メチロセラ・シルベストリス

メチロセラ・シルベストリス
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	シュードモナドタ
クラス：	アルファプロテオバクテリア
注文：	ヒポミクロバイオレ
家族：	ベニイェリンキ科
属:	メチロセラ
種：	M.シルベストリス
二名法名
	メチロセラ・シルベストリス; ダンフィールド他、2003

メチロセラ・シルベストリスは、多くの酸性土壌や湿地に生息するメチロセラ属の細菌です^{。 [1]}歴史的には、メチロセラ・シルベストリスはもともとドイツの酸性森林土壌から分離され、グラム陰性、好気性、無色素、非運動性、桿菌でメタン酸化通性メタン栄養。^[2]好気性メタン栄養細菌であるメチロセラ属は、メタン（CH₄）とメタノールを主な炭素源およびエネルギー源として利用し、酢酸、ピルビン酸、コハク酸、リンゴ酸、エタノールなどの多様な化合物も利用します。^[3]これらは、4°～30°Cの低温で生存することが知られており、最適温度は約15°～25°Cですが、36°Cを超えません。 pH4.5～7.0の範囲でよりよく成長します。^[1]メチロセラ以外のすべてのメタン酸化細菌に共通する細胞内膜を欠いていますが、細胞質膜につながる小胞膜システムを持っています。BL2^T (=DSM 15510^T =NCIMB 13906^T ) が基準株です。

系統発生

Dunfieldらは、Methylocella silvestrisは系統学的にMethylocella palustris K ^T、Beijerinckia indica ATCC 9039、Methylocapsa acipihila B2 ^Tと近縁であり、炭素同化にセリン回路を利用するII型メタン資化性細菌に分類されるが、可溶性メタンモノオキシゲナーゼ（sMMO）とプロパンモノオキシゲナーゼ（PrMO）を持たないと述べている。^[1]^[4]

ゲノム

メチロセラ・シルベストリスのゲノムが配列決定された。メチロセラ・シルベストリスには、NAD(P)依存性アルコール脱水素酵素（ADH）、ピロロキノリンキノン（PQQ）含有メタノール脱水素酵素（Msil_0471）、およびメチロバクテリウム・エクストルケンス由来のxoxF（Msil_1587）と73%の同一性を持つPQQ含有ADHをコードする8つの遺伝子が含まれている。^[4]チェンらは論文の中で、ゲノムサイズは4.3 MbPで、プロテオバクテリアと類似していると述べた。^[2]

参考文献

^ abc Dunfield PF、Khmelenina VN、Suzina NE、Trotsenko YA、Dedysh SN (2003 年 9 月)。「Methylocella silvestris sp. nov.、酸性森林カンビソルから分離された新規メタン資化性細菌」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。53 ( Pt 5): 1231–1239。doi : 10.1099/ijs.0.02481-0。PMID 13130000。2013年7 月 25日閲覧。
^ ab Chen Y, Crombie A, Rahman MT, Dedysh SN, Liesack W, Stott MB, et al. (2010年7月). 「好気性通性メタン資化菌Methylocella silvestris BL2の完全ゲノム配列」. Journal of Bacteriology . 192 (14): 3840–1. doi :10.1128/JB.00506-10. PMC 2897342. PMID 20472789 .
^ Dedysh, Svetlana N.; Knief, Claudia; Dunfield, Peter F. (2005-07-01). 「メチロセラ種は通性メタン栄養性である」. Journal of Bacteriology . 187 (13): 4665–4670. doi : 10.1128/JB.187.13.4665-4670.2005 . ISSN 0021-9193. PMC 1151763. PMID 15968078 .
^ ab Bordel, Sergio; Crombie, Andrew T.; Muñoz, Raúl; Murrell, J. Colin (2020-07-16). 「多用途メタン資化性細菌 Methylocella silvestris のゲノムスケール代謝モデル」.微生物細胞工場. 19 (1): 144. doi : 10.1186/s12934-020-01395-0 . ISSN 1475-2859. PMC 7364539 . PMID 32677952.

さらに読む

Vos PW、Brenner DJ、Staley JT、Boone DR、Garrity GM、Goodfellow M、Krieg NR、Rainey FA、Schleifer KH (2005)。Bergeys Manual? of Systematic Bacteriology Volume Two The Proteobacteria Part C The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria 。ボストン、マサチューセッツ州：Bergeys Manual Trust。ISBN 0-387-29298-5。
Dedysh SN、Knief C、Dunfield PF (2005年7 月)。「メチロセラ属菌は通性メタノトローフィックである」。Journal of Bacteriology。187 ( 13): 4665–70。doi :10.1128/ JB.187.13.4665-4670.2005。PMC 1151763。PMID 15968078。
Rahman MT、Crombie A、Moussard H、Chen Y 、 Murrell JC (2011 年 6 月)。「泥炭土ミクロコスムにおけるメチロセラシルベストリスの補給によるメタン酸化の酢酸抑制」。応用環境微生物学。77 ( 12): 4234–6。doi : 10.1128 /AEM.02902-10。PMC 3131658。PMID 21515721。
Theisen AR、Ali MH、Radajewski S、Dumont MG 、 Dunfield PF、McDonald IR、他 (2005 年 11 月)。「通性メタン資化性細菌 Methylocella silvestris BL2 におけるメタン酸化の調節」。分子微生物学。58 ( 3): 682–92。doi : 10.1111/j.1365-2958.2005.04861.x。PMID 16238619。S2CID 32124521 。
Chen Y、Crombie A、Rahman MT、Dedysh SN、Liesack W 、 Stott MB、他 (2010 年 7 月)。「好気性通性メタン資化菌 Methylocella silvestris BL2 の完全ゲノム配列」。Journal of Bacteriology。192 ( 14 ): 3840–1。doi :10.1128/ JB.00506-10。PMC 2897342。PMID 20472789。

外部リンク

「メチロセラ・シルベストリス」。生命百科事典。
LPSN
BacDive - 細菌多様性メタデータベースにおける Methylocella silvestris の標準株

[pmid13130000-1] Dunfield PF、Khmelenina VN、Suzina NE、Trotsenko YA、Dedysh SN (2003 年 9 月)。「Methylocella silvestris sp. nov.、酸性森林カンビソルから分離された新規メタン資化性細菌」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。53 ( Pt 5): 1231–1239。doi : 10.1099/ijs.0.02481-0。PMID 13130000。2013年7 月 25日閲覧。

[:0-2] Chen Y, Crombie A, Rahman MT, Dedysh SN, Liesack W, Stott MB, et al. (2010年7月). 「好気性通性メタン資化菌Methylocella silvestris BL2の完全ゲノム配列」. Journal of Bacteriology . 192 (14): 3840–1. doi :10.1128/JB.00506-10. PMC 2897342. PMID 20472789 .

[3] Dedysh, Svetlana N.; Knief, Claudia; Dunfield, Peter F. (2005-07-01). 「メチロセラ種は通性メタン栄養性である」. Journal of Bacteriology . 187 (13): 4665–4670. doi : 10.1128/JB.187.13.4665-4670.2005 . ISSN 0021-9193. PMC 1151763. PMID 15968078 .

[:1-4] Bordel, Sergio; Crombie, Andrew T.; Muñoz, Raúl; Murrell, J. Colin (2020-07-16). 「多用途メタン資化性細菌 Methylocella silvestris のゲノムスケール代謝モデル」.微生物細胞工場. 19 (1): 144. doi : 10.1186/s12934-020-01395-0 . ISSN 1475-2859. PMC 7364539 . PMID 32677952.