Loading article…
| AP2ドメイン | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 DNAと複合体を形成したGCCボックス結合ドメインの構造。[1] | |||||||||||
| 識別子 | |||||||||||
| シンボル | AP2 | ||||||||||
| パム | PF00847 | ||||||||||
| ファム一族 | CL0081 | ||||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||||
| 頭いい | SM00380 | ||||||||||
| プロサイト | PS51032 | ||||||||||
| SCOP2 | 3gcc / スコープ / SUPFAM | ||||||||||
| |||||||||||
| アペタラ 2 | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 識別子 | |||||||
| シンボル | AP2 | ||||||
| NCBI遺伝子 | 829845 | ||||||
| ユニプロット | P47927 | ||||||
| |||||||
アペタラ 2 (AP2)は遺伝子であり、転写因子の大きなファミリーである AP2/ EREBPファミリーのメンバーです。シロイヌナズナでは、AP2 は花の発達の ABC モデルで役割を果たしています。[2]このタンパク質ファミリーは当初、植物に特有のものであると考えられていましたが、最近の研究では、マラリアの原因物質である Plasmodium falciparum を含むアピコンプレックス類が、ApiAP2 ファミリーと呼ばれる関連する転写因子セットをコードしていることが示されています。[3]
A. thaliana転写因子RAV1では、N末端 AP2ドメインは5'- CAACA -3'配列に結合し、C末端の高度に保存されたB3ドメインは5'- CACCTG -3'配列に結合する。[4]
AP2の構造と生物学的含有量
最近の研究により、Apetala 2は、花やAGAMOUSなどの植物に特有のホルモン調節において主要な役割を果たしていることがわかりました。[5]これを決定したOgawaによる研究は、遺伝子発現におけるApetala 2とAtEBPの関係を明らかにするために作成されました。 結果は、AtEBPの過剰発現が葉でのAP2発現の上方制御を引き起こすことを示しており、これはN末端領域がAP2様表現型を生成するのに必要ではないことを示唆しています。[6] AP2はANTと呼ばれる別の化合物も構成しており、エチレン応答要素結合タンパク質のDNA結合ドメインと相同な2つのAP2ドメインで構成されています。[7] Maes, T.による「ペチュニアAp2様遺伝子と花と種子の発育におけるそれらの役割」と題された別の研究では、ペチュニアから3つのAP2様タンパク質を発見し、in situハイブリダイゼーションでそれらの発現パターンを研究することで、PhAP2A、PhAP2B、およびPhAP2Cが発見されました。 PhAP2Aは、 A. thalianaのAP2と非常によく似た機能を持ち、ほぼ正確な遺伝子配列を持っていることが判明しました。PhAP2BとPhAP2Cは、転写因子のAP2ファミリーの異なるサブグループに属するAP2様タンパク質をコードし、花の発達中にPhAP2Aとは非常に異なる発現パターンを示します。[8]
AP2と化合物の関連性
Apetala 2の変異は、種子の発達中にヘキソースとスクロースの比率の変化を引き起こし、AP2が糖代謝への影響を通じて種子の質量を制御する可能性を開きます。[9]タンパク質として、システム内の糖の量を調整し、輸送、成形、およびシグナル伝達に関与しています。別の研究では、非生物的ストレス応答におけるDBF1の機能性を分析し、DBF1を過剰発現するシロイヌナズナ植物は、対照植物よりも浸透圧ストレスに耐性があることがわかりました。[10] DBF1は、Apetala 2が転写因子を実行するのを助ける結合因子です。
病気
DNAは常に変異を受けており、変異したタンパク質によってタンパク質の機能が完全に変化し、場合によっては病気を引き起こすことがあります。たとえば、AP2の研究では、ERF / AP2型転写因子が差動ディスプレイ逆転写PCRによって単離され、葉に過敏反応を引き起こしました。[11]アラビドプシスCBF遺伝子ファミリーは、AP2ドメインを含むタンパク質をコードする3つの遺伝子で構成されており、これらはすべて低温によって遺伝子発現を制御されますが、アブシジン酸や脱水によって制御されることはありません。[12]
