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オープンバイオインフォマティクス財団は、バイオインフォマティクスにおけるオープンソースプログラミングのサポートに重点を置いた、非営利のボランティア運営組織です。[1]財団の使命は、バイオインフォマティクス用のオープンソースツールキットの開発をサポートし、開発者中心のハッカソンイベントを企画し、生命科学におけるオープンソースソフトウェア開発の開発と推進を全般的に支援することです。財団はまた、分子生物学のためのインテリジェントシステム会議のサテライト会議である、毎年恒例のバイオインフォマティクスオープンソースカンファレンスを企画・運営しています。 [2]財団は、 Google Summer of Codeに参加し、個々のバイオインフォマティクス関連プロジェクトの統括組織として活動しています。[3] [4]
オープンバイオインフォマティクス財団は、BioJava、BioPerl、BioPythonプロジェクトから派生して2001年に設立されました。財団の正式な会員は2005年に設立されました。[1] 2012年10月、財団はSoftware in the Public Interest (SPI)との提携を開始しました。SPIは米国を拠点とする非営利団体で、他の組織によるフリーソフトウェアおよびオープンソースソフトウェアの作成と配布を支援しています。SPIとの提携により、財団への寄付が可能になりました（米国では501(c)3非課税）。[1] [5]
財団は、様々なバイオ*プロジェクトを代表する理事会によって運営されています。2019年現在、OBF会長はピーター・コック（BioPython）です。[6] OBFの歴代会長にはユアン・バーニーとヒルマー・ラップ（NESCent ）がおり、歴代理事にはスティーブン・E・ブレンナーがいます。[7]
プロジェクト
この財団は、次のようなバイオインフォマティクス関連のオープンソースプロジェクトのメーリングリスト、ウェブサイト、コードリポジトリ用のサーバーをホストしています。[8]
- BioJava – Java ツールキット
- BioMOBY – Web サービスによるデータとアプリケーションの実行
- BioPerl – Perl ツールキット
- BioPython – Python ツールキット
- BioRuby – Ruby ツールキット
- バイオPHP
- EMBOSS – シーケンス解析ツールキット。
参照
参考文献
- ^ abc 「Open Bioinformatics Foundation」 。 2014年9月1日閲覧。
- ^ 「BOSC – Open Bioinformatics Foundation」 。 2014年9月1日閲覧。
- ^ 「Google Summer of Code – Open Bioinformatics Foundation」 。 2014年9月1日閲覧。
- ^ 「Open Bioinformatics Foundation」. google-melange.com . 2014年9月1日閲覧。
- ^ “obf”. spi-inc.org . 2014年9月1日閲覧。
- ^ 「理事会選挙 – Open Bioinformatics Foundation」 。 2020年12月15日閲覧。
- ^ 「Board – Open Bioinformatics Foundation」 。 2014年9月1日閲覧。
- ^ 「プロジェクト – Open Bioinformatics Foundation」 。 2014年9月1日閲覧。
外部リンク
- オープンバイオインフォマティクス財団のウェブサイト