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TアームまたはT ループは、 tRNA分子上の特殊な領域であり、タンパク質の生合成または翻訳中にリボソームがtRNA-リボソーム複合体を形成するための特別な認識部位として機能します(生物学) 。
T アームには、T ステムと T ループの 2 つのコンポーネントがあります。
- Tステムは、一連の対になったヌクレオチドで構成されており、通常は5対ですが、1対から6対の場合もあります。[1] [2]
- Tループは、リボチミジン（T/m5U）、シュードウリジン、シチジン残基が存在するため、TΨCアームとも呼ばれる。これは、Uターンで積み重ねられた塩基からなるユニークな構造要素に折り畳まれ、現在では「Tループモチーフ」と呼ばれている。[3]
- 古細菌では、m5UはN1-メチルシュードウリジン（m1Ψ）に置き換えられています。位置54のm5U/m1Ψ修飾は構造安定性を高めると考えられています。[4]
T ループを欠く tRNA を持つ生物は、天然の tRNA を持つ生物に比べて、アミノアシル化とEF-Tu結合のレベルがはるかに低い。 [引用が必要]
Tループモチーフは、多くの非コードRNAに遍在する構造要素として同定されている。[3] rRNAに見られるTループの少なくとも1つの他の例も、m5U修飾を有している。[5]
参考文献
- ^ Lang, B. Franz; Lavrov, Dennis; Beck, Natacha; Steinberg, Sergey V. (2012). 「ミトコンドリア tRNA の構造、アイデンティティ、遺伝コードの進化」 Bullerwell, Charles E. (編)オルガネラ遺伝学ベルリン: Springer. pp. 431–474. doi :10.1007/978-3-642-22380-8_17. ISBN 9783642223792。
- ^ ディルハイマー、G.キース、G.デュマ、P. Westhof、E. (1995)。 「tRNAの一次、二次、三次構造」。ゼルでは、ディーター。 RajBhandary、Uttam (編)。tRNA: 構造、生合成、および機能。ワシントンDC：ASMプレス。 93–126ページ。土井：10.1128/9781555818333.ch8。ISBN 9781555810733。
- ^ ab Chan, CW; Chetnani, B; Mondragón, A (2013年9月). 「非コードRNAにおけるTループ構造モチーフの構造と機能」. Wiley Interdisciplinary Reviews. RNA . 4 (5): 507–22. doi :10.1002/wrna.1175. PMC 3748142. PMID 23754657 .
- ^ Wurm JP、Griese M、Bahr U、Held M、Heckel A、Karas M、他 (2012 年 3 月)。「古細菌 tRNA におけるシュードウリジン 54 の N1 メチル化を担う酵素の同定」。RNA . 18 ( 3): 412–420. doi :10.1261/rna.028498.111. PMC 3285930 . PMID 22274954。
対照的に、ほとんどの古細菌では、この位置は別の高度に修飾されたヌクレオチド、すなわち等比重の N1 メチル化シュードウリジンによって占められている。
- ^ Powell, CA; Minczuk, M (2020年4月). 「TRMT2BはヒトミトコンドリアにおけるtRNAとrRNAのm(5)Uメチル化の両方に関与している」. RNA Biology . 17 (4): 451–462. doi :10.1080/15476286.2020.1712544. PMC 7237155. PMID 31948311 .