参考文献
- ^ Allen MD、Yamasaki K、Ohme-Takagi M、Tateno M、Suzuki M (1998 年 9 月)。「DNA と複合体を形成した GCC ボックス結合ドメインの溶液構造から明らかになったベータシートによる DNA 認識の新しいモード」。EMBO J. 17 (18): 5484–96. doi : 10.1093/emboj/17.18.5484. PMC 1170874. PMID 9736626 。
- ^ Riechmann JL、Meyerowitz EM (1998)。「植物転写因子のAP2/EREBPファミリー」。Biol . Chem . 379 (6): 633–46. doi : 10.1515/bchm.1998.379.6.633 . PMID 9687012。
- ^ Balaji S、Babu MM、Iyer LM、Aravind L (2005)。「アピコンプレックスの主要な特異的転写因子の発見と、AP2インテグラーゼDNA結合ドメインの進化への影響」。核酸 研究。33 ( 13 ) : 3994–4006。doi :10.1093/nar/gki709。PMC 1178005。PMID 16040597。
- ^ Kagaya Y, Ohmiya K, Hattori T (1999). 「新規 DNA 結合タンパク質 RAV1 は、高等植物に特有の 2 つの異なる DNA 結合ドメインを介して二分認識配列に結合する」Nucleic Acids Res . 27 (2): 470–8. doi :10.1093/nar/27.2.470. PMC 148202 . PMID 9862967.
- ^ Arabidopsis thaliana エチレン応答性エレメント結合タンパク質と植物花卉ホメオティック遺伝子 APETALA2 の相互制御。Ogawa , T., Uchimiya, H., Kawai-Yamada, M. Ann. Bot. (2007)
- ^ 花成調節因子 AGAMOUS の機能ドメイン: DNA 結合ドメインの特徴と優性負性変異の解析。Mizukami , Y., Huang, H., Tudor, M., Hu, Y., Ma, H. Plant Cell (1996)
- ^ アラビドプシスの胚珠と雌配偶体の発達に必要な AINTEGUMENTA 遺伝子は、花のホメオティック遺伝子 APETALA2 と関連しています。Klucher , KM, Chow, H., Reiser, L., Fischer, RL Plant Cell (1996)
- ^ ペチュニア Ap2 様遺伝子と花と種子の発生におけるそれらの役割。 Maes, T.、Van de Steene, N.、Zethof, J.、Karimi, M.、D'Hauw, M.、Mares, G.、Van Montagu, M.、Gerats, T. Plant Cell (2001)
- ^ APETALA2による種子質量の制御。Ohto , MA, Fischer, RL, Goldberg, RB, Nakamura, K., Harada, JJ Proc. Natl. Acad. Sci. USA (2005)
- ^ R3Hドメインを含むトウモロコシDBF1相互作用タンパク質1は、ストレス応答におけるDBF1活性の潜在的な調節因子である。Saleh , A.、Lumbreras, V.、Lopez, C.、Kizis, ED、Pagès, M. Plant J. (2006)
- ^ トウガラシ転写因子 CaPF1 はシロイヌナズナに病原体耐性と凍結耐性を与える。Yi , SY, Kim, JH, Joung, YH, Lee, S., Kim, WT, Yu, SH, Choi, D. Plant Physiol. (2004)
- ^ アラビドプシス CBF 遺伝子ファミリーは、低温によって発現が制御されるが、アブシジン酸や脱水によって制御されない AP2 ドメイン含有タンパク質をコードする 3 つの遺伝子で構成されています。Medina , J.、Bargues, M.、Terol, J.、Pérez-Alonso, M.、Salinas, J. Plant Physiol. (1999)
外部リンク
- APETALA2+タンパク質、+Arabidopsis、米国国立医学図書館医学件名表(MeSH)
- AP2 ファミリー[永久リンク切れ ]、 ERF ファミリー[永久リンク切れ ]、 RAV ファミリー PlantTFDB: 植物転写因子データベース