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| CAMP受容体タンパク質 | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
 大腸菌サイクリックAMP受容体タンパク質の構造。 | |||||||
| 識別子 | |||||||
| シンボル | ＣＲＰ | ||||||
| 代替記号 | キャップ | ||||||
| NCBI遺伝子 | 947867 | ||||||
| ＰＤＢ | 1I5Z | ||||||
| 参照シーケンス | NP_417816.1 | ||||||
| ユニプロット | 翻訳 | ||||||
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cAMP 受容体タンパク質( CRP 、カタボライト活性化タンパク質、CAPとも呼ばれる) は、細菌の調節タンパク質です。
タンパク質
CRPタンパク質は環状アデノシン一リン酸（cAMP）に結合し、構造変化を引き起こし、CRPが制御する遺伝子のプロモーター内の特定のDNA部位にしっかりと結合できるようにします。 [1] [ 2] CRPはその後、 RNAポリメラーゼとの直接的なタンパク質間相互作用を通じて転写を活性化します。[1] [2]
CRPによって制御される遺伝子は、ガラクトース、クエン酸、PEP基転座システムなど、エネルギー代謝に関与するものがほとんどです。[3] [4]大腸菌では、CRPは100以上の遺伝子の転写を制御できます。[5]
CRPを活性化するシグナルは、環状AMPの結合です。CRPへのcAMPの結合は、タンパク質のN末端cAMP結合ドメインからC末端ドメインへの長距離シグナル伝達を引き起こし、DNAの特定の配列との相互作用を担います。[6]
「クラス I」CRP 依存性プロモーターでは、CRP はコアプロモーター要素の上流に位置する DNA 部位に結合し、CRP の「活性化領域 1」とRNA ポリメラーゼα サブユニットの C 末端ドメインとの間のタンパク質間相互作用を介して転写を活性化します。[1] [2] [7]「クラス II」CRP 依存性プロモーターでは、CRP はプロモーター -35 要素と重複する DNA 部位に結合し、2 セットのタンパク質間相互作用を介して転写を活性化します。(1) CRP の「活性化領域 1」とRNA ポリメラーゼα サブユニットの C 末端ドメインとの間の相互作用、および (2) CRP の「活性化領域 2」とRNA ポリメラーゼα サブユニットの N 末端ドメインとの間の相互作用です。[1] [2] 「クラス III」CRP 依存性プロモーターでは、CRP は 1 つ以上の「コアクチベーター」タンパク質と一緒に機能します。[1] [2]
ほとんどのCRP依存性プロモーターでは、CRPは主にまたは排他的に「リクルートメント」メカニズムを通じて転写を活性化します。このメカニズムでは、CRPとRNAポリメラーゼ間のタンパク質間相互作用がRNAポリメラーゼのプロモーターへの結合を助けます。 [1]
参考文献
- ^ abcdef Busby S., Ebright RH. (1999). 「カタボライト活性化タンパク質 (CAP) による転写活性化」J. Mol. Biol . 293 (2): 199– 213. doi :10.1006/jmbi.1999.3161. PMID 10550204.
- ^ abcde Lawson CL, Swigon D, Murakami KS, Darst SA, Berman HM, Ebright RH (2004). 「カタボライト活性化タンパク質：DNA結合および転写活性化」. Curr . Opin. Struct. Biol . 14 (1): 10– 20. doi :10.1016/j.sbi.2004.01.012. PMC 2765107. PMID 15102444.
- ^ Weickert MJ、Adhya S (1993). 「大腸菌のガラクトースレギュロン」。モル。微生物。10 (2): 245–51 .土井:10.1111/j.1365-2958.1993.tb01950.x。PMID 7934815。S2CID 6872903 。
- ^ Bott M (1997). 「腸内細菌における嫌気性クエン酸代謝とその調節」Arch. Microbiol . 167 ( 2–3 ): 78–88 . doi :10.1007/s002030050419. PMID 9133329. S2CID 22913073.
- ^ Fic, E.; Bonarek, P.; Gorecki, A.; Kedracka-Krok, S.; Mikolajczak, J.; Polit, A.; Tworzydlo, M.; Dziedzicka-Wasylewska, M.; Wasylewski, Z. (2008-11-25). 「タンパク質のシグナル伝達モデルとしての Escherichia coli 由来の cAMP 受容体タンパク質 – レビュー」Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology . 17 (1): 1– 11. doi :10.1159/000178014. ISSN 1464-1801.
- ^ Popovych, N.; Tzeng, S.-R.; Tonelli, M.; Ebright, RH; Kalodimos, CG (2009). 「カタボライト活性化タンパク質の cAMP を介したアロステリック制御の構造的基礎」Proceedings of the National Academy of Sciences . 106 (17): 6927– 6932. doi : 10.1073/pnas.0900595106 . PMC 2678429 . PMID 19359484.
- ^ Hudson, BP; Quispe, J.; Lara-Gonzalez, S.; Kim, Y.; Berman, HM; Arnold, E.; Ebright, RH; Lawson, CL (2009). 「完全な活性化因子依存性転写開始複合体の3次元EM構造」。米国科学アカデミー紀要。106 (47): 19830– 19835。doi : 10.1073 / pnas.0908782106。PMC 2775702。PMID 19903881。