小型核小体RNA SNORD64

分子生物学において、SNORD64 （ HBII-13とも呼ばれる）は、他の小型核RNA （snRNA）の生合成（修飾）に関与する非コードRNA （ncRNA）分子である。この種の修飾RNAは、snRNA生合成の主要な部位である真核細胞の核小体に局在する。そのため、小型核小体RNA （snoRNA）として知られ、ガイドRNAとも呼ばれることが多い。

SNORD64は、Cボックス（UGAUGA）とDボックス（CUGA）として知られる保存配列モチーフを含むsnoRNAのC/Dボックスクラスに属します。ボックスC/Dファミリーのメンバーのほとんどは、基質RNAの部位特異的2'-O-メチル化を誘導する機能を持っています。^{[ 1 ]}

snoRNA HBII-13 は主に脳組織で発現していますが、肺、腎臓、筋肉にも存在します。^{[ 2 ]}しかし、HBII-13 には既知の標的 RNA がありません。^{[ 3 ]} HBII-13 遺伝子は、他のいくつかの snoRNA HBII-436、HBII-437、HBII-438A/B、および HBII-85、HBII-52 のクラスターとともに、大きな父方発現転写ユニット( SNURF-SNRNP -UBE3A AS) の 460 kb イントロン内に位置しています。^{[ 4 ]}この宿主遺伝子は、母方発現 UBE3A 遺伝子のアンチセンス転写産物です。

参考文献

↑ Galardi S、Fatica A、Bachi A、Scaloni A、Presutti C、Bozzoni I (2002 年 10 月)。「精製された box C / D snoRNP は、標的 RNA の部位特異的 2'-O-メチル化を試験管内で再現できる」。Molecular and Cellular Biology。22 ( 19): 6663–8。doi : 10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002。PMC 134041。PMID 12215523。
↑ Cavaillé J、Buiting K、Kiefmann M、Lalande M、Brannan CI、Horsthemke B、Bachellerie JP、Brosius J、Hüttenhofer A (2000 年 12 月)。「異常なゲノム構造を示す脳特異的かつインプリントされた小型核小体RNA 遺伝子の同定」。米国科学アカデミー紀要。97 (26): 14311–6。doi : 10.1073 /pnas.250426397。PMC 18915。PMID 11106375。
↑ Lestrade L、Weber MJ ( 2006年1 月)。「 snoRNA-LBME-db、ヒト H / ACAおよびC/D ボックス snoRNA の包括的なデータベース」。Nucleic Acids Research。34 (データベース特集号): D158-62。CiteSeerX 10.1.1.105.7552。doi : 10.1093 / nar/gkj002。PMC 1347365。PMID 16381836。
↑ Runte M、Hüttenhofer A、Gross S、Kiefmann M、Horsthemke B、Buiting K (2001年11月)。「IC-SNURF-SNRPN転写産物は、複数の小型核小体RNA種の宿主として、またUBE3AのアンチセンスRNAとして機能する」。Human Molecular Genetics。10 ( 23 ) : 2687–700。doi : 10.1093 /hmg/ 10.23.2687。PMID 11726556。

外部リンク

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snoRNABaseにおけるSNORD64のエントリー

[1] Galardi S、Fatica A、Bachi A、Scaloni A、Presutti C、Bozzoni I (2002 年 10 月)。「精製された box C / D snoRNP は、標的 RNA の部位特異的 2'-O-メチル化を試験管内で再現できる」。Molecular and Cellular Biology。22 ( 19): 6663–8。doi : 10.1128 / MCB.22.19.6663-6668.2002。PMC 134041。PMID 12215523。

[pmid11106375-2] Cavaillé J、Buiting K、Kiefmann M、Lalande M、Brannan CI、Horsthemke B、Bachellerie JP、Brosius J、Hüttenhofer A (2000 年 12 月)。「異常なゲノム構造を示す脳特異的かつインプリントされた小型核小体RNA 遺伝子の同定」。米国科学アカデミー紀要。97 (26): 14311–6。doi : 10.1073 /pnas.250426397。PMC 18915。PMID 11106375。

[pmid16381836-3] Lestrade L、Weber MJ ( 2006年1 月)。「 snoRNA-LBME-db、ヒト H / ACAおよびC/D ボックス snoRNA の包括的なデータベース」。Nucleic Acids Research。34 (データベース特集号): D158-62。CiteSeerX 10.1.1.105.7552。doi : 10.1093 / nar/gkj002。PMC 1347365。PMID 16381836。

[pmid11726556-4] Runte M、Hüttenhofer A、Gross S、Kiefmann M、Horsthemke B、Buiting K (2001年11月)。「IC-SNURF-SNRPN転写産物は、複数の小型核小体RNA種の宿主として、またUBE3AのアンチセンスRNAとして機能する」。Human Molecular Genetics。10 ( 23 ) : 2687–700。doi : 10.1093 /hmg/ 10.23.2687。PMID 11726556。

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