国際ウイルス分類委員会 （ICTV ）は、ウイルスの 分類 と命名法を承認し、組織化しています。[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] ウイルス学者 とみなされています。[ 4 ] ICTVは、国際微生物学会連合 のウイルス学部門から設立され、その管理下にあります。[ 5 ] [ 2 ]
歴史 国際ウイルス命名委員会（ICNV）は、ウイルス分類群の命名を標準化するために、1966年にモスクワで開催された国際微生物学会議で設立されました。[ 6 ] [ 6 ] 脊椎動物 に感染するウイルスについては、最初の報告書には19属、2科、およびさらに24の未分類グループが含まれていました。[ 7 ]
ICNVは1974年に国際ウイルス分類委員会に改名された。[ 6 ]
組織構造 この組織は、任期が固定された選出された役職のメンバーと役員、および直接任命された 7 つの小委員会の委員長を含む執行委員会に分かれています。各小委員会の委員長は、さらに多数の「研究グループ」を任命します。各研究グループは、1 人の議長と、目や科などの特定の分類群の分類学に専念する可変数のメンバーで構成されています。この構造は次のように視覚化できます。[ 8 ]
執行委員会 社長 副社長 秘書 委員長 – 7名（各小委員会に1名ずつ） 選出議員数：11名 小委員会 動物DNA ウイルスおよびレトロウイルス小委員会 – 研究グループ：18 動物dsRNAおよびssRNAウイルス小委員会 – 研究グループ：24 動物ssRNA+ウイルス小委員会 – 研究グループ：16 細菌ウイルス小委員会 – 研究グループ：20 古細菌ウイルス小委員会 – 研究グループ：11 真菌および原生 生物ウイルス小委員会 – 研究グループ：12 植物ウイルス小委員会 – 研究グループ：22
目的 国際ウイルス分類委員会の目的は以下のとおりです。[ 9 ] :
ウイルスに関する国際的に合意された分類体系を開発する。 ウイルス分類群について、国際的に合意された名称を確立すること。 ウイルス分類および命名法に関する決定事項を、会議の開催および報告書の公表を通じてウイルス学者に伝える。 ウイルス分類群の合意された名称の公式索引を維持するため。 現代社会におけるウイルスの影響とその挙動を研究する。
命名法の原則 ICTVのウイルス命名法の基本原則は以下のとおりです。[ 10 ] :
安定性 誤解や混乱を招く可能性のある名称の使用を避ける、または拒否する 不必要な名前の作成を避けるため ICTVの普遍的なウイルス分類システムは、標準的な生物分類 システムをわずかに修正したバージョンを使用しています。分類は 、目、科、亜科、属、種の5つのみです。種を属に分類する方法が不明だが、科での分類が明確な場合は、その科の未分類種として分類されます。多くの分類群はランク付けされていません。また、GenBank には3,142の「種」に割り当てられた配列がありますが、ICTVの報告書には記載されていません（ただし、GenBankの仕組み上、実際の適切な種の数は恐らくかなり少ないでしょう）。[ 2 ] [ 2 ] [ 11 ]
ICTVは1962年の設立以来、安定性の実現において目覚ましい成功を収めてきた。例えば、1980年代に認められたすべての属と科は、2005年時点でも引き続き使用されていた。[ 2 ]
分類群の命名と変更 新名称、名称変更、分類群の設立および分類学的配置に関する提案は、ICTVの執行委員会によって提案の形で処理されます。決定が下される前に、関連するすべてのICTV小委員会および研究グループに諮問されます。[ 10 ] ：
分類群 の名称は、ICTVによって承認されるまでは公式な地位を持たず、承認された階層的分類群に関連付けられている場合にのみ名称が受け入れられます。[ 10 ] ： [ 10 ] ：
ウイルス学には優先権の原則 がないため、現在使用されている名称は優先権を主張することによって無効にされることはない。[ 10 ] ：
分類に関する規則
種 2020年以降、[ 12 ] 種小名を付ける二名法を用いることが義務付けられている。 [ 10 ] : [ 10 ] :
