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| キサンタンリアーゼ | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| EC番号 | 4.2.2.12 | ||||||||
| CAS番号 | 113573-69-6 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | BRENDAエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZyme ビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイク | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| 遺伝子オントロジー | アミゴー / クイックゴー | ||||||||
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キサンタンリアーゼ酵素（EC 4.2.2.12）は 次のプロセス を触媒します。
- 多糖類キサンタンの側鎖の末端β- D -マンノシル-(1→4)-β- D -グルクロノシル結合の除去的切断により、側鎖の末端に4-デオキシ-α- L -トレオ-ヘキサ-4-エンウロノシル基が残る。
これはリアーゼファミリーに属し、特に多糖類に作用する炭素酸素リアーゼです。キサンタンリアーゼは1987年に初めて同定され、部分的に精製されました。[1]
キサンタンは、植物病原菌のキサントモナス・カンペストリスなど、いくつかの異なる細菌分類群によって分泌される多糖類であり、セルロースをベースとした主鎖と、交互にグルコシル（グルコース）残基に結合した側鎖で構成されています。[2]これらの側鎖には3つの単糖残基が含まれています。キサンタンリアーゼは、この多糖を分解するバチルス、コリネバクテリウム、バクテロイデス、ルミノコッカス科、パエニバチルス属などの細菌によって生成されます。[2] [3] [4]
産業用途
キサンタンは、食品や飲料の増粘剤、泡の安定剤、石油回収の促進剤、塗料、化粧品、爆薬などの製造に産業界で使用されています。[3]キサンタンリアーゼをキサンタンの物理的特性を変更する手段として使用することは、バイオテクノロジーの現在の研究分野です。
構造研究
2007年末現在、このクラスの酵素については7つの構造が解明されており、PDBアクセスコードは1J0M、1J0N、1X1H、1X1I、1X1J、2E22、2E24となっている。バチルス由来の酵素は、αヘリカルN末端ドメインとβシートからなるC末端ドメインの2つのドメインからなるモノマーである。[5]活性部位は、これら2つのドメインの間に位置する深い溝である。
参考文献
- ^ Sutherland IW (1987). 「キサンタンリアーゼ - さまざまな細菌種で発見された新規酵素」J. Gen. Microbiol . 133 (11): 3129–34. doi : 10.1099/00221287-133-11-3129 . PMID 3446747.
- ^ ab Hashimoto W, Miki H, Tsuchiya N, Nankai H, Murata K (1998年10月1日). 「Bacillus sp. 株 GL1 のキサンタンリアーゼは、キサンタン側鎖からピルビル化マンノースを遊離させる」. Appl. Environ. Microbiol . 64 (10): 3765–8. Bibcode :1998ApEnM..64.3765H. doi :10.1128/AEM.64.10.3765-3768.1998. PMC 106543. PMID 9758797 .
- ^ ab Ruijssenaars HJ、de Bont JA、Hartmans S (1999 年 6 月 1 日)。「Paenibacillus alginolyticus XL-1 によるキサンタン分解に関与するピルビン酸マンノース特異的キサンタンリアーゼ」。Appl . Environ. Microbiol . 65 (6): 2446–52. Bibcode :1999ApEnM..65.2446R. doi :10.1128/AEM.65.6.2446-2452.1999. PMC 91360. PMID 10347025 .
- ^ オストロフスキー、マシュー・P.; ラ・ローザ、サビーナ・レアンティ; クナス、ブノワ・J.; ロバートソン、アンドリュー; ペレイラ、ガブリエル; ハーゲン、ライブ・H.; ヴァルギース、ネハ・J.; チウ、リン; ヤオ、ティアンミン; フリント、ガブリエル; リー、ジェームズ; マクドナルド、ショーン・P.; バトナー、デュナ; パドロ、ニコラス・A.; シュニズライン、マシュー・K.; ヤング、ヴィンセント・B.; ブルーマー、ハリー; シュミット、トーマス・M.; テラポン、ニコラス; ロンバード、ヴィンセント; ヘンリサット、バーナード; ハマカー、ブルース; エミリー・A.エロエ・ファドロシュ; アシュートシュ・トリパティ; ポープ、フィリップ・B.; マルテンス、エリック・C.（2022年4月）。 「ヒト腸内細菌叢による食品添加物キサンタンガムの消費に関するメカニズムの考察」Nature Microbiology . 7 (4): 556–569. doi :10.1038/s41564-022-01093-0. hdl : 11250/3003739 . PMID 35365790. S2CID 247866305.
- ^ 橋本 渉、南海 秀、三上 武、村田 健 (2003)。「キサンタンの側鎖に作用する Bacillus sp. GL1 キサンタンリアーゼの結晶構造」。J . Biol. Chem . 278 (9): 7663–73. doi : 10.1074/jbc.M208100200 . PMID 12475987。
- Sutherland IW (1987). 「キサンタンリアーゼ - さまざまな細菌種で発見された新しい酵素」J. Gen. Microbiol . 133 (11): 3129–34. doi : 10.1099/00221287-133-11-3129 . PMID 3446747.
