カブしわウイルス

カブしわウイルス
ウイルスの分類
(ランク外):	ウイルス
レルム:	リボウイルス
王国：	オルタナウイルス科
門:	キトリノビリコタ
クラス：	トルカビルセテス
注文：	トリビラ目
家族：	トムブスウイルス科
属:	ベータカルモウイルス
種：	カブしわウイルス

カブしわウイルス（TCV）は、トムブスウイルス科の植物病原ウイルスです。このウイルスは、カブ（ Brassica campestris ssp. rapa）から初めて分離されました

構造

TCV は小型 (4054ヌクレオチド) で一本鎖のプラス鎖 RNAウイルスです (ウイルス RNA は mRNA と同じ方向にあります)。一般的な植物モデルであるArabidopsis thalianaやNicotiana benthamianaなど、さまざまな種類の植物種に感染することがわかっています。そのgRNA は5 つのタンパク質をコードしています: p28 と p88 (複製)、p8 と p9 (移動)、CP (コートタンパク質またはキャプシド形成)。^[1]ウイルスの構造は 1986 年にX 線結晶構造解析を使用して 3.2オングストロームの解像度で決定されました。構造的にはトマトブッシースタントウイルスと非常によく似ています。^[2]

TCVゲノムには、ヘアピン5やコアプロモーターなど、数多くの非コードRNA要素が特徴付けられている。^[3]^[4]

レプリケーション

ウイルスRNAの複製は、p28がミトコンドリア膜に移動することで始まる。p28はミトコンドリア外膜に移動して陥入し、いくつかのp88分子が新しく形成された小胞に運ばれる。ウイルスRNAは膜に結合したp28に結合し、RNA依存性RNAポリメラーゼ、つまりp88がプラス鎖RNAの複製を開始してマイナス鎖中間体を生成する。マイナス鎖中間体は、子孫プラス鎖RNAを生成するためのテンプレートとして使用される。^[5]植物内の移動には、コートタンパク質p8、p9、およびp38が関与している。^[6]

衛星ウイルス

サテライトRNAと呼ばれる小さなヘルパーウイルスは、TCVが存在する場合にのみ植物に共感染することがわかっています。^[7]これらの非コードRNAは、 TCV感染の症状をアップレギュレーションします。サテライトRNAは、増殖するためにTCVと宿主の機構に依存しています。サテライトCはTCVの3'末端と配列相同性を共有し、サテライトDはサテライトCの5'末端と配列相同性を共有しています。^[^{引用が必要}^]

シロイヌナズナのTCV耐性

TCV とそれがArabidopsis thaliana (シロイヌナズナ) に及ぼす影響について多くの研究が行われてきました。Arabidopsis は、カブ以外のいくつかの種とともに、TCV に対して非常に感受性が高い傾向があります。感受性が高く単純であることから、優れたモデル生物となるため、研究に使用されています。研究では、Arabidopsis ではサテライト C のみが症状を引き起こすことが示されています。同じ研究で、植物がウイルスにどの程度影響を受けるかは、主に生態型によって決まることが示されており、Arabidopsis thaliana のディジョン生態型は、他のタイプよりもはるかに感受性が高いようです。^[8]また、光が Arabidopsis の TCV に対する抵抗性に影響を与えること、および植物が光にさらされていないと接種は効果がないことが判明していることも示されています。^[9] TCV に耐性のある Arabidopsis の株によって TCV のどの部分が認識されるかについても研究が行われており、それはコートタンパク質のアミノ末端であると思われます。これは、アミノ末端を持つウイルスと持たないウイルスの両方を使用して決定されました。^[10]

参考文献

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^ Zhang, G; Zhang J; Simon AE (2004). 「プラス鎖RNAウイルスレプリコンにおけるマイナス鎖合成の抑制と脱抑制」。Journal of Virology . 78 (14): 7619–7633. doi :10.1128/JVI.78.14.7619-7633.2004. PMC 434078. PMID 15220437 .
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外部リンク

ICTVdB – ユニバーサルウイルスデータベース: カブしわウイルス
家族グループ – ボルチモア方式

[Carrington_1989-1] キャリントン J、ヒートナ LA、ズイデマー D、ヒルマン BI、モリス TJ (1989)。「カブクリンクルウイルスのゲノム構造」。ウイルス学。170 (1): 219–26。土井：10.1016/0042-6822(89)90369-3。PMID 2718381。

[2] ^ Hogle JM、Maeda A、 Harrison SC (1986)。「カブシワウイルスの構造とアセンブリ。I. 3.2Å分解能でのX線結晶構造解析」。Journal of Molecular Biology。191 ( 4): 625–38。doi :10.1016/0022-2836(86)90450-x。PMID 3806676 。

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[4] Zhang, G; Zhang J; Simon AE (2004). 「プラス鎖RNAウイルスレプリコンにおけるマイナス鎖合成の抑制と脱抑制」。Journal of Virology . 78 (14): 7619–7633. doi :10.1128/JVI.78.14.7619-7633.2004. PMC 434078. PMID 15220437 .

[5] ^ Ahlquist P、Noueiry AO、Lee WM、Kushner DB 、 Dye BT (2003)。「プラス鎖RNAウイルスゲノム複製における宿主因子」。Journal of Virology。77 (15): 8181–6。doi : 10.1128 / JVI.77.15.8181-8186.2003。PMC 165243。PMID 12857886。

[6] Hacker DL、Petty IT、Wei N、Morris TJ (1992)。「RNA複製とウイルス移動に必要なカブシワウイルス遺伝子」。ウイルス学。186 (1): 1–8。doi : 10.1016 /0042-6822(92)90055-t。PMID 1727594 。

[7] ^ Altenbach SB、 Howell SH (1981)。「カブシワウイルスに関連するサテライトRNAの同定」。ウイルス学。112 ( 1 ): 25–33。doi :10.1016/0042-6822(81)90608-5。PMID 18635061 。

[8] Dempsey, D'Maris Amick (1993). 「Arabidopsis thalianato Turnip Crinkle Virus の耐性と感受性反応」. Phytopathology . 83 (10): 1021. doi :10.1094/phyto-83-1021. ISSN 0031-949X.

[9] チャンドラ・シェカラ、AC;マニシャ、グプテ。ナバラ州、デュロイ州。ライナ、スラビ;ライナ、ラメシュ。クレッシグ、ダニエル。カチュルー、プラディープ（2006 年 2 月）。「シロイヌナズナにおけるカブクリンクルウイルスに対する光依存性の過敏反応と耐性シグナル伝達」。植物ジャーナル。45 (3): 320–334。土井：10.1111/j.1365-313X.2005.02618.x。PMID 16412080。

[10] Zhao, Yajuan; Delgrosso, Leanna; Yigit, Erbay; Dempsey, D'Maris Amick; Klessig, Daniel F.; Wobbe, Kristin K. (2000). 「カブシワウイルスのコートタンパク質のアミノ末端は、耐性アラビドプシスによって認識される AVR 因子である」。分子植物微生物相互作用。13 (9): 1015–1018。doi : 10.1094/mpmi.2000.13.9.1015。PMID 10975658。