ペルオキシソーム標的シグナル

生化学的タンパク質標的化において、ペルオキシソーム標的化シグナル（PTS）は、受容体が認識して結合するペルオキシソームタンパク質の領域である。このモチーフを含むタンパク質がペルオキシソームに局在することを指定する役割を担っている。 ^[1]

概要

すべてのペルオキシソームタンパク質は細胞質で合成され、ペルオキシソームに送られる必要があります。^[2]このプロセスの最初のステップは、タンパク質が受容体に結合することです。次に、受容体は複合体をペルオキシソームに送ります。受容体はペルオキシソーム標的シグナル（PTS）と呼ばれるペルオキシソームタンパク質の領域を認識し、結合します。

ペルオキシソームは、特定の膜に囲まれたマトリックスで構成されています。ほとんどのペルオキシソームマトリックスタンパク質には、タンパク質の端のカルボキシ末端に通常3つのアミノ酸からなる短い配列が含まれており、これがPTSとして機能します。プロトタイプの配列（多くのバリエーションが存在）は、セリン-リジン-ロイシン（1文字アミノ酸コードでは-SKL ）です。^[2]^[3]このモチーフとそのバリエーションはPTS1として知られており、受容体はPTS1受容体と呼ばれています。

PTS1受容体はPEX5 遺伝子によってコードされていることが判明しました。^[4] PEX5は折り畳まれたタンパク質をペルオキシソームに輸入し、ペルオキシソームと細胞質の間を往復します。^[2] PEX5はPex8p、10p、12p、13p、14pを含む多数の他のタンパク質と相互作用します。

いくつかのペルオキシソームマトリックスタンパク質は、アミノ末端に異なる、あまり保存されていない配列を持っています。この PTS2 シグナルは、PEX7 遺伝子によってコード化された PTS2 受容体によって認識されます。

「PEX」は、ペルオキシソーム合成に重要であると特定された遺伝子のグループを指します。PEX5 などの数値属性は、通常、最初に発見された順序を示します。

ペルオキシソーム膜に送られるタンパク質には、「mPTS」モチーフと呼ばれる明確なモチーフが使用されるが、これは定義が曖昧で、不連続なサブドメインから構成される可能性がある。^[2]これらのうちの1つは通常、マトリックスに面するタンパク質のループ（つまり、膜スパンの間）内の基本アミノ酸（アルギニンとリジン）のクラスターである。mPTS受容体はPEX19の産物である。^[2]

参考文献

^ Gould, SG; Keller, GA; Subramani, S. (1987 年 12 月)。「ホタルルシフェラーゼのカルボキシ末端におけるペルオキシソーム標的シグナルの同定 -- Gould ら 105 (6): 2923 -- The Journal of Cell Biology」。Journal of Cell Biology . 105 (6)。www.jcb.org: 2923–2931。doi : 10.1083 /jcb.105.6.2923。PMC 2114716。PMID 3480287。2008年5 月 13 日閲覧。
^ abcde ポラード、トーマス・D.; アーンショウ、ウィリアム・C.; リッピンコット・シュワルツ、ジェニファー; ジョンソン、グラハム・T.、編 (2017-01-01)、「第18章 - タンパク質の翻訳後標的化」、細胞生物学 (第3版)、エルゼビア、pp. 303–315、doi :10.1016/b978-0-323-34126-4.00018-9、ISBN 978-0-323-34126-4、 2020年11月23日取得
^ Aubourg, Patrick; Wanders, Ronald (2013-01-01)、Dulac, Olivier; Lassonde, Maryse; Sarnat, Harvey B. (編)、「第 163 章 - ペルオキシソーム障害」、臨床神経学ハンドブック、小児神経学パート III、113、Elsevier: 1593–1609、doi :10.1016/b978-0-444-59565-2.00028-9、ISBN 9780444595652、PMID 23622381、S2CID 13023065 、 2020年11月23日取得
^ Kiel JA、Emmrich K、Meyer HE、Kunau WH (2005 年 1 月)。「ペルオキシソーム標的シグナルタイプ 1 受容体 Pex5p のユビキチン化は、ペルオキシソームマトリックスタンパク質の輸入中に品質管理機構が存在することを示唆している」。J . Biol. Chem . 280 ( 3): 1921–30。doi : 10.1074/jbc.M403632200。PMID 15536 088 。

外部リンク

真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス TRG_PTS1

[1] Gould, SG; Keller, GA; Subramani, S. (1987 年 12 月)。「ホタルルシフェラーゼのカルボキシ末端におけるペルオキシソーム標的シグナルの同定 -- Gould ら 105 (6): 2923 -- The Journal of Cell Biology」。Journal of Cell Biology . 105 (6)。www.jcb.org: 2923–2931。doi : 10.1083 /jcb.105.6.2923。PMC 2114716。PMID 3480287。2008年5 月 13 日閲覧。

[:0-2] ポラード、トーマス・D.; アーンショウ、ウィリアム・C.; リッピンコット・シュワルツ、ジェニファー; ジョンソン、グラハム・T.、編 (2017-01-01)、「第18章 - タンパク質の翻訳後標的化」、細胞生物学 (第3版)、エルゼビア、pp. 303–315、doi :10.1016/b978-0-323-34126-4.00018-9、ISBN 978-0-323-34126-4、 2020年11月23日取得

[3] Aubourg, Patrick; Wanders, Ronald (2013-01-01)、Dulac, Olivier; Lassonde, Maryse; Sarnat, Harvey B. (編)、「第 163 章 - ペルオキシソーム障害」、臨床神経学ハンドブック、小児神経学パート III、113、Elsevier: 1593–1609、doi :10.1016/b978-0-444-59565-2.00028-9、ISBN 9780444595652、PMID 23622381、S2CID 13023065 、 2020年11月23日取得

[pmid15536088-4] Kiel JA、Emmrich K、Meyer HE、Kunau WH (2005 年 1 月)。「ペルオキシソーム標的シグナルタイプ 1 受容体 Pex5p のユビキチン化は、ペルオキシソームマトリックスタンパク質の輸入中に品質管理機構が存在することを示唆している」。J . Biol. Chem . 280 ( 3): 1921–30。doi : 10.1074/jbc.M403632200。PMID 15536 088 。