それ以前は、より自由な命名システムが適用されていました。種名は、可能な限り少ない単語で構成されるべきですが、宿主名と「ウイルス」という単語だけで構成されてはなりません。数字、文字、またはそれらの組み合わせは、既に広く使用されている場合に限り、種 小名 として使用できます。ただし、新たに指定されたシリアル番号、文字、またはそれらの組み合わせは、単独では種小名として認められません。番号または文字のシリーズが存在する場合は、それを継続することができます。[ 10 ]
属 ウイルス属とは、いくつかの重要な特性を共有し、宿主範囲と病原性のみが異なることが多い、関連種のグループである。属名は、接尾辞「-virus」で終わる単語でなければならない。新属の承認には 、タイプ種 の承認が伴わなければならない。[ 10 ] ：
亜科 亜科とは、特定の共通の特徴を共有する属のグループである。分類群は、複雑な階層的問題を解決するために必要な場合にのみ使用される。亜科名は、接尾辞-virinae で終わる単語でなければならない。[ 10 ] ：
家族 科とは、亜科に組織されているか否かにかかわらず、共通の特徴を共有する属の集まりである。科名は、接尾辞-viridae で終わる単語でなければならない。[ 10 ] :
注文 目とは、特定の共通の特徴を持つ科の集まりである。目名は、接尾辞「 -virales」 で終わる単語でなければならない。[ 10 ] ：
亜ウイルス性病原体に関する規則 ウイルスの分類に関する規則は、ウイロイド の分類にも適用される。ウイロイドの分類群の正式な語尾は、種の場合はviroid 、属の場合は接尾辞-viroid 、亜科の場合は接尾辞-viroinae （この分類群が必要な場合）、科の場合は -viroidaeで ある。[ 10 ] ： -vir-を -satellit- および-viriform- に置き換える。[ 10 ] ：
レトロトランスポゾンは分類と命名法上ウイルスとみなされている。プリオンは ウイルスとして分類されていないが、特定の分野の研究者にとって有用と思われる任意の分類が割り当てられている。[ 13 ]
正書法の規則 正式な分類学的用法では、ウイルスの目、科、亜科、属の承認された名称はイタリック体で印刷され、名称の最初の文字は大文字で表記されます。[ 14 ] 種名はイタリック体で表記され、最初の単語の最初の文字が大文字になります。固有名詞、または固有名詞の一部である場合を除き、その他の単語は小文字で表記されます。 正式な用法においては、分類群の名称は分類単位の名称の前に記載されるべきである。
ICTVは、ウイルスメタゲノミクス の重要性を認識し、メタゲノムデータから組み立てられたゲノムが実際のウイルスを表していることを認め、古典的なウイルス学的手法を用いて分離および特徴付けられたウイルスに使用された手順と同じ手順に従って公式に分類することを推奨している。[ 15 ] [ 16 ]
ICTVの報道 ICTVは1971年以来、10年ごとに2回程度ウイルスの分類に関する報告書を発表してきました（下記「報告書」を参照）。第9回ICTV報告書は2011年12月に発表されました[ 17 ] [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ] [ 21 ]
ICTVdbデータベース ICTVdbは、ICTV分類データベースの補完として使用されることを目的とした種および分離株データベースです。ICTVdbの開発は1991年以来ICTVによって支援されており、当初は分類学的研究を支援することを目的としていました。このデータベースは、主に化学的特性、ゲノム タイプ、核酸 複製、疾患、ベクター 、地理的分布などの特性に基づいてウイルスを分類します。[ 22 ]
このデータベースは、米国国立科学財団の支援を受けて オーストラリア国立大学 で開発され、アメリカンタイプカルチャーコレクション の支援を受けています。分類学的データ交換の世界標準である分類記述言語（DELTA ）システムを使用しており、オーストラリア連邦科学産業研究機構 （CSIRO）で開発されました。DELTAは、多様なデータを保存し、従来のレポートやウェブ公開に適した言語に変換することができます。たとえば、ICTVdB自体にはゲノム配列情報は含まれていませんが、DELTAデータをNEXUS形式に変換できます。[ 23 ]
ICTVdBは、コンセプトと機能の両面で成長し、主要な参考資料および研究ツールとなりました。1999年には、オーストラリア国立大学のメインサイトと、英国および米国に拠点を置く2つのミラーサイトから、1日あたり3万件以上のオンラインアクセスがありました。[ 24 ]
