| ミオウイルス科 | |
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| シネココッカスファージS-PM2ウイルス粒子 のTEM画像 | |
| ウイルスの分類 | |
| (ランク外): | ウイルス |
| 領域: | デュプロドナウイルス |
| 王国: | 興公ビラエ |
| 門: | ウロウイルス亜綱 |
| クラス: | カウドビリセテス |
| 注文: | カウドウイルス目 |
| 家族: | ミオウイルス科 |
| 亜科と属 | |
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テキストを参照 | |
ミオウイルス科は、カウドウイルス目のバクテリオファージ科であった。ミオウイルス科とカウドウイルス目は現在廃止されており、ミオウイルスという用語は、この旧科のウイルスの形態を指すために使用されている。 [1]細菌と古細菌が自然宿主となる。この科には625種があり、8つの亜科と217属に分類されている。 [2] [3]
区分
亜科Tevenvirinae(シノニム:Tequatrovirinae)は、そのタイプ種である 腸内細菌ファージT4にちなんで名付けられています。この亜科のメンバーは形態的に区別がつかず、長さ約110ナノメートル(nm)の中程度に長い頭部、襟付きの114nmの長い尾、短いスパイク付きの基部プレート、および6本の長く曲がった尾繊維を持っています。この亜科内の属は頭部の形態に基づいて分類されており、Tequatrovirus属(仮称:T4virus)の頭部の長さは137nm、Schizotequatrovirus属の頭部の長さは111nmです。属内では、タンパク質の相同性に基づいて種がいくつかのグループに分けられています。
Peduovirinae亜科には、直径 60 nm の頭部と 135 × 18 nm の尾部を持つウイルス粒子があります。これらのファージは、収縮した鞘が尾部コアから滑り落ちる傾向があるため、簡単に識別できます。P" ファージが基準種です。
Spounavirinae亜科はすべて毒性があり、宿主域が広く、バシロタ属に感染するファージである。直径 87~94 nm の等尺性の頭部と目立つカプソマー、140~219 nm の縞模様の尾部、および二重のベースプレートを持つ。尾部の先端には、現在ベースプレートスパイクであることがわかっている球状の構造と、6 回対称の短い屈曲した尾部繊維がある。このグループのメンバーは通常、3.1~20 kb の末端冗長性を持つ大きな (127~142 kb) 非置換ゲノムを持つ。この亜科の名前は、SPO とuna (ラテン語で 1) に由来する。
ハロウイルスHF1とHF2は同じ属に属しているが、細菌ではなく古細菌に感染するため、分類が決まれば別の属に分類される可能性が高い。[4]
形態学的およびゲノム的根拠に基づき、矮小グループが提案されている。このグループには、アエロモナス・サルモニシダのファージ56、コレラ菌のファージ138およびCP-T1、デロビブリオ菌のファージφ1422、ペクトバクテリウム・カロトヴォルムのファージZF40が含まれる。[5]これらのファージに共通する特徴としては、同一のビリオン形態、通常は短い収縮性の尾部が特徴で、ゲノムサイズはすべて約45キロベースである。ゲノムの構造単位における遺伝子の順序は、ターミナーゼ、門脈、頭部、尾部、基底板、尾繊維の順である。
ウイルス学

旧ミオウイルス科のウイルスはエンベロープを持たず、頭尾(首付き)の形状をしています。ゲノムは線状の二本鎖DNAで、長さは約33~244kbです。ゲノムは40~415のタンパク質をコードしています。[2]末端に冗長な配列があります。GC含量は約35%です。ゲノムはオペロンで転写される200~300のタンパク質をコードしています。ゲノムにはチミジンの代わりに5-ヒドロキシメチルシトシンが存在する場合があります。
管状の尾は螺旋対称で、直径は 16~20 nm です。中心管、収縮鞘、カラー、ベースプレート、6 つの尾ピン、および 6 つの長い繊維で構成されています。テクティウイルス科に似ていますが、ミオウイルスの尾は永久的であるという点で異なります。
尾部の収縮にはATP が必要です。鞘が収縮すると、鞘のサブユニットが互いに滑り、尾部の長さは 10~15 nm に短くなります。
