| 原ミトコンドリア | |
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| 科学的分類 | |
| ドメイン: | |
| 門: | |
| クラス: | アルファプロテオバクテリア(またはその姉妹)
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| 注文: | リケッチア目(またはヨウジディモナダル目)
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原ミトコンドリアは、好気性真核生物を創り出した共生の過程を経て、真核生物のすべてのミトコンドリアの起源となったとされる仮説上の祖先細菌の共生体です。
系統発生
現代のミトコンドリアのゲノムにまだコード化されている少数の遺伝子の系統発生解析は、真核生物の歴史の初期の共生の古代のエピソードにおいて、この内部共生生物のアルファプロテオバクテリア起源を示唆しています。
リケッチア目はミトコンドリアのアルファプロテオバクテリア姉妹群として提案されているが、[1] [2] [3]、原始ミトコンドリアが出現したアルファプロテオバクテリア群を特定する決定的な証拠はなく、特に初期のまばらなゲノムサンプルでは矛盾する証拠もある。Martijnらは、ミトコンドリアが他のすべてのアルファプロテオバクテリアの姉妹群である可能性があることを発見した。[4]リケッチア科の系統樹は、Ferlaらによって16S + 23SリボソームRNA配列の比較から推測されている。[5] Geiger et alii (2023) は、リケッチア科の姉妹群であるカウロバクテリダエ科に属する最近発見された (2016) Iodidimonas属[5]を、カルジオリピンやスフィンゴ脂質など、現在のミトコンドリアと一致する代謝産物や、COXオペロンやミトコンドリア複合体IIIに対応するbc1複合体などの重要な遺伝子マーカーをより多く持つことから、ミトコンドリアに最も近い自由生活性の近縁種とすることを提案している。[6]
代謝
ガバルドンとヒューネン(2003)は、現存するαプロテオバクテリアと真核生物のゲノムを比較することで、プロテオーム(ゲノムで表現されるタンパク質の全体セット)と原ミトコンドリアの対応する代謝を再構築しました。彼らは、この生物は宿主が提供する脂質、グリセロール、その他の化合物を呼吸する好気性αプロテオバクテリアであると結論付けました。この研究で分析された9つの真核生物ゲノムには、この生物に由来する少なくとも630の 遺伝子ファミリーがまだ含まれています。[7]
参照
参考文献
- ^ Viale, AM; Arakaki, AK (1994年3月21日). 「真核生物の細胞小器官の起源へのシャペロンのつながり」. FEBS Letters . 341 ( 2–3 ): 146– 151. Bibcode :1994FEBSL.341..146V. doi :10.1016/0014-5793(94)80446-x. PMID 7907991.
- ^ Emelyanov, Victor V (2001年7月13日). 「リケッチアとミトコンドリアの進化的関係」. FEBS Letters . 501 (1): 11– 18. Bibcode :2001FEBSL.501...11E. doi :10.1016/S0014-5793(01)02618-7. PMID 11457448.
- ^ Fitzpatrick, David A. (2006). 「ゲノム系統樹は意味のあるα-プロテオバクテリア系統樹を示し、ミトコンドリアとリケッチア類のグループ分けを裏付ける」分子生物学と進化. 23 (1): 74– 85. doi :10.1093/molbev/msj009. PMID 16151187.
- ^ マルティン、ジョラン;ヴォセバーグ、ジュリアン。ガイ、ライオネル。オフレ、ピエール。エッテマ、Thijs JG (2018)。 「サンプリングされたアルファプロテオバクテリアの外側の深部ミトコンドリア起源」。自然。557 (7703): 101–105。ビブコード:2018Natur.557..101M。土井: 10.1038/s41586-018-0059-5。ISSN 0028-0836。PMID 29695865。S2CID 13740626 。
- ^ ab Ferla, Matteo P.; Thrash, J. Cameron; Giovannoni, Stephen J.; Patrick, Wayne M. (2013). 「アルファプロテオバクテリアの新しいrRNA遺伝子に基づく系統発生は、主要なグループ、ミトコンドリアの祖先、系統発生の不安定性に関する展望を提供します」. PLOS ONE . 8 (12): e83383. Bibcode :2013PLoSO...883383F. doi : 10.1371/journal.pone.0083383 . PMC 3859672. PMID 24349502 .
- ^ Geiger, Otto; Sanchez-Flores, Alejandro; Padilla-Gomez, Jonathan; degli Esposti, Mauro (2023). 「細胞代謝の複数のアプローチがミトコンドリアの細菌祖先を定義する」. Science Advances . 9 (32): eadh0066. Bibcode :2023SciA....9H..66G. doi :10.1126/sciadv.adh0066. PMC 10411912. PMID 37556552 .
- ^ Gabaldón, Toni; Huynen, Martijn A. (2003). 「プロトミトコンドリア代謝」. Science . 301 (5633): 690. doi :10.1126/science.1085463. PMID 12893934. S2CID 28868747.
