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アレルギーにおけるGWASは、アレルギーがさまざまな感受性遺伝子座と関連しているゲノムワイド関連研究のメタアナリシスの研究です。研究された3つのアレルギー表現型は、猫、ダニ、花粉に対するもので、アレルギー症状を示す患者が見つかりました。[ 1 ]
アレルギーは非常に一般的な疾患であり、数多くの健康問題を引き起こします。アレルギーとアレルギー性喘息は、先進国で最も一般的な疾患の2つであり、米国では人口の半数が少なくとも1つの一般的なアレルゲンに対するアレルギー反応検査で陽性反応を示しています。この種の疾患の罹患率は過去10年間で上昇していることが示されています。
さらに、アレルギーには遺伝的要素があると推定されており、遺伝的要素に関する知識が疾患を理解する鍵となることが示唆されている。
アレルギーや喘息に関与する遺伝子は、免疫プロセスと炎症プロセスの両方に関与していることが示されています。これらの遺伝子は、自然免疫系の一部を構成するタンパク質ファミリーであるToll受容体（LTR）ファミリーに属しています。これらの受容体は膜貫通型であり、広範囲の感染性病原体によって発現される分子パターンを認識し、それによって炎症反応を刺激するとともに、自然免疫と獲得免疫の間のリンクとなっています。これらの受容体の他に、アレルギー遺伝子に関連するサイトカイン、ケモカイン、その他の転写因子が存在します。[ 2 ]
遺伝子座と猫アレルギー、ダニ、花粉の関係を調べるために、質問票と23andMe ALSPACの母親との関連性が調査されました。
彼らは、ヒトゲノム全体にわたる遺伝的変異を分析して観察可能な形質との関連性を特定するゲノムワイド関連解析（GWA）に関する数多くの研究を実施してきた。この場合、研究されている関連性は、SNP（一塩基多型）とアレルギーとの間の多型である。したがって、1つまたは複数のSNPの出現または欠失が疾患表現型に現れると結論付けることができる。[ 3 ]
アレルギーに関するGWA研究の共通効果が実施され、過去のGWA研究でアレルギー症状やその他の免疫関連表現型または喘息との有意な関連性が認められた22の遺伝子座が特定されたため、これはメタアナリシスである。
さらに、染色体6上の単一遺伝子座特異的アレルギー、すなわち主要組織適合性複合体（MHC）領域に、猫アレルギーの影響と明らかに相関する証拠が見つかっている。[ 4 ]
eQTL解析では、量的形質に関連する遺伝子座を特定し、アレルギーなどの形質に関連する遺伝子座の発現研究を機能的な説明とともに実施します。これらの研究を通じて、アレルギーに関連する遺伝子座と、以前に自己免疫疾患に関与しているとされた遺伝子座との重複が観察されました。したがって、染色体5の領域には、プロスタグランジン受容体をコードするPTGER4の経路にあるアレルギー性喘息に関連する遺伝子座が存在し、染色体上で互いに近接する2つの対立遺伝子間の連鎖不平衡（LD）を示します。これは、脊椎炎の疾患に関連する他のSNPと大きなLDを示すため、ランダムな共遺伝で予想されるよりも頻繁に発生します。さらに、アレルギーに関連する多くの遺伝子座は、 Tヘルパー細胞の分化に関与する遺伝子の近くにあります。分析によると、この関連性はeQTLである可能性があり、なぜなら当該SNPに関連する遺伝子は、動物モデルにおいてTヘルパー2型細胞の分化を抑制する転写因子であるBCL6の発現を引き起こすからである。
多くの自己免疫疾患はTh1応答の活性化亢進と関連しており、アレルギーはTH2の活性と関連しているため、これらの結果はTH1とTH2の活性のバランスに影響を与える因子、および両方の応答に寄与する要素を特定するのに役立つ可能性がある。[ 5 ]