ギブスのサンプラー

Just another Gibbs sampler ( JAGS ) は、マルコフ連鎖モンテカルロ(MCMC)を用いたベイズ階層モデルからのシミュレーションを行うプログラムで、Martyn Plummer によって開発されました。JAGS は、生態学、経営学、遺伝学など、多くの分野で統計作業に利用されています。^{[2] [3] [4]}

JAGSは、同じモデリング言語（非公式にはBUGS）の方言を使用することでWinBUGS / OpenBUGSとの互換性を目指していますが、モデル構築とMCMCサンプル後処理用のGUIは提供されていないため、これらは別のプログラムで処理する必要があります（たとえば、rjagsなどのライブラリを介してRからJAGSを呼び出し、RでMCMC出力を後処理する）。^[5]

オリジナルのBUGSファミリーのメンバー（WinBUGSとOpenBUGS）と比較したJAGSの主な利点は、プラットフォームに依存しないことです。BUGSファミリーはComponent Pascalというあまり知られていないプログラミング言語で書かれていますが、JAGSはC++で書かれています。^{[6] [7]}さらに、JAGSはすでにUbuntuなどの多くのLinuxディストリビューションのリポジトリの一部になっています。64ビットプラットフォームで64ビットアプリケーションとしてコンパイルすることもできるため、すべてのアドレス指定可能な空間をBUGSモデルで使用できます。

JAGS は、コマンド ラインから使用することも、スクリプト ファイルを使用してバッチ モードで実行することもできます。つまり、実行のたびに設定をやり直す必要がなく、プログラムを別のプログラム内から呼び出して制御できます (たとえば、上記のように rjags を介して Rから)。

JAGS はGNU General Public Licenseに基づいてライセンスされています。

• スタン（ソフトウェア）

• JAGS、SourceForgeページ
• JAGS、FreshPortsページ
• rjags、R (プログラミング言語)ページ