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| 開発者 | プレミアバイオソフト |
|---|---|
| 安定版リリース | 6.24
|
| オペレーティング·システム | Windows、Mac OS X |
| タイプ | バイオインフォマティクス |
| ライセンス | コマーシャル |
| Webサイト | http://www.premierbiosoft.com |
Primer Premierは、さまざまなPCRアプリケーションに使用されるバイオインフォマティクスソフトウェアです。生物間の共通形質の検出や遺伝の判定のために、関連するヌクレオチド配列セットを増幅するための縮重プライマーの設計をサポートしています。[1]
このソフトウェアは、マルチプレックスPCR反応用のタグ付きネストプライマーも設計します。[2]
Primer Premier ソフトウェアは、ヌクレオチド配列上の制限切断部位の検出に加えて、モチーフ分析とORF検索をサポートします。
このソフトウェアには、ヌクレオチド-タンパク質およびタンパク質-ヌクレオチド配列トランスレータが組み込まれており、複数のアミノ酸配列をコードするコドンの縮重プライマーを設計するために使用できます。Primer Premierによって設計されたプライマーは効果的であり、高G + C％のハウスキーピング遺伝子のプライマーを設計するための設計ガイドラインに準拠していることもわかっています。[3]
このソフトウェアは、遺伝子内の 隣接するエクソンとイントロン用のプライマーも設計しますが、Premier Biosoft Web サイトの公式 Primer Premier ページにはこれについて何も記載されていません。
このソフトウェアはヘアピン構造の安定性を計算し、 PCR増幅への影響を研究するために使用されています。[4]
競合他社
PCR 反応用のプライマーを設計するソフトウェア プログラムは他にも多数あります。以下にその一部を示します。
- 天才的な
- プライマー3 [5]
- DNASTARのSeqBuilderやPrimerSelectなどの製品
- AlleleID（Primer Premierと同じ会社が製造）
- PrimerX（部位特異的変異誘発用）
- ゲノムプライド[6]
- オリゴ
参考文献
- ^ Zhaohui S、Wenling Z、Bao Z、Rong S、Wenli M. HBV および HDV 検出のためのマイクロアレイPMID 15479617
- ^ マラリア診断におけるタグプライマーネスト/マルチプレックスPCRの感度、特異性、安定性 Guo CK、Li XM、Li JH、Mao W、Lin Z、Du JF、Huang TY。PMID 18038781
- ^ Guo YP、Huang Y. 放線菌のハウスキーピング遺伝子プライマーの設計と検証PMID 18271268
- ^ [1] [裸のURL PDF ]
- ^ 「入門書 3」。プライマー3.sourceforge.net。
- ^ Haas, Stefan A. 「GenomePRIDE - PCRプライマー設計/オリゴ設計ソフトウェア」.pride.molgen.mpg.de .
外部リンク
- プライマープレミアホームページ