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遺伝学において、偽連鎖とは、相互転座のヘテロ接合体の特徴であり、転座の切断点付近に位置する遺伝子が、非相同染色体上に由来するにもかかわらず、あたかも連鎖しているかのように振る舞う現象である。
連鎖とは、染色体上の2つ以上のマーカーが近接している状態を指します。マーカー同士が近いほど、組換えによって分離される確率は低くなります。親型の子孫の頻度が組換え型の子孫の頻度を上回る場合、遺伝子は連鎖していると言われます。
転座ホモ接合体の減数分裂では、染色体はメンデルの法則に従って正常に分離します。遺伝子は交叉によって再配列されていますが、個体内の両方の半数体染色体セットは同じ再配列を持っています。その結果、すべての染色体は減数分裂時に単一のパートナーと対合し、子孫に有害な影響は生じません。
しかし、転座ヘテロ接合体では、減数分裂中の染色体分離の特定のパターンにより、遺伝的に不均衡な配偶子が生成され、受精時に接合子に有害となる。転座ヘテロ接合体では、2 つの半数体染色体セットは同じ遺伝情報の配置を持たない。その結果、第一減数分裂の前期に、転座した染色体とその正常な相同染色体は、通常の 2 個ではなく 4 個の染色体が対合して類似領域間のシナプスを最大化する十字形配置をとる。転座物質を持つ染色体を T で、遺伝子の順序が正常な染色体を N で表す。染色体 N1 と T1 は、野生型で染色体 1 に見られる相同セントロメアを持つ。 N2とT2は、野生型と同様に染色体2にセントロメアを持つ。減数分裂Iの後期には、この十字形配置で紡錘体を染色体に取り付ける機構によって、相同セントロメアの分離が通常保証され、相同染色体が反対側の紡錘体極に移動する。中期板上の4つの染色体の配置に応じて、この相同染色体の正常な分離により、2つの等しく起こりうる分離パターンのいずれかが生じる。
交互分離パターンでは、2つの転座染色体（T1とT2）が一方の極に移動し、2つの正常染色体（N1とN2）が反対側の極に移動します。この分離によって生じる2種類の配偶子（T1、T2、およびN1、N2）はいずれも正しい半数体の遺伝子数を持ち、これらの配偶子と正常配偶子との結合によって形成される接合子は生存可能です。
隣接-1分離パターンでは、相同セントロメアが分離し、T1とN2が一方の極へ、N1とT2が反対側の極へと移動します。その結果、各配偶子には、正常染色体と転座染色体の両方に存在する領域の大きな重複と、それに対応する大きな欠失（どちらの染色体にも存在しない領域）が生じ、遺伝的に不均衡になります。これらの配偶子と正常配偶子との結合によって形成された接合子は、通常生存できません。
転座ヘテロ接合体では、特異な十字型対合構造のため、相同セントロメアの不分離が測定可能な低頻度で発生する。この不分離により、隣接2分離パターンが生じ、相同セントロメアN1とT1は同じ紡錘体極に、相同セントロメアN2とT2は反対側の紡錘体極に移動する。その結果生じる遺伝的不均衡は、受精後、それらを含む接合子にとって致死的となる。
したがって、転座ヘテロ接合体では、交配において生存可能な子孫を生み出すのは交互分離パターンのみであり、同程度に起こりうる隣接1パターンとまれな隣接2パターンでは生存可能な子孫は生まれない。このため、相互転座に関与する非相同染色体上の転座切断点付近の遺伝子は擬似連鎖を示す。つまり、あたかも連鎖しているかのように振る舞うのである。