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| ポドカリキシン | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| シンボル | ポッドXL | ||||||||
| パム | PF06365 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| メンブラノーム | 136 | ||||||||
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シアロ糖タンパク質であるポドカリキシンは、腎臓の糸球体（ボーマン嚢）にある足細胞の糖衣の主成分であると考えられています。 [1]これは膜貫通型シアロムチンのCD34ファミリーのメンバーです。[2]これは足細胞の二次足突起を覆います。これは負に帯電しているため、電荷反発を介して隣接する足突起を分離し、尿濾過バリアを開いた状態に保ちます。[3] この機能は、マウスのノックアウト研究によってさらに裏付けられており、足細胞の形態形成に不可欠な役割[4] [5]と、血管腔の開口と血管透過性の調節における役割を明らかにしています。[6] [7] [8]注目すべきことに、これは致死的な表現型を示すことが知られている唯一の細胞表面シアロムチンノックアウトです。[4]
ポドカリキシンも多くの癌でアップレギュレーションされており、予後不良と頻繁に関連付けられています。[5] [9] [10]ポドカリキシンは、アクチン結合タンパク質EZRとの相互作用から誘導される細胞移動と浸潤を通じて、癌の発生とその攻撃性についての理解を深めるために重要です。[11] EZR依存性シグナル伝達イベントの影響は、他の多くのシグナル障害の中でも、癌細胞の他の重要な経路の活性の増加につながる可能性があります。[1] 結腸癌細胞によって発現されるポドカリキシンのシアリル化、O-グリコシル化グリコフォームは、 L-セレクチンおよびE-セレクチン結合活性を持ち、結合の親和性が結腸癌細胞の転移の拡散に極めて重要である可能性があります。[12] [13] [14]細胞レベルでは、ポドカリキシンは頂端細胞領域の大きさとトポロジーを制御し、微絨毛形成の強力な誘導因子として作用することも示されています。[15]
ポドカリキシンはTRA-1-60としても知られ、多能性幹細胞のマーカーです。[16]
議論
ポドカリキシンには、翻訳後にいくつかの修飾イベントがあることがわかっており、おそらくまだ発見されていない。位置 144 にセリンというアミノ酸による O 結合型糖化イベントがあり、位置 193 と 395 にアスパラギンによる 2 つの N 結合型糖化イベントがある。さらに、位置 570 と 596 にセリンによるリン酸化残基がある。ポドカリキシン膜貫通タンパク質の構成は、位置 162～192 の酸性残基、位置 200～219、230～267、554～568 の多くの極性残基、および位置 590～605 の塩基性残基と酸性残基の両方を含む。[1] [17]
このタンパク質の長さは605アミノ酸で、質量は約65,076ダルトンであることがわかっています。構造は、細胞外にある33-500番目の位置と細胞質にある522-605番目の位置のトポロジカルドメインで構成されています。膜貫通ドメインは、501-521番目の位置でらせん構造になっています。[17]
このタンパク質についての理解を深め、突然変異の病理を理解することは、バイオテクノロジー企業や医療業界に多大な利益をもたらす可能性がある。また、特に癌の発症に関連するタンパク質全般に関する現在の知識を増やすことも可能である。現在、タンパク質の細胞外領域の位置97、118、124で突然変異が起こっていることが知られており、タンパク質の構造や伝達シグナルが変化し、正しい身体反応が引き起こされない可能性がある。[17]
参照
参考文献
- ^ abc Omim - ポドカリキシン様; Podxl
- ^ Nielsen JS、 McNagny KM (2008)。「CD34ファミリーの新しい機能」。Journal of Cell Science。121 ( Pt 22): 3682–3692。doi :10.1242/jcs.037507。PMID 18987355 。
- ^ Gartner, LP; Hiatt, Strum (2007).細胞生物学と組織学. Lippincott Williams and Wilkins. ISBN 978-0-7817-8577-8。
- ^ ab Doyonnas R, Kershaw DB, Duhme C, Merkens H, Chelliah S, Graf T, McNagny KM (2001). 「Cd34関連タンパク質ポドカリキシンを欠くマウスにおける無尿症、臍帯ヘルニア、および周産期致死率」J Exp Med . 194 (1): 13–27. doi :10.1084/jem.194.1.13. PMC 2193439. PMID 11435469 .
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- ^ Schopperle, WM; DeWolf, WC (2007 年 3 月)。「ヒト多能性幹細胞マーカー TRA-1-60 および TRA-1-81 は、胎児性癌のポドカリキシン上に発現している」。Stem Cells . 25 (3): 723–30. doi : 10.1634/stemcells.2005-0597 . PMID 17124010. S2CID 25224638。
- ^ abc "UniProtKB - Q9NZ53 (PDXL2_HUMAN)". 2000年。