エプスタイン・バーウイルスがコードする小さなRNA

エバー1
エバー1
	EBER1 の保存された二次構造。
識別子
シンボル	エバー1
Rfam	RF01789
その他のデータ
RNAタイプ	遺伝子
ドメイン	エプスタイン・バーウイルス
PDB構造	PDBe

エプスタイン・バーウイルスにコードされた小さなRNA（EBER）は、エプスタイン・バーウイルス（EBV）に感染したヒト細胞の核に局在する小さな非コードRNAです。1981年に初めて発見されたEBERは、感染細胞に存在する最も豊富なRNAです。 ^{[1] EBERはいくつかの宿主タンパク質と相互作用して}リボ核タンパク質（RNP）複合体を形成します。EBERの正確な機能はまだ不明ですが、形質転換と腫瘍形成における役割が提案されています。また、感染細胞から放出されたエクソソームに存在することが示されており、細胞間相互作用に関与している可能性があります。^[2]^[3]

背景

EBER1とEBER2はそれぞれ167ヌクレオチドと172ヌクレオチドの短い核濃縮非コードRNAである。これら2つのRNAはEBVの潜伏感染中に宿主のRNAポリメラーゼIIIによって転写される。^[4]^[5]

EBER1と2は、顕著な表現型の変化なしにウイルスゲノムから削除することができますが、自然界で削除された例は発見されていません。^{[4] EBERの発現のみで、}重症複合免疫不全マウスに腫瘍を誘発することができます。^[6]^[7]

エバー1

EBER1はヒトリボソームタンパク質L22と結合し^{[8] 、このタンパク質を}核小体から核質へ移動させます。^[9] EBER1は少なくとも3つの宿主hnRNP（A1、A2 / B1、およびD / AUF1）と特異的に相互作用します。^[10]

エバー2

EBER1 と同様に、EBER2 は潜伏感染細胞で非常に高い発現を示します。EBER1 とは異なり、EBER2 の配列は関連ヘルペスウイルスではあまり保存されていません (約 50% の保存)。しかし、EBER2 の二次構造は高度に保存されています(図 1 を参照)。EBER2 は、末端の反復ウリジン領域でのみ細胞タンパク質 (具体的にはLa ドメイン) に結合することが知られています。ただし、EBER2 の他の特徴、特に 2 つの長く高度に保存されたステムループは、未知のタンパク質の結合部位として機能する可能性があると考えられています。 ^[11]

リチャード・アンビンダーは、1990年に臨床検体中のエプスタイン・バーウイルスの検出にEBER in situハイブリダイゼーションを応用した先駆者です。 ^[12] EBV潜伏感染細胞におけるEBERターゲットの豊富さと、ホルマリン固定パラフィンワックス包埋組織切片における非同位体法の容易さにより、EBER in situハイブリダイゼーションは臨床診療に非常に適していました。^[13]^[14]^[15] EBER検出は、日常的な診断組織病理学の不可欠な要素となっています。^[16]^[17]

参考文献

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外部リンク

Rfamのヒトヘルペスウイルス 1 核小体小 RNA のページ
Rfamの EBER1 のページ
Rfamの v-snoRNA1 のページ
Rfamの IRES_EBNA のページ
エプスタイン・バーウイルスの安定イントロン配列RNA

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