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以下は、バイオサイバネティクス研究用のソフトウェア パッケージとアプリケーションの一覧です。
データ形式と仕様
- システム生物学マークアップ言語(SBML)
- 生物学的経路交換 ( BioPAX )
- セルML
- シミュレーション実験に関する最小限の情報(MIASE)
- モデルの注釈に必要な最小限の情報(MIRIAM)
- システム生物学オントロジー(SBO)
- システム生物学グラフィカル表記法(SBGN)
ソフトウェア開発用ライブラリ
- CyberUnits、生命科学におけるコンピュータシミュレーション用クラスライブラリ[1]
ソフトウェア製品
- SimThyr – 甲状腺恒常性のシミュレーション システム
参照
- 配列アライメントソフトウェアのリスト
- オープンソースのヘルスケアソフトウェアのリスト
- オープンソースのバイオインフォマティクスソフトウェアのリスト
- 独自のバイオインフォマティクスソフトウェアのリスト
- 無料のヘルスソフトウェアのリスト
- 分子グラフィックスシステムの一覧
- システム生物学モデリングソフトウェアのリスト
- 分子力学モデリング用ソフトウェアの比較
- バイオリナックス
その他のコレクション
- PhysioToolkit ソフトウェア インデックス: PhysioNet のソフトウェア コレクション
参考文献
- ^ 「CyberUnits: 計算サイバネティクスのためのオープンライブラリ」. cyberunits.sourceforge.net . 2021年4月17日閲覧。