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| ワレミア・イクチオファガ | |
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| W. ichthyophagaの特徴的なサルシナ様形態と NaCl の結晶を示す顕微鏡写真。 | |
| 科学的分類 | |
| 王国： | |
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| 家族： | |
| 属: | |
| 種： | ウィステリア・イクチオファガ
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| 二名法名 | |
| ワレミア・イクチオファガ ヨハン・オルセン1887
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Wallemia ichthyophagaはWallemia属の菌類3 種のうちの 1 つで、Wallemia 属はWallemiomycetes綱の唯一の属です。 [1]この系統の系統学的起源は担子菌類のさまざまな部分に位置付けられていましたが、より大規模なデータセットの分析によると、 Agaricomycotinaの姉妹群 (4 億 9,500 万年前) です。 [2] [3]当初は無性であると考えられていましたが、集団ゲノミクスにより株間の組み換えの証拠が見つかり、この種のすべての配列ゲノムで交配型遺伝子座が特定されました。 [3] [4]
これまでにW. ichthyophagaの限られた数の株のみが分離されている（天日塩田の高塩分水、にがり（海水から塩を製造する際に残留するマグネシウムを豊富に含む溶液）、塩漬けの肉など）。[1]
W. ichthyophaga は、試験管内での成長に少なくとも 1.5 M NaCl (または同等の水分活性の他の浸透圧調節物質) を必要とし、飽和 NaCl 溶液中でも繁殖します。このため、W. ichthyophaga は知られている菌類の中で最も好塩性が高く、培地に塩分がなくてもよく生育できる耐塩性菌類 (例: Aureobasidium pullulans ) や極度耐塩性菌類 (例: Hortaea werneckii ) とは区別されます。 [5]塩分なしでは生育できないのは菌類界では例外ですが、好塩性古細菌では一般的です。[6]
この菌はサルシナのような構造、つまり密集した多細胞塊の形で成長します。[1]これらは高塩分にさらされるとほぼ4倍の大きさに増加し、細胞壁は3倍に厚くなります。その結果、機能的な細胞容積が大幅に減少し、これがこの種の耐塩性メカニズムの1つであると考えられています。[7]
W. ichthyophagaの全ゲノム配列を解析した結果、この菌は配列解析された担子菌類の中で最も小さいゲノムの一つであることが明らかになった（9.6 Mbp、予測されたタンパク質はわずか4884個）。 [3]極めて耐塩性の強いH. werneckiiで観察されたものとは対照的に、W. ichthyophagaでは金属カチオントランスポーター遺伝子の拡大はほとんど見られず、その発現は塩に反応しない。一方、ハイドロフォビン（多様な機能を持ち、多くのバイオテクノロジー用途を持つ細胞壁タンパク質）は大量に存在し、これには異常に高い割合の酸性アミノ酸が含まれる。[3]酸性アミノ酸の割合が高いのは、タンパク質が高濃度の塩に適応しているためだと考えられている。[8] W. ichthyophagaのほぼすべての既知の株のゲノムを解析した後、集団ゲノム解析により、この種は単一の組み換え集団を形成することが示された。[4]
参考文献
- ^ abc ザラー、P.;シブレン・デ・ホーグ、G.シュロアーズ、HJ;フランク、JM。グンデ・シメルマン、N. (2005)。 「好熱性ワレミア属の分類と系統学 (ワレミオミセテスとワレミア目、cl. Et ord. Nov.)」。アントニー・ファン・レーウェンフック。87 (4): 311–328。土井：10.1007/s10482-004-6783-x。PMID 15928984。S2CID 4821447 。
- ^ Padamsee, M.; Kumar, TKA; Riley, R.; Binder, M.; Boyd, A.; Calvo, AM; Furukawa, K.; Hesse, C.; Hohmann, S.; James, TY; Labutti, K.; Lapidus, A.; Lindquist, E.; Lucas, S.; Miller, K.; Shantappa, S.; Grigoriev, IV; Hibbett, DS; McLaughlin, DJ; Spatafora, JW; Aime, MC (2012). 「乾燥耐性カビ Wallemia sebi のゲノムは浸透圧ストレスへの適応を明らかにし、潜在性有性生殖を示唆する」(PDF)。真菌遺伝学および生物学。49 (3): 217–226。土井：10.1016/j.fgb.2012.01.007。PMID 22326418。
- ^ abcd ザイク、J.;リュウ、Y.ダイ、W.ヤン、Z。胡、J。ゴスティン・アー、C.グンデ・シメルマン、N. (2013)。 「好塩性真菌 Wallemia ichthyophaga のゲノムとトランスクリプトームの配列決定: 塩害適応の有無」。BMC ゲノミクス。14 : 617.土井: 10.1186/1471-2164-14-617。PMC 3849046。PMID 24034603。
- ^ ab Gostinčar, Cene; Sun, Xiaohuan; Zajc, Janja; Fang, Chao; Hou, Yong; Luo, Yonglun; Gunde-Cimerman, Nina; Song, Zewei (2019). 「絶対好塩性担子菌 Wallemia ichthyophaga の個体群ゲノミクス」. Frontiers in Microbiology . 10 : 2019. doi : 10.3389/fmicb.2019.02019 . ISSN 1664-302X. PMC 6738226. PMID 31551960 .
- ^ Gostinčar, C.; Lenassi, M.; Gunde-Cimerman, N.; Plemenitaš, A. (2011).真菌の極度に高い塩分濃度への適応. 応用微生物学の進歩. 第77巻. pp. 71–96. doi :10.1016/B978-0-12-387044-5.00003-0. ISBN 9780123870445. PMID 22050822。
- ^ Gostinčar, C.; Grube, M.; De Hoog, S.; Zalar, P.; Gunde-Cimerman, N. (2010). 「菌類の極限耐性：限界の進化」FEMS Microbiology Ecology . 71 (1): 2–11. Bibcode :2010FEMME..71....2G. doi : 10.1111/j.1574-6941.2009.00794.x . PMID 19878320.
- ^ Kralj Kuncic, M.; Kogej, T.; Drobne, D.; Gunde-Cimerman, N. (2009). 「高塩分に対する好塩性真菌属 Wallemia の形態学的反応」.応用環境微生物学. 76 (1): 329–337. doi :10.1128/AEM.02318-09. PMC 2798636. PMID 19897760 .
- ^ Madern, D.; Ebel, C.; Zaccai, G. (2000). 「酵素の好塩性適応」.極限環境微生物：極限条件下での生命. 4 (2): 91–98. doi :10.1007/s007920050142. PMID 10805563. S2CID 32590023.