 5657 ) : 537–40。Bibcode : 2004Sci ...303..537E。doi : 10.1126/science.1090042。PMID 14739461。S2CID 41158232 。

[6] Swanstrom, R; Parker, RC; Varmus, HE; Bishop, JM (1983 年 5 月). 「細胞性癌遺伝子の導入: ラウス肉腫ウイルスの発生」. Proceedings of the National Academy of Sciences . 80 (9): 2519–2523. Bibcode :1983PNAS...80.2519S. doi : 10.1073/pnas.80.9.2519 . PMC 393857 . PMID 6302692.

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