2011年、ICTVはICTVdbプロジェクトとウェブサイトの運営を停止することを決定しました。この決定は、サイトで提供されている分類体系が何年も前のものであったこと、また、ICTVdbウェブサイトの自然言語出力をサポートするためにデータベースのクエリと処理方法に問題があったため、サイト上の情報の一部が不正確であることが明らかになった後に下されました。ICTVはこれらの問題を解決する最善の方法について議論を開始しましたが、更新とエラー修正にかかる時間が十分に長いため、不正確な情報を公開し続けるよりもサイトを閉鎖するのが最善であると判断しました。[ 25 ] [ 3 ] [ 3 ] [ 20 ]
報告書 ウイルス、国際命名委員会；ピーター・ワイルディ（1971）。ウイルスの分類と命名法 。第1報。絶版 ウイルス、国際分類委員会；フェナー、フランク（1976）。ウイルスの分類と命名法 。第2次報告書。ISBN 978-3805524186 。 ウイルス、国際分類委員会；リチャード・エリス・フォード・マシューズ；国際微生物学会連合ウイルス学部門（1979年）。ウイルスの分類と命名法 。第3次報告書。ISBN 978-3805505239 。 エリス、リチャード、マシューズ、フォード編（1982）。ウイルスの分類と命名法 。第4版。カーガー。199 ページ。ISBN 9783805535571 。 ウイルス、国際分類委員会；Francki, RI B (1991)。ウイルスの分類と命名法 。第5次報告書。ISBN 978-3211822869 。 マーフィー、フレデリック A (1995).ウイルス分類学：ウイルスの分類と命名法 。第6版。ISBN 978-3211825945 。 ウイルス、国際分類委員会；Van Regenmortel, MH V；Fauquet, C. M；Bishop, DH L (2000)。ウイルス分類：ウイルスの分類と命名法 。第7次報告書。ISBN 978-0123702005 。 Fauquet, CM 編 (2005).ウイルス分類学：ウイルスの分類と命名法 . 第 8 版. Elsevier/Academic Press. ISBN 978-0080575483 。 King, Andrew MQ; Lefkowitz, Elliot; Adams, Michael J.; 他 編 (2011).ウイルス分類学：ウイルスの分類と命名法 . 第9版. Elsevier/Academic Press. p. 1338. ISBN 9780123846846 。 [ 18 ] ICTV第10回（オンライン）レポート[ 19 ]
参考文献 ↑ King, Andrew MQ; Lefkowitz, E.; Adams, MJ; Carstens, EB (2012). Virus Taxonomy Classification and Nomenclature of Viruses: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses . Elsevier. ISBN 978-0-12-384684-6 2017年12月10日にオリジナルからアーカイブされました。2017年 4月13日 に取得 。1 2 3 4 5 Fauquet, CM; Fargette, D. (2005). "International Committee on Taxonomy of Viruses and the 3,142 unassigned species" . Virology Journal . 2:64 . doi : 10.1186/1743-422X-2-64 . PMC 1208960. PMID 16105179 . 1 2 3 Gibbs, AJ (2013). 「ウイルス分類学は春の大掃除が必要 。 その探求の時代は終わった」 Virology Journal 10 : 254. doi : 10.1186/1743-422X-10-254 . PMC 3751428 . PMID 23938184 . ↑ 「多様なデータの銀行業務 – ICTVdBの起源」 。2005年11月13日。 2005年11月13日の オリジナル からアーカイブ 。 2018年 4月6日 取得。 ↑ 「国際微生物学会連合（IUMS）」 。 2007年9月30日時点の オリジナルからアーカイブ 。 2006年 6月22日 取得。 1 2 3 Kuhn, Jens H. (2021). 「ウイルス分類」. ウイルス学百科事典 . 第 1巻. pp. 28–37 . doi : 10.1016/B978-0-12-809633-8.21231-4 . ISBN 9780128145166 . PMC 7157452 . ↑ 「分類体系リリース履歴 | ICTV」 . ictv.global . 2024年 12月16日 取得 。 ↑ 「国際ウイルス分類委員会（ICTV）」 . ictv.global . 2023年 9月13日 取得 。 ↑ 「国際ウイルス分類委員会（ICTV）の規約」 . ICTV . 2023年3月。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 「国際ウイルス分類命名規約（ICVCN）」 ICTV 2021 年3月 ↑ シモンズ、ピーター。アダムス、マイク・J。ベンク、マリア。マイア・ブライトバート。ブリスター、J.ロドニー。カルステンス、エリック B.デイヴィソン、アンドリュー J.デルワート、エリック。ゴルバレニャ、アレクサンダー E.ハラハ、バラズ。ハル、ロジャー。キング、アンドリューMQ。クーニン、ユージーン V.クルポビッチ、マート。クーン、イェンス H. (2017 年 3 月)。 「メタゲノミクス時代のウイルス分類学」 。 ネイチャーレビュー 微生物学 。 15 (3): 161–168 . 土井 : 10.1038/nrmicro.2016.177 。 hdl : 1887/114573 。 ISSN 1740-1526 。 PMID 28134265 。 ↑ ビル・チャペル（2022年8月1日） 「『サル痘』は人種差別的な名前だと批判されているが、すぐには消えないだろう」 。NPR 。 2023年 12月18日 閲覧 。ICTV は、サル痘ウイルスの正式名称の変更は今後1～2年以内に行われる可能性があるとしているが、この改訂は現在の流行への対応ではない。むしろ、ICTVが2020年に命名形式を標準化するための変更を採用した後、サル痘を含むすべてのウイルス種の命名規則の広範な見直しの一環である。 ↑ 「真菌プリオン｜ICTV」 . ictv.global . 2024年 12月16日 取得 。 ↑ Ali, Muhammad (2016). "植物ウイルスの統一的な命名法に向けて" . Virologica Sinica . 31 (3): 197– 198. doi : 10.1007/s12250-016-3741-5 . PMC 8193424 . PMID 27052507 . S2CID 10162214 . ↑ シモンズ P、アダムス MJ、ベンク M、 ブライトバート M 、ブリスター JR、カルステンス EB、デイヴィソン AJ、デルワート E、ゴルバレニャ AE、ハラッハ B、ハル R、キング AMQ、クーニン EV、クルポビッチ M、クーン JH、レフコヴィッツ EJ、ニベルト ML、オートン R、ルーシンク MJ、サバナゾビッチ S、サリバン MB、サトル CA、テッシュ RB、ファン デル フルクト RA、ヴァルサーニ A、ゼルビーニ FM (2017)。 「コンセンサスステートメント: メタゲノミクス時代のウイルス分類学」 (PDF) 。 ネイチャーレビュー 微生物学 。 15 (3): 161–168 . 土井 : 10.1038/nrmicro.2016.177 。 PMID 28134265。 2018年7月 23日にオリジナルから アーカイブ （PDF） 。 2019年 10月18日 に取得。 ↑ Adams MJ、Lefkowitz EJ、King AM、Harrach B、Harrison RL、Knowles NJ、Kropinski AM、Krupovic M、Kuhn JH、Mushegian AR、Nibert ML、Sabanadzovic S、Sanfaçon H、Siddell SG、Simmonds P、Varsani A、Zerbini FM、Orton RJ、Smith DB、Gorbalenya AE、Davison AJ (2017)。 「 国際ウイルス分類委員会の50年：進歩と展望」 （ PDF） 。