クロロフレクサレス

クロロフレクサレス
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	クロロフレクソタ
クラス：	クロロフレクシア
注文：	クロロフレクサ; レスグプタ他 2013
家族
	クロロフレキシナ科クロロフレックス科; オシロクロリダ科; ; ロゼイフレキシナ科バラ科; ;

クロロフレクサレスはクロロフレクシア綱に属する細菌の目である。^[1]この系統は糸状無酸素性光栄養細菌（FAP）^[2]としても知られており、酸素を生成しない光栄養生物が含まれる。これらの細菌は通性好気性である。 ^{[3]一般に酸素が存在する場合は}化学栄養を使用し、そうでない場合は光由来のエネルギーに切り替える。ほとんどの種は従属栄養生物であるが、少数は光独立栄養が可能である。^[2]

この目は2つの亜目に分けられる。Chloroflexineae （「緑色のFAP」、「緑色の非硫黄細菌」）の方がよく知られている。この亜目は、特殊なアンテナ複合体であるクロロソームを使用して、光エネルギーを反応中心に伝達する。一方、 Roseiflexineae（「赤色のFAP」）にはそのような能力がない。名前の付いた色は絶対的なものではなく、酸素濃度などの成長条件により、緑色のFAPは色素組成の変化を誘発して、緑、茶色、または赤みがかったオレンジに見える。^[2]

分類

現在受け入れられている分類法は、原核生物の命名法リスト（LPSN）^[4]と国立生物工学情報センター（NCBI） ^[5]に基づいています。

バラ亜目Gupta et al. 2013年
- Roseiflexaceae 科Gupta et al. 2013 ["Kouleotrichaceae" Mehrshad et al. 2018 ]
  - Kouleothrix 属Kohno et al. 2002
  - ヘリオトリクス 属Pierson et al. 1986年
  - ロセイフレクサス 属Hanada et al. 2002年
クロロフレキシン亜目Gupta et al. 2013年
- クロロフレックス科Gupta et al. 2013
  - Genus Candidatus Chloranaerofilum Thiel et al. 2016年
  - Genus Chloroflexus Pierson & Castenholz 1974 [「クロロクリニス」]
- オシロクロリダ科Gupta et al. 2013
  - Candidatus属Chloroploca Gorlenko et al. 2014年
  - クロロネマ属♪ Dubinina & Gorlenko 1975
  - オシロクロリス 属ゴレンコ＆ピボバロワ 1989
  - Genus Candidatus Viridilinea Grouzdev et al. 2018年

系統発生

参照

細菌目一覧

参考文献

^ ギャリティ、ジョージ・M. (2001)。バーギーの系統的細菌学マニュアル（第2版）。ニューヨーク：シュプリンガー。pp. 427–446。ISBN 978-0-387-21609-6。
^ abc Thweatt, Jennifer L.; Canniffe, Daniel P.; Bryant, Donald A. (2019). 「緑色細菌におけるクロロフィルとバクテリオクロロフィルの生合成」。植物研究の進歩。90 :35–89。doi : 10.1016 /bs.abr.2019.03.002。
^ Gupta RS、Chander P、George S (2013)。「Chloroflexia綱とそのさまざまな系統群の系統発生学的枠組みと分子シグネチャー、Chloroflexia綱の新種[訂正]を、修正されたOscillochloridaceae科とChloroflexaceae科の新種からなるChloroflexineae亜目新種と、Roseiflexaceae科の新種を含むRoseiflexineae亜目新種に分割する提案」。Antonie van Leeuwenhoek。103 ( 1 ): 99–119。doi :10.1007/s10482-012-9790-3。PMID 22903492 。
^ JP Euzéby. 「Chloroflexales」。命名法で定められた原核生物名のリスト(LPSN) 。 2022年7月20日閲覧。
^ Sayers; et al. "Chloroflexales".国立生物工学情報センター(NCBI) 分類データベース. 2022年7月20日閲覧。
^ 「The LTP」。 2023年5月10日閲覧。
^ 「LTP_all tree in newick format」。2023年5月10日閲覧。
^ 「LTP_06_2022 リリースノート」(PDF) 。 2023年5月10日閲覧。
^ 「GTDBリリース08-RS214」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。
^ "bac120_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。
^ 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。

外部リンク

[1] ギャリティ、ジョージ・M. (2001)。バーギーの系統的細菌学マニュアル（第2版）。ニューヨーク：シュプリンガー。pp. 427–446。ISBN 978-0-387-21609-6。

[Th19-2] Thweatt, Jennifer L.; Canniffe, Daniel P.; Bryant, Donald A. (2019). 「緑色細菌におけるクロロフィルとバクテリオクロロフィルの生合成」。植物研究の進歩。90 :35–89。doi : 10.1016 /bs.abr.2019.03.002。

[pmid22903492-3] Gupta RS、Chander P、George S (2013)。「Chloroflexia綱とそのさまざまな系統群の系統発生学的枠組みと分子シグネチャー、Chloroflexia綱の新種[訂正]を、修正されたOscillochloridaceae科とChloroflexaceae科の新種からなるChloroflexineae亜目新種と、Roseiflexaceae科の新種を含むRoseiflexineae亜目新種に分割する提案」。Antonie van Leeuwenhoek。103 ( 1 ): 99–119。doi :10.1007/s10482-012-9790-3。PMID 22903492 。

[4] JP Euzéby. 「Chloroflexales」。命名法で定められた原核生物名のリスト(LPSN) 。 2022年7月20日閲覧。

[5] Sayers; et al. "Chloroflexales".国立生物工学情報センター(NCBI) 分類データベース. 2022年7月20日閲覧。

[6] 「The LTP」。 2023年5月10日閲覧。

[7] 「LTP_all tree in newick format」。2023年5月10日閲覧。

[8] 「LTP_06_2022 リリースノート」(PDF) 。 2023年5月10日閲覧。

[about-9] 「GTDBリリース08-RS214」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。

[tree-10] "bac120_r214.sp_label".ゲノム分類データベース. 2023年5月10日閲覧。

[taxon_history-11] 「分類の歴史」。ゲノム分類データベース。 2023年5月10日閲覧。