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チップ年代測定は分子年代測定で使用される技術で、時間較正された系統樹の推定を可能にします。その定義的な特徴は、進化樹の内部ノードに年齢制約を適用する必要のある従来の「ノード年代測定」方法とは対照的に、サンプルの年齢を使用して分析に時間情報を提供することです。
先端年代測定では、形態学的データと分子的データの両方を解析して、進化関係(樹形図)と系統間の分岐時間(節点時間)を推定するのが一般的です。このアプローチは「総合証拠年代測定」とも呼ばれます。ただし、先端年代測定は、形態学的特徴のみ、または分子的特徴のみを含むデータセット(古代DNAのサンプルや連続的に採取されたウイルスのサンプルを含むデータセットなど)の解析にも使用できます。
先端年代測定はベイジアン系統発生ソフトウェアに実装されており、通常は進化の化石の誕生と死のモデルを利用しています。これは、種分化、絶滅、化石と現存する分類群のサンプリングを可能にする多様化モデルです。
この有望な方法はまだ完全に成熟しておらず、その結果を解釈する際には考慮しなければならないバイアスや望ましくない行動が数多く存在します。[1]
参考文献
- ^ Luo, Arong; Duchêne, David A.; Zhang, Chi; Zhu, Chao-Dong; Ho, Simon (2019). 「化石化した誕生-死亡プロセスにおける先端年代測定のシミュレーションベースの評価」。系統的生物 学。69 ( 2): 325–344。doi : 10.1093 / sysbio/ syz038。PMC 7175741。PMID 31132125。