Archives of Virology。162 （ 5）： 1441–1446。doi ： 10.1007/ s00705-016-3215 -y。PMID 28078475。 2018 年 7月23日にオリジナルから アーカイブ （ PDF） 。 2019年 9月17日 に取得 。 ↑ King, Andrew MQ; 他 編 (2012). ウイルス分類学 ：ウイルスの分類と命名法 ：国際ウイルス分類委員会第9次報告書 . ロンドン：アカデミック・プレス. ISBN 978-0123846846 2014年9月11日にオリジナルからアーカイブされました。2014年 12月9日 に取得 。1 2 「ウイルス分類学：ウイルスの分類と命名法；ICTV第9次報告書（2011年）」 。 国際ウイルス分類委員会（ICTV） 。 2019年4月2日にオリジナルから アーカイブ。 2019年 10月18日 に取得 。 – 第III部の内容（ICTVの法令および規約を含む）は含まれません。1 2 「ウイルス分類学：ウイルスの分類と命名法；ICTV第10回報告書」 。 国際ウイルス分類委員会（ICTV） 。 2019年7月1日にオリジナルから アーカイブ 。 2019年 10月18日 に取得。 1 2 Lefkowitz, EJ; Dempsey, DM; Hendrickson, RC; Orton, RJ; Siddell, SG; Smith, DB (2018年1月4日). "ウイルス分類：国際ウイルス分類委員会（ICTV）のデータベース" . Nucleic Acids Research . 46 (D1): D708– D717. doi : 10.1093/nar/gkx932 . PMC 5753373 . PMID 29040670 . ↑ 「ICTVの最新分類リリース」 。 国際ウイルス分類委員会（ICTV） 。 2018年3月4日のオリジナルから アーカイブ。 2019年 10月18日 取得 。 ↑ Lefkowitz, Elliot J; Dempsey, Donald M; Hendrickson, Robert Curtis; Orton, Richard J; Siddell, Stuart G; Smith, Donald B (2018年1月4日). "ウイルス分類：国際ウイルス分類委員会（ICTV）のデータベース" . Nucleic Acids Research . 46 (D1): D708– D717. doi : 10.1093/nar/gkx932 . ISSN 0305-1048 . PMC 5753373 . PMID 29040670 . ↑ Maddison DR、Swofford DL、Maddison WP (1997 年 12 月)。 「NEXUS: 系統情報のための拡張可能なファイル形式」 。Syst . Biol . 46 (4): 590–621 . doi : 10.1093/sysbio/46.4.590 . PMID 11975335. S2CID 30267491 . ↑ 「多様なデータの銀行業務 - ICTVdBの起源」 。2005年11月13日。 2005年11月13日の オリジナル からアーカイブ。 2019年 10月18日 取得 。 ↑ Gibbs, Adrian J (2013年8月) 「ウイルス分類学は春の大掃除が必要 。 その探求の時代は終わった」 Virology Journal . 10 (1): 254. doi : 10.1186/1743-422X-10-254 . ISSN 1743-422X . PMC 3751428. PMID 23938184 .
外部リンク 公式サイト 「ICTVdBの歴史」（PDF） 。2006年9月7日にオリジナル（PDF）からアーカイブ済み 。2006年6月22日 に取得。 ウイルスバイオインフォマティクスリソースセンター ギブス、エイドリアン J (2013年8月9日) 「ウイルス分類学は春の大掃除が必要。その探求の時代は終わった」 Virology Journal . 10 :254. doi : 10.1186/1743-422X-10-254 . PMC 3751428. PMID 23938184.要旨：国際ウイルス分類委員会は最近、承認されたウイルス種の定義を変更し、ウイルス記述 データベースの作成作業も中止した。
