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| 5.8SリボソームRNA | |
|---|---|
 | |
| 識別子 | |
| シンボル | 5_8S_rRNA |
| Rfam | RF00002 |
| その他のデータ | |
| RNAタイプ | 遺伝子; rRNA |
| ドメイン | 真核生物;古細菌[要出典] |
| 行く | GO:0003735 GO:0005840 |
| それで | 0000375 ... |
| PDB構造 | PDBe |
分子生物学では、5.8SリボソームRNA（5.8S rRNA）は、真核生物リボソームの大サブユニットの非コードRNA成分であり、タンパク質翻訳において重要な役割を果たしています。これは、18S rRNAと28S rRNAも含む45S前駆体の一部としてRNAポリメラーゼIによって転写されます。その機能はリボソーム転座にあると考えられています。[1]また、 p53腫瘍抑制タンパク質と共有結合を形成することも知られています。 [2] 5.8S rRNAは、 miRNA検出の参照遺伝子として使用できます。 [3] 5.8SリボソームRNAは、細胞内の他のrRNAプロセスと経路をよりよく理解するために使用されます。[4]
5.8S rRNAは非真核生物のLSU rRNAの5'末端と相同性がある。真核生物では、ITS2の挿入によりLSU rRNAが5.8S rRNAと28S rRNAに分割される。[5]ハエの中には5.8 rRNAがさらに2つに分割されているものもある。[6]
構造
L567.5 rRNAの構造はおよそ150ヌクレオチドの大きさで、多数の折り畳まれた鎖から成り、そのうちのいくつかは一本鎖であると推定されている。[7] このリボソームRNAは、28Sおよび5S rRNA、ならびに46個のリボソームタンパク質とともに、リボソーム大サブユニット（LSU）を形成している。[7] 5.8S rRNAは、ITS 1およびITS 2（内部転写スペーサー）および5'および3' ETS（外部転写スペーサー） とともに、18Sおよび28S rRNAとともに45SプレリボソームRNAに最初に転写される。[8] 5.8S rRNAは2つのITS領域の間に位置し、ITS1は5'方向で18S rRNAから分離し、ITS2は3'方向で28S rRNAから分離します。ITSとETSはrRNAの成熟中に切断されます。これは、エンドヌクレアーゼとエキソヌクレアーゼの両方の酵素によって実行される連続切断経路によって達成され、特定の位置でスペーサーを切断します。[8]
参考文献
- ^ Abou Elela S、Nazar RN (1997 年5 月)。「リボソーム転座における 5.8S rRNA の役割」。核酸研究。25 (9): 1788–1794。doi : 10.1093 / nar /25.9.1788。PMC 146658。PMID 9108162。
- ^ Fontoura BM、Atienza CA、 Sorokina EA、Morimoto T 、 Carroll RB (1997 年 6 月)。「細胞質 p53 ポリペプチドはリボソームと関連している」。分子細胞生物学。17 (6): 3146–3154。doi : 10.1128/MCB.17.6.3146。PMC 232167。PMID 9154813。
- ^ Shi R, Chiang VL (2005年10月). 「リアルタイムPCRによるマイクロRNA発現の定量化のための簡易手段」. BioTechniques . 39 (4): 519–525. doi : 10.2144/000112010 . PMID 16235564.
- ^ Nazar RN (1984年6月). 「リボソーム5.8S RNA：真核生物への適応か、それとも処理変異体か？」. Canadian Journal of Biochemistry and Cell Biology . 62 (6): 311–320. doi :10.1139/o84-044. PMID 6380683.
- ^ Lafontaine, DLJ; Tollervey, D. (2001). 「リボソームの機能と合成」. Nature Reviews Molecular Cell Biology . 2 (7): 514–520. doi :10.1038/35080045. hdl : 1842/729 . PMID 11433365. S2CID 2637106.
- ^ Shimada, T. (1992年8月). 「双翅目昆虫における分割5.8SリボソームRNAの分布」.昆虫分子生物学. 1 (1): 45–48. doi :10.1111/j.1365-2583.1993.tb00076.x. PMID 1343775. S2CID 46570307.
- ^ ab Walker TA、Pace NR （1983年6月）。「5.8SリボソームRNA」。Cell.33 （ 2）：320–322。doi ：10.1016/0092-8674（ 83 ）90413-0。PMID 6861202 。
- ^ ab Henras AK、Plisson-Chastang C、O'Donohue MF、Chakraborty A、Gleizes PE (2014 年 10 月 27 日) 。 「真核生物におけるプレリボソームRNA処理の概要」。Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA。6 ( 2): 225–242。doi :10.1002/wrna.1269。PMC 4361047。PMID 25346433。
外部リンク
- Rfamの 5.8S リボソーム RNA のページ
- アラビドプシス 5.8S rRNA 配列
- イネ5.8S rRNA配列