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結核菌複合体 ( MTCまたはMTBC )は、ヒトや他の動物に 結核を引き起こす可能性のある、遺伝的に関連する結核菌種のグループです。
含まれるもの:
- 結核菌
- マイコバクテリウム・アフリカナム
- マイコバクテリウム・オリギス[1]
- ウシ型結核菌とカルメット・ゲラン菌株
- マイコバクテリウム・ミクロティ
- マイコバクテリウム・カネッティ
- マイコバクテリウム・カプラエ
- マイコバクテリウム・ピンニペディ
- マイコバクテリウム・スリカッタエ[2]
- マイコバクテリウム・ムンギ[3]
さらに、系統学的に類似しているが完全には説明されていない2つの系統、ダッシーバチルスとオリックスバチルスが存在する。オリックスバチルスは最近、別の亜種であるオリギスに再分類された。[1]
MTCのメンバーは、これらの病原体にのみ共通する多様なタンパク質に存在する63の保存されたシグネチャーインデル（CSI）の存在によって、他のすべての細菌と区別できます。 [4] MTC複合体に対する排他性とタンパク質の高度に保存された領域に存在するため、これらのCSIは機能研究と診断研究（新しい治療法の開発の潜在的なターゲットを含む）のための新しい手段を提供します。[4]
2018年以降、細菌命名法に関する限り、この種群のすべてのメンバーはM. tuberculosisの同義語とみなされている。IJSEMの記事によると、M. africanum、M. bovis、M. caprae、M. pinnipediiは全ゲノムレベルでM. tuberculosisと99.21～99.92%同一であり、独立種と見なされる基準を満たしていない。同じことは、有効に公表されていない種である「M. canetti」、「M. mungi」、「M. orygis」にも当てはまる。変異は亜種の許容レベルを下回っている。記事の著者は、これらの名前は意味のある臨床的特徴を持つ安定した系統を指していると指摘し、それらを変種にすることを推奨している。たとえば、M. bovisはM. tuberculosis var. bovisになるだろう。 [5]
系統学
MTBC が異なる系統に分岐するにつれ、新しい TANNNT プリブノウ ボックスを導入する突然変異や転写抑制因子の機能を損なう突然変異の結果として、主要な代謝病原遺伝子の発現も変化しました。これは、MTBC 系統がおそらく異なる人間集団への適応を反映しているという明確な証拠を示しています。実際、遺伝子発現の修正は、ゲノムを大幅に変更する必要なく、新しい環境への生理学的適応のための迅速なメカニズムである可能性があります。[6]
これは、異なる MTBC 系統がそれぞれ独自のトランスクリプトーム シグネチャを持っていることからもわかります。単一点変異でも、株の転写プロファイルを完全に変えることができます。一例として、N1177 株が挙げられます。この株は、リファンピシン耐性を付与する rpoB 遺伝子に単一の変異を持ち、複数の遺伝子の転写レベルを変化させました。[6]
メチル化の役割はよりわかりにくいが、突然変異による不活性化パターンは、メチラーゼがmtBCを通じて保存されていないことを裏付けているようだ。転写適応により、M.tuberculosis分離株は、異なるヒト宿主集団によって提供される微妙に異なる環境で、感染性と伝播性を最適化することができる。[6]
参照
参考文献
- ^ ab van Ingen J、Rahim Z、Mulder A、 Boeree MJ、Simeone R、Brosch R、van Soolingen D (2012 年 4 月)。「Mycobacterium orygis の M. tuberculosis 複合亜種としての特徴」。新興感染症。18 ( 4): 653–5。doi :10.3201/eid1804.110888。PMC 3309669。PMID 22469053 。
- ^ Patterson, S, Drewe, JA, Pfeiffer, DU, Clutton-Brock, TH (2017). 「社会的および環境的要因が野生ミーアキャットの結核関連死亡率に影響を与える」. Journal of Animal Ecology . 86 (3): 442–450. Bibcode :2017JAnEc..86..442P. doi :10.1111/1365-2656.12649. PMC 5413830. PMID 28186336 .
- ^ Vasconcellos SE、Huard RC、Niemann S、Kremer K、Santos AR、Suffys PN、Ho JL (2010 年 3 月)。「Mycobacterium africanum の 2 つの主要系統の異なる遺伝子型プロファイル」 。BMC Infectious Diseases。10 : 80。doi : 10.1186 / 1471-2334-10-80。PMC 2859774。PMID 20350321。
- ^ ab Gupta, Radhey S. (2018-10-02). 「マイコバクテリア間の進化関係の解明に対するゲノミクスの影響: 結核菌複合体に特有の分子シグネチャの特定と新規診断および治療への応用の可能性」. High-Throughput . 7 (4): 31. doi : 10.3390/ht7040031 . ISSN 2571-5135. PMC 6306742. PMID 30279355 .
- ^ Riojas, Marco A.; McGough, Katya J.; Rider-Riojas, Cristin J.; Rastogi, Nalin; Hazbón, Manzour Hernando (2018年1月1日). 「Mycobacterium tuberculosis複合体の種の系統ゲノム解析により、Mycobacterium africanum、Mycobacterium bovis、Mycobacterium caprae、Mycobacterium microti、およびMycobacterium pinnipediiは、後にMycobacterium tuberculosisの異型同義語になったことが実証されました」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 68 ( 1): 324–332. doi : 10.1099/ijsem.0.002507 . PMID 29205127.
- ^ abc Chiner-Oms Á, Berney M, Boinett C, González-Candelas F, Young DB, Gagneux S, et al. (2019年9月). 「ゲノムワイド変異バイアスが結核菌群の転写多様性を促進する」Nature Communications . 10 (1): 3994. Bibcode :2019NatCo..10.3994C. doi :10.1038/s41467-019-11948-6. PMC 6728331 . PMID 31488832.
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