ハプログループ L4

ハプログループ L4
ハプログループ L4
起源の可能性のある時期	90～80千年前
起源地の可能性	東アフリカ
祖先	L3'4
子孫	L4a、L4b
突然変異の定義	5460, 16362

ハプログループL4は、ヒトのミトコンドリアDNA （mtDNA）ハプログループです。主にアフリカに限定された小さな母系系統です。^[2]

L4は東アフリカで重要です。最も高い頻度はタンザニアのハッザ族で60～83%、サンダウェ族では48%です。^[3]

この系統にはL4aとL4bの2つの分岐がある。サブグループL4aは以前はL7と呼ばれ、L3'4'7の別のサブグループと考えられていた。Behar et al. (2008) により、 L4のサブグループとして認識され、 L3はそのアウトグループである。 ^[4] 親系統L3'4は106～66 kyaに出現したとされる。^[5] L4はこれよりそれほど遅くはなく、Fernandes et al. (2015) によると87 kyaと推定されている。^[6]

系統発生

以下の系統樹はvan OvenとKayser（2008）に基づいています。^[1]

L3'4
- L4
  - L4a (以前は L7 と呼ばれていました)、変異: 195C、3357、5460、10373、11253、11344、11485、12414、13174、14302、16260。
    - L4a1
      - L4a1a
    - L4a2
  - L4b、変異：709、3918。
    - L4b1
    - L4b2 (以前は L3g または L4g と呼ばれていました)
      - L4b2a
        L4b2a1
        
        L4b2a2
        L4b2a2a
        
        L4b2a2b
      - L4b2b

参考文献

^ ab van Oven, Mannis; Manfred Kayser (2008年10月13日). 「ヒトミトコンドリアDNAの変異に関する包括的系統樹の更新」. Human Mutation . 30 (2): E386–E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457. S2CID 27566749.
^ ハプログループ L4。
^ Tishkoff, S. et al. 2007, mtDNAとY染色体の遺伝的変異から推定されるアフリカのクリック音話者集団の歴史。分子生物学と進化 2007 24(10):2180-2195
^ Behar, M.; Villems, R.; Soodyall, H.; Blue-Smith, J.; Pereira, L.; Metspalu, E.; Scozzari, R.; Makkan, H.; Tzur, S.; Comas, D.; Bertranpetit, J.; Quintana-Murci, L.; Tyler-Smith, C.; Wells, RS; Rosset, S.; Genographic, C. (2008 年 5 月)。「人類の母系多様性の夜明け」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。82 (5): 1130–1140。doi : 10.1016 /j.ajhg.2008.04.002。ISSN 0002-9297。PMC 2427203。PMID 18439549。
^ 「浄化選択の修正: 改良されたヒトミトコンドリア分子時計補足資料 (p. 83)」(PDF) 2009: 89。2009-12-29にオリジナル(PDF)からアーカイブ。 {{cite journal}}:ジャーナルを引用するには|journal=(ヘルプ)が必要です
^ フェルナンデス V、トリスカ P、ペレイラ JB、アルシャマリ F、リト T、マチャド A 他(2015) アラビアの主要な人口統計学的事象の遺伝層序。 PLoS ONE 10(3): e0118625。土井：10.1371/journal.pone.0118625

外部リンク

一般的な
- マニス・ヴァン・オーヴェンのフィロツリー
ハプログループ L4
- イアン・ローガンのハプログループ L4
- イアン・ローガンのハプログループ L4b
- YFull MTree のハプログループ L4
- MITOMAP のハプログループ L4

[vanOven-1] van Oven, Mannis; Manfred Kayser (2008年10月13日). 「ヒトミトコンドリアDNAの変異に関する包括的系統樹の更新」. Human Mutation . 30 (2): E386–E394. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457. S2CID 27566749.

[2] ハプログループ L4。

[3] Tishkoff, S. et al. 2007, mtDNAとY染色体の遺伝的変異から推定されるアフリカのクリック音話者集団の歴史。分子生物学と進化 2007 24(10):2180-2195

[Behar2008-4] Behar, M.; Villems, R.; Soodyall, H.; Blue-Smith, J.; Pereira, L.; Metspalu, E.; Scozzari, R.; Makkan, H.; Tzur, S.; Comas, D.; Bertranpetit, J.; Quintana-Murci, L.; Tyler-Smith, C.; Wells, RS; Rosset, S.; Genographic, C. (2008 年 5 月)。「人類の母系多様性の夜明け」。アメリカ人類遺伝学ジャーナル。82 (5): 1130–1140。doi : 10.1016 /j.ajhg.2008.04.002。ISSN 0002-9297。PMC 2427203。PMID 18439549。

[soares_supplementary-5] 「浄化選択の修正: 改良されたヒトミトコンドリア分子時計補足資料 (p. 83)」(PDF) 2009: 89。2009-12-29にオリジナル(PDF)からアーカイブ。 {{cite journal}}:ジャーナルを引用するには|journal=(ヘルプ)が必要です

[6] フェルナンデス V、トリスカ P、ペレイラ JB、アルシャマリ F、リト T、マチャド A 他(2015) アラビアの主要な人口統計学的事象の遺伝層序。 PLoS ONE 10(3): e0118625。土井：10.1371/journal.pone.0118625

系統発生

参考文献

外部リンク

関連するトピック

東アフリカ

L3'4

L4a

L4b