ライフサイクル


宿主細胞に付着すると、ウイルスは収縮鞘を注射器のように使い、中心の管で細胞壁を突き刺し、遺伝物質を宿主に注入する。注入されたDNAは宿主細胞の転写と翻訳のメカニズムを引き継ぎ、新しいウイルスの製造を開始する。複製は複製転座モデルに従う。DNAテンプレート転写が転写の方式である。翻訳は-1リボソームフレームシフトによって行われる。ウイルスは溶解、およびホリン/エンドリシン/スパニンタンパク質 によって宿主細胞から排出される。細菌と古細菌が自然宿主となる。感染経路は受動拡散である。[2]
ミオウイルスは一般に溶菌性であり、溶原性になるために必要な遺伝子を欠いているが、温帯性の種が数多く知られている。
アプリケーション
ミオウイルス科のほとんどは溶菌性ファージであり、温和性ではないため、一部の研究者はヒトや他の動物の細菌性疾患の治療薬としての使用を研究している。 [7]
分類
以下の8つのサブファミリーが認められている: [3]
- エメリッヒウイルス科
- ユーカンピウイルス科
- ゴルゴンウイルス科
- オウナウイルス科
- ペデュオウイルス科
- テベンビリナエ
- トワログウイルス科
- ベキンタウイルス科
さらに、以下の属は亜科に分類されていない: [3]
- アブオウイルス
- アシオナウイルス
- アグリカンウイルス
- アフティウイルス
- アルシオネウスウイルス
- アレクサンドラウイルス
- アナドンウイルス
- アナポスウイルス
- アオクアンウイルス
- アステリウスウイルス
- アトラウアウイルス
- アウルンウイルス
- アヨートレウイルス
- バイカルウイルス
- バコリウイルス
- バルバウイルス
- ベセプフナウイルス
- ベセプムウイルス
- ベセセプティマウイルス
- ベラミーウイルス
- ベンディゴウイルス
- ビクアルタウイルス
- ビクズナウイルス
- ボロクウイルス
- ブリギットウイルス
- ブリゾウイルス
- ブルーノウイルス
- 釜山ウイルス
- カルパシナウイルス
- チャクラバーティウイルス
- カリブディスウイルス
- チェンマイウイルス
- コルニーウイルス
- シモポレイアウイルス
- デルビカスウイルス
- ディビウイルス
- ドネリウイルス
- エレメンテイタウイルス
- エルウィルス
- エムドデカウイルス
- エネラドゥスウイルス
- エポナウイルス
- エルスキネウイルス
- ユーリビアウイルス
- フィクレデュオウイルス
- フラウムドラウイルス
- フクイウイルス
- ゴフデュオウイルス
- ゴスラーウイルス
- ハロフェラカレスウイルス
- ハプナウイルス
- 黒龍江ウイルス
- イアペトゥスウイルス
- ヨードウイルス
- イオナウイルス
- ジェドゥナウイルス
- ジリンウイルス
- ジマーウイルス
- 神奈川ウイルス
- カナロアウイルス
- クラウザウイルス
- クレツコフスカウイルス
- カンナビウイルス
- カイルウイルス
- ラガフェウイルス
- ロイコテアウイルス
- リバンウイルス
- リエットデュオウイルス
- リルウイルス
- ラフバラウイルス
- ラボックウイルス
- マキナウイルス
- マルファウイルス
- マーサウイルス
- マズウイルス
- メンデラウイルス
- メトリウイルス
- ミーザファームウイルス
- ミマスウイルス
- モアブウイルス
- モツラウイルス
- マルドゥーンウイルス
- ムシュウイルス
- ミューウイルス
- ミオアルテロウイルス
- ミオハロウイルス
- ミオスマルウイルス
- ネスウイルス
- ナマカウイルス
- 南国ウイルス
- ネプチューンウイルス
- ネレウスウイルス
- ネリヴィクウイルス
- ノデンスウイルス
- ノキシフェルウイルス
- ニルシャロンウイルス
- オボレンスクウイルス
- オタゴウイルス
- パクプナウイルス
- パラエモンウイルス
- ブナウイルス
- ピートウイルス
- ペムナウイルス
- ペツウイルス
- ファブクアトロウイルス
- ファペコクタウイルス
- フィクズウイルス
- ピッピウイルス
- プレザンスウイルス
- プラトーレイクウイルス
- ポリボトスウイルス
- ポンタスウイルス
- ポポフウイルス
- プナウイルス
- 青島ウイルス
- ラハリアンウイルス
- ラドノウイルス
- リプデュオウイルス
- ライジングサンウイルス
- ロノドルウイルス
- ローズマウントウイルス
