タンパク質情報リソース

ジョージタウン大学医療センターにあるタンパク質情報リソース（PIR）は、ゲノムおよびプロテオミクス研究、および科学研究を支援する統合された公共バイオインフォマティクスリソースです。これにはタンパク質配列データベースが含まれています^{[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]}

PIRは、1984年に国立生物医学研究財団によって、研究者や顧客がタンパク質配列情報を識別および解釈するのを支援するリソースとして設立されました。それ以前に、同財団は、マーガレット・デイホフの編集の下、1964年から1974年にかけて出版された「タンパク質配列と構造のアトラス」に、最初の包括的な高分子配列コレクションをまとめました。デイホフと彼女の研究グループは、タンパク質配列の比較、遠縁の配列や配列内の重複の検出、タンパク質配列のアライメントからの進化の歴史の推論のためのコンピュータ手法の開発を先駆的に行いました。^{[ 8 ]}

ウィノナ・バーカーとロバート・レドリーは、 1983年のデイホフの死後、プロジェクトのリーダーシップを引き継いだ。1999年、キャシー・H・ウーは国立生物医学研究財団、後にジョージタウン大学医療センターに加わり、PIRのバイオインフォマティクス部門を率いることになった。彼女は当初主任研究員を務め、2001年からはディレクターを務めている。

PIRは40年以上にわたり、多くのタンパク質データベースと解析ツールを科学コミュニティに無料で提供してきました。その中には、タンパク質配列データベース（PIR-Internationalを参照）も含まれており、これはタンパク質配列と構造のアトラスから発展した、初の国際データベースです。

2002年、PIRは、国際的なパートナーである欧州バイオインフォマティクス研究所およびスイスバイオインフォマティクス研究所とともに、NIHから助成金を受け、タンパク質情報リソース-タンパク質配列データベース、 Swiss-Prot、およびTrEMBLデータベースを統合して、タンパク質配列と機能に関する単一の世界規模のデータベースであるUniProtを作成しました。 2010年現在^{PIRは、主にタンパク質アノテーションの普及と標準化を支援することを目的とした、PIRSF、 [ 9 ]} iProClass、iProLINKなどの幅広いリソースを提供しています。

Protein Ontologyは、Protein Information Resourceによって公開されたもう一つの人気データベースです。^{[ 10 ] [ 11 ]}