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| カンピロバクター | |
|---|---|
| カンピロバクター・ジェジュニ菌 | |
| 科学的分類 | |
| ドメイン: | 細菌 |
| 門: | カンピロバクター |
| クラス: | 「カンピロバクテリア」 ウェイトら 2017 |
| 注文: | カンピロバクター類 Garrity et al. 2006 |
| 科と属 | |
カンピロバクター目は、オウムガイ科とともにイプシロン亜門を構成するカンピロバクター類の一種である。グラム陰性で、ほとんどの種は微好気性である。[1]
分子シグネチャー
比較ゲノム解析により、カンピロバクター目のほぼすべての種に特有の49のタンパク質が特定されました。さらに、タンパク質とともにこの目の分子マーカーとして機能する2つの保存されたシグネチャーインデルが特定されました。インデルは、 Uvr ABCシステムのBタンパク質における3つのアミノ酸の挿入と、フェニルアラニルtRNA合成酵素における2つのアミノ酸の欠失です。[2]
系統発生
現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト(LPSN)[3]と国立生物工学情報センター(NCBI)[4]に基づいています。
未割り当ての属:
- 「フレキシスピラ」ブライナー 1987
- 「Candidatus Thioturbo」Muyzer et al. 2005年
- 「チオフラクター」マキタ et al. 2012年
- 「チオバルバ科」Assié et al. 2020年
- 「Candidatus Thiobarba」Assié et al. 2020年
参照
参考文献
- ^ Garrity, George M.; Brenner, Don J.; Krieg, Noel R.; Staley, James T. (編) (2005). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Volume Two: The Proteobacteria, Part C: The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria. ニューヨーク、ニューヨーク:Springer。ISBN 978-0-387-24145-6 。
- ^ Gupta, RS (2006). イプシロンプロテオバクテリアに特有の分子シグネチャー(固有のタンパク質と保存されたインデル)。BMC Genomics. 7:167.
- ^ AC Parte; et al. "Campylobacterales".命名法で定められた原核生物名のリスト(LPSN) 。2023年9月9日閲覧。
- ^ Sayers; et al. 「Campylobacterales」。国立生物工学情報センター(NCBI) 分類データベース。 2023年9月9日閲覧。
- ^ 「The LTP」 。 2023年11月20日閲覧。
- ^ 「LTP_all tree in newick format」。2023年11月20日閲覧。
- ^ 「LTP_08_2023 リリースノート」(PDF) 。 2023年11月20日閲覧。
- ^ 「GTDBリリース08-RS214」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
- ^ "bac120_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。
- ^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
