28SリボソームRNA

28SリボソームRNAは、真核生物の細胞質リボソームの大サブユニット（LSU）の構造リボソームRNA（rRNA）であり、すべての真核細胞の基本構成要素の1つです。植物では25S、哺乳類では28Sのサイズであるため、 25S-28S rRNAという別名があります。^[1]

5.8S rRNAを5'側に結合させたものは、原核生物の23Sおよびミトコンドリアの16SリボソームRNAの真核生物核相同体である。^[2]^[3]^[4]

系統発生における使用

28S rRNAをコードする遺伝子は28S rDNAと呼ばれます。これらの遺伝子の配列の比較は、原生生物^[5]、真菌^[6]、昆虫^[7]、クモ形類^[8]、クマムシ^{[9]、脊椎動物[} 10 ]などの系統樹を構築するための分子解析に使用されることがあります。^[^11]

構造

28S rRNAは通常4000～5000ヌクレオチド長である。^[12]

一部の真核生物は28S rRNAを2つの部分に切断してから両方をリボソームに組み立てるが、この現象は「隠れた切断」と呼ばれる。^[12]

データベース

いくつかのデータベースでは、比較目的で LSU rRNA 配列のアラインメントと注釈を提供しています。

RDP、^[13]リボソームデータベースプロジェクト; ^[14]^[15]
SILVA、リボソームRNA遺伝子データベースプロジェクト。^[16]

参考文献

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