バーバラ・エンゲルハート

バーバラ・エリザベス・エンゲルハートは、アメリカのコンピューター科学者であり、バイオインフォマティクスの専門家です。スタンフォード大学の教授として、潜在変数モデル、ゲノムデータの探索的データ解析、QTLの研究に取り組んでいます。^[1] 2021年、彼女は国際計算生物学会からオーバートン賞を受賞しました。

エンゲルハートはスタンフォード大学で記号システムの理学士号とコンピュータサイエンスの理学修士号を取得しました。2008年にカリフォルニア大学バークレー校でマイケル・I・ジョーダンの指導のもと博士号を取得しました。^[3] 

エンゲルハートは、2008年から2011年までシカゴ大学人類遺伝学科でマシュー・スティーブンスとともに博士研究員として勤務した。 ^{[4] 2011年に}デューク大学の生物統計学およびバイオインフォマティクス学科の助教授に  就任。2014年にプリンストン大学の助教授に就任し、2017年に終身在職権を持つ准教授に昇進した。^[5] 2022年8月にカリフォルニアに移り、現在はスタンフォード大学およびグラッドストーンデータサイエンスおよびバイオテクノロジー研究所の教授を務めている。^{[6] [7]}

スタンフォード大学を卒業後、エンゲルハートはジェット推進研究所の人工知能グループで2年間働き、自律型宇宙船の計画とスケジュール作成に取り組んだ。^[8]バークレー大学の大学院生として、彼女はタンパク質機能注釈の統計モデルとオントロジーの推論のための統計フレームワークを開発した。^{[9] [10]}ポスドク研究では、彼女は集団構造のためのスパース因子分析モデル^[11]と関連性検定のためのベイズモデルを開発した。^[12]

教員として、エンゲルハートの研究の大部分は、ゲノムデータの潜在変数モデルと探索的データ分析の開発、^[13]および発現QTLの関連性検定の統計モデルの開発に焦点を当てていました。^{[14]遺伝子型組織発現（GTEx）コンソーシアムのメンバーとして、彼女のグループはGTEx v6 [15]}およびv8データにおけるトランスeQTLの発見と分析を担当しました。^[16]

任期終了後、エンゲルハートの潜在変数モデルに関する研究は、単一細胞シーケンシングを含むように拡大し、特に空間トランスクリプトミクスに焦点を当てています。^[17]  また、彼女は文脈的多腕バンディットを用いたベイズ実験設計に関する研究も行っており、この研究を新種問題に応用して、アトラス構築のための単一細胞データ収集に役立てています。^[18]彼女の研究は、電子医療記録のための機械学習にも拡大しています。^{[19] [20]}

エンゲルハートの研究はQuanta Magazineで取り上げられている。2017年にはTEDxで「何ではなくなぜ：ゲノムを理解するための機械学習」と題した講演を行った。 ^[21]

エンゲルハートの研究は、国立衛生研究所から2つのR01助成金と他のいくつかのメカニズムを通じて資金提供を受けています。エンゲルハートは、計算生物学におけるアルフレッド・P・スローンフェローシップ^[22] 、国立科学財団CAREER賞^{[23] 、}ヒト細胞アトラスに対する2つのチャン・ザッカーバーグ・イニシアチブ助成金^[24]、COVID-19に関する最近の研究に対するファスト助成金^[25]など、いくつかの賞を受賞しています。2021年には、国際計算生物学会からオーバートン賞を受賞しました。^[26]

エンゲルハートのポスドク研究はNIH NHGRI K99助成金^[27]によって部分的に資金提供され、博士号はNSF大学院研究フェローシップと2005年のGoogle Anita Borg奨学金によって部分的に資金提供されました。^[28]彼女は2004年にSMBEのウォルター・M・フィッチ賞を受賞しました。^[29]

エンゲルハートは、Women in Machine Learningの理事会（2014～2017年）および上級諮問委員会（2017年～現在）に所属していました。^[30]彼女は、国際機械学習会議（ICML、2018～2022年）の多様性と包括性の共同議長です。^[31] 2019年には、人工知能ワーキンググループのディレクターに対するNIH諮問委員会のメンバーでした。 ^[32]