- サクレイウイルス
- サンジロンウイルス
- サラシサウイルス
- サモンドウイルス
- サルマンウイルス
- サスカッチウイルス
- シュミットロツウイルス
- ソウルウイルス
- 山東ウイルス
- シャーブルックウイルス
- シラハマウイルス
- シャラウイルス
- スブナウイルス
- タベルナリウスウイルス
- タカハシウイルス
- タムクンウイルス
- タラニスウイルス
- テフヌトウイルス
- テグナウイルス
- タウマスウイルス
- テティスウイルス
- ソーンウイルス
- ティジュナウイルス
- トータティスウイルス
- チューレーンウイルス
- ベラモウイルス
- Vhmlウイルス
- ビバキウイルス
- ウェリントンウイルス
- ウィフセウイルス
- ウィンクラーウイルス
- 横浜ウイルス
- ヨロスワグウイルス
- ヨングルリンウイルス
参考文献
- ^ ターナー D、シュコポロフ AN、ルード C、ミラード AD、ドゥティル BE、アルフェナス=ゼルビニ P、ファン ジル LJ、アジズ RK、オクサネン HM、ポラネン MM、クロピンスキー AM、バリルスキー J、ブリスター JR、チャニスビリ N、エドワーズ RA、エノーF、ギリス A、クネゼヴィッチ P、クルポヴィッチ M、クルトベーケI、クシュキナ A、ラヴィーン R、リーマン S、ロボッカ M、モラル C、モレノ スウィット A、モロゾワ V、ナカヴマ J、レイエス ムニョス A、ラムニクス J、サーカー BL、サリバン MB、内山 J、ヴィットマン J、イガン T、アドリアエンセンスEM (2023 年 1 月)。「形態に基づく分類群の廃止と二名法による種名への変更:ICTV細菌ウイルス小委員会の2022年分類更新」。Archives of Virology。168(2):74。doi :10.1007/s00705-022-05694-2。PMC 9868039 . PMID 36683075。
- ^ abc 「Viral Zone」。ExPASy 。 2015年7月1日閲覧。
- ^ abc 「ウイルス分類:2020年リリース」。国際ウイルス分類委員会(ICTV)。2021年3月。 2021年5月11日閲覧。
- ^ Tang, SL; Nuttall, S; Dyall-Smith, M (2004). 「ハロウイルス HF1 および HF2: 最近の大規模な組み換えイベントの証拠」J Bacteriol . 186 (9): 2810–7. doi :10.1128/JB.186.9.2810-2817.2004. PMC 387818. PMID 15090523 .
- ^ Comeau, AM; Tremblay, D; Moineau, S; Rattei, T; Kushkina, AI; Tovkach, FI; Krisch, HM; Ackermann, HW (2012). 「ファージ形態学は系統発生を再現する: 新しいミオウイルス群の比較ゲノム学」. PLOS ONE . 7 (7): e40102. Bibcode :2012PLoSO...740102C. doi : 10.1371/journal.pone.0040102 . PMC 3391216. PMID 22792219 .
- ^ J. Bernard Heymann、Bing Wang、William W. Newcomb、Weimin Wu、Dennis C. Winkler、Naiqian Cheng、Erin R. Reilly、Ru-Ching Hsia、Julie A. Thomas、Alasdair C. Steven:「サルモネラ巨大ファージSPN3USのまだら模様のカプシドは、新規な内部殻を持つ成熟中間体である可能性が高い」ウイルス2020年、12(9)。特集「巨大またはジャンボファージ」、910。doi:10.3390/v12090910。
- ^ Capparelli, Rosanna; et al. (2007年8月). 「マウスにおける黄色ブドウ球菌に対する実験的ファージ療法」.抗菌剤および化学療法. 51 (8): 2765–73. doi :10.1128/AAC.01513-06. PMC 1932491. PMID 17517843 .
外部リンク
- ウイルスゾーン: ミオウイルス科
- ICTV の
- ミオウイルス科の完全なゲノム
