DNAスパイク

DNA スパイキングはカスタム スパイキングとも呼ばれ、オリゴヌクレオチドを合成する際に、単一の縮重位置で異なる比率の塩基を使用することです。DNA スパイキングは、特定の位置での塩基の比率が不均等なことです (たとえば、アデニン10% 、グアニン75% 、シトシン5% 、チミン10% )。たとえば、縮重コードR = A + G の場合、R 位置が 50% の確率でアデニンになり、残りの 50% の確率でグアニンになります。ただし、DNA スパイキングでは、R 位置が 70% の確率でアデニンになり、30% の確率でグアニンになる可能性があります。比率は 70:30 である必要はなく、12:82 や 64:36 など他の比率にすることもできます。^[1]

DNAスパイクはPCRにおけるスパイクコントロールを指すこともあります。これは、反応に何らかのシグナル（例えばプラスミドや特定の既知の配列を持つ合成DNA）を提供するサンプルにDNAを添加し、反応が増幅するかどうかを調べることです。この方法はPCR法が正しく機能しているかどうかを確認するために使用されます。PCRマシンではDNAが適切に増幅されない可能性があるため、スパイクDNAを追加することでDNAがどれだけ生成されるかを観察できます。次に、マシンが正常に動作している場合に理論的に予測されるDNA量と比較することで、不具合を発見できます。^[2]

• RNAスパイクイン