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| LysMドメイン | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| シンボル | リスM | ||||||||
| パム | PF01476 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
| 頭いい | リスM | ||||||||
| プロサイト | PS51782 | ||||||||
| SCOP2 | 1e0g / スコープ / SUPFAM | ||||||||
| 医療機器 | cd00118 | ||||||||
| メンブラノーム | 1306 | ||||||||
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分子生物学では、 LysMドメインは、さまざまな細胞外タンパク質や受容体に見られるタンパク質ドメインです。LysMドメインは、細菌タンパク質で特定された配列モチーフに付けられた元の名前であるリジンモチーフにちなんで名付けられました。この領域は、もともとEnterococcus hiraeムラミダーゼで見つかったC末端リピートとして特定されました。[1] LysMドメインは、さまざまな微生物細胞外タンパク質に見られ、LysMドメインはペプチドグリカンやキチンなどの細胞外多糖類へのアンカーを提供すると考えられています。LysMドメインは、マメ科植物と共生細菌の根粒共生に必要なNod因子の受容体であるNFPを含む植物受容体にも見られます。[2] LysMドメインの長さは通常、44〜65アミノ酸残基です。[3] LysMドメインの構造は、一対の短いαヘリックスによって分離された一対の反平行β鎖で構成されていることを示した。[4]
参照
参考文献
- ^ Joris B, Englebert S, Chu CP, Kariyama R, Daneo-Moore L, Shockman GD, Ghuysen JM (1992 年 3 月). 「Enterococcus hirae ムラミダーゼ-2 および Streptococcus faecalis オートリシンのモジュール設計」. FEMS Microbiology Letters . 70 (3): 257–64. doi : 10.1016/0378-1097(92)90707-u . PMID 1352512.
- ^ アリギ、ジャン＝フランソワ;アニック・バレ。ベン・アモール、ベズマ。ベルスー、アン。ソリアーノ、リディア・カンポス。ミラベラ、ロッサナ。デ・カルヴァーリョ＝ニーベル、フェルナンダ。ジュルネ、エティエンヌ・パスカル。ゲラルディ、ミシェル。ユゲ、ティエリー。グルツ、ルネ (2006)。 「Medicago truncatula リジンモチーフ受容体様キナーゼ遺伝子ファミリーには、NFP および新規結節発現遺伝子が含まれます。」植物生理学。142 (1): 265–279。土井：10.1104/pp.106.084657。ISSN 0032-0889。PMC 1557615。PMID 16844829。
- ^ Buist G、Steen A、Kok J 、 Kuipers OP (2008 年 5 月)。「LysM、(ペプチド)グリカンに結合するための広く分布するタンパク質モチーフ」。 分子微生物学。68 (4): 838–47。doi : 10.1111/ j.1365-2958.2008.06211.x。PMID 18430080。
- ^ Bateman A、Bycroft M (2000 年6 月)。「大腸菌膜結合型溶解性ムレイントランスグリコシラーゼ D (MltD) の LysM ドメインの構造」。Journal of Molecular Biology。299 ( 4): 1113–9。doi : 10.1006 /jmbi.2000.3778。PMID 10843862 。