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| プロステコバクター | |
|---|---|
科学的分類 
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| ドメイン： | 細菌 |
| 門: | ヴェルコミクロビオタ |
| クラス： | 疣贅菌 |
| 注文： | 疣贅菌類 |
| 家族： | ヴェルコミクロビウム科 |
| 属: | プロステコバクター Staley et al. 1976 ex Staley et al. 1980 [1] |
| タイプ種 | |
| プロステコバクター・フシフォルミス Staley et al. 1976 元 Staley et al. 1980
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| 種 | |
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| 同義語 | |
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プロステコバクターは、チューブリン様遺伝子の存在という特徴を持つ、ヴェルコミクロビオタ門の細菌属です。微小管の構成要素であるチューブリンは、これまでグラシリクテス綱では観察されていませんでした。
チューブリンは長い間、真核生物に特有のものだと考えられてきました。しかし、最近では、いくつかの原核生物タンパク質がチューブリンに関連していることが示されています。[2] [3] [4] [5]
ほとんどの細菌は相同構造であるFtsZ を持っています。プロステコバクターは例外で、真核生物のチューブリンとFtsZ よりも高い配列相同性を持つ遺伝子を含んでいます。
これらの遺伝子は、バクテリアチューブリン a (BtubA) とバクテリアチューブリン b (BtubB) と呼ばれています。特性はまったく同じではありませんが、表面ループと微小管は非常によく似ています。
系統発生
現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）[1]と国立生物工学情報センター（NCBI）[6]に基づいています。
参照
参考文献
- ^ ab JP Euzéby. 「Prosthecobacter」。命名法で定められた原核生物名のリスト(LPSN) 。 2022年9月9日閲覧。
- ^ Nogales E、Downing KH、Amos LA 、 Löwe J (1998 年 6 月)。「チューブリンと FtsZは GTPase の異なるファミリーを形成する」。Nature Structural Biology。5 ( 6): 451– 8。doi : 10.1038 /nsb0698-451。PMID 9628483。S2CID 5945125。
- ^ Jenkins C, Samudrala R, Anderson I, Hedlund BP, Petroni G, Michailova N, Pinel N, Overbeek R, Rosati G, Staley JT (2002 年 12 月). 「細菌属 Prosthecobacter の細胞骨格タンパク質チューブリンの遺伝子」.米国科学アカデミー紀要. 99 (26): 17049– 54. Bibcode :2002PNAS...9917049J. doi : 10.1073/pnas.012516899 . PMC 139267. PMID 12486237 .
- ^ Yutin N、Koonin EV (2012 年 3月) 。「チューブリンの古細菌起源」。Biology Direct。7 :10。doi : 10.1186 / 1745-6150-7-10。PMC 3349469。PMID 22458654。
- ^ Larsen RA、Cusumano C、藤岡 A、Lim-Fong G、Patterson P、Pogliano J (2007 年 6 月)。「Bacillus thuringiensis のプラスミド安定性に必要な原核生物チューブリン様タンパク質 TubZ のトレッドミル運動」。 遺伝子と発達。21 ( 11 ): 1340– 52。doi :10.1101/gad.1546107。PMC 1877747。PMID 17510284。
- ^ Sayers; et al. 「Prosthecobacter」。国立生物工学情報センター(NCBI) 分類データベース。 2022年9月9日閲覧。
- ^ 「The LTP」 。 2023年11月20日閲覧。
- ^ 「LTP_all tree in newick format」。2023年11月20日閲覧。
- ^ 「LTP_08_2023 リリースノート」(PDF) 。 2023年11月20日閲覧。
- ^ 「GTDBリリース08-RS214」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
- ^ "bac120_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。