ジェシカ・キッシンジャー

ジェシカ・キッシンジャーは、ジョージア大学フランクリン文学部の特別研究教授であり、バイオインフォマティクス研究所所長です。彼女の研究は、原生動物寄生虫ゲノム、特にクリプトスポリジウム、トキソプラズマ・ゴンディ、マラリア原虫の進化、アセンブリ、データキュレーションに焦点を当てています。

キッシンジャーは1995年にインディアナ大学ブルーミントン校で博士号を取得した。^[1]博士研究員時代には、科学者が簡単に検索してアクセスできるように、マラリアに特化したPlasmoDBを含む真核生物病原体データベース( EuPathDB ) シリーズのゲノムコレクションの構築にデビッド・ルースとともに取り組んだ。^{[2] [3]} 1999年の開始以来、データベースは9テラバイトのデータを蓄積し、NIHから資金サイクルごとに助成金の寄付を受け、現在では13,000人から年間600万回の検索を受けている。^[4]最近では、キッシンジャーとルースは、リソースの維持のために総額2,340万ドルと見込まれる助成金を獲得した。^[4] EuPathDBの成功により、クリスチャン・ストーカートとクリスティアン・ヘルツ・ファウラーとともに、同じフレームワークに基づいた臨床疫学データベース ( ClinEpiDB )が作成された。 ^[5]

2008年、准教授時代に、米国科学・工学・医学アカデミーの国家会員に任命された。^[6]ジョージア大学のバイオインフォマティクス研究所の設立に尽力し、その後所長となった。^[7] 2016年には、国際協力、国際的なデータ公開、国立衛生研究所の西アフリカ国際マラリア研究卓越センター運営委員会メンバーとしての功績が認められ、ジョージア大学からリチャード・F・ライフ国際化賞を（同僚のローズ・シェピャトール・トムソン教授とともに）受賞した。 [ ^7]

データベースの作成以外にも、キッシンジャーは寄生虫ゲノムの分析と比較に焦点を当てています。アピコンプレックス（マラリアやトキソプラズマの寄生虫を含む）全体のゲノムアセンブリを使用して、遺伝子シンテニー（異なるゲノムで同じグループに配置されている遺伝子）が動物ゲノムから予想されるよりも大幅に少ないことが示されました。これは、寄生虫ゲノムが大幅に再編成されたか、寄生虫の最新の共通祖先がこれまで考えられていたよりも古いことを示唆しています。^[8] 2012年に彼女の研究室は、ゲノム全体のシンテニーを識別する計算ツールMCScanXの開発を支援しました。これは650回以上引用されています。^{[9] [10]}

キッシンジャーは、寄生虫の調査から得られたビッグデータを可能な限りアクセス可能にし続けている。エモリー大学との共同研究で、国立アレルギー感染症研究所の資金提供を受け、メアリー・ガリンスキーが率いるマラリア宿主病原体相互作用センターは、何千ものマラリアと哺乳類の関係を特徴付ける大規模なプロジェクトに着手しており、キッシンジャーはこのデータを誰もが使用できる形式に変換する作業に携わっている。^[11]彼女はこのプロジェクトについて次のように述べている。「私のチームの目標は、宿主と寄生虫の両方で生成されるテラバイト単位のデータを統合し、パターンとシグナルを探している数学モデル作成者や、世界中のマラリア研究コミュニティがアクセスできるようにして、この大規模な投資がマラリア研究に可能な限り最大の影響を与えるようにすることです。」^[11]