小さな核小体RNA SNORD50

小さな核小体RNA SNORD50
小さな核小体RNA SNORD50
	SNORD50の予測される二次構造と配列の保存性
識別子
シンボル	スノルド50
代替記号	50代
Rfam	RF00278
その他のデータ
RNAタイプ	遺伝子; snRNA ; snoRNA ; CD ボックス
ドメイン	真核生物
行く	GO:0006396 GO:0005730
それで	0000593 ...
PDB構造	PDBe

分子生物学において、snoRNA U50 ( SNORD50とも呼ばれる) は、他の小さな核内 RNA (snRNA)の修飾に機能する非コード RNA (ncRNA) 分子です。このタイプの修飾 RNA は通常、snRNA 生合成の主要部位である真核細胞の核小体にあります。これは小さな核小体 RNA (snoRNA) として知られ、ガイド RNA とも呼ばれます。

snoRNA U50は、Cボックス（UGAUGA）とDボックス（CUGA）として知られる保存された配列モチーフを含むsnoRNAのC/Dボックスクラスに属します。ボックスC/Dファミリーのメンバーのほとんどは、基質RNAの部位特異的な2'-O-メチル化を指示する機能を持っています。^[1]^[2]

U50 は、染色体転座 t(3;6)(q27;q15) の切断点にある染色体 6q15 に位置するイントロンsnoRNA 遺伝子です。U50HG 遺伝子は 6 つのエクソンで構成されており、そのスプライスされた転写産物はタンパク質をコードする可能性がほとんどなく、そのイントロンは核小体に局在する U50 および U50 様 (U50') snoRNA の両方を生成します。^[3] U50 パラログが、がんの腫瘍形成と治療に対する感受性を制御する新しい遺伝子ファミリーを形成するという証拠があります。^[4]^[5]

参考文献

^ Galardi, S.; Fatica, A.; Bachi, A.; Scaloni, A.; Presutti, C.; Bozzoni, I. (2002 年 10 月)。「精製 Box C/D snoRNP は、in Vitro で標的 RNA の部位特異的 2'-O-メチル化を再現できる」。分子細胞生物学。22 (19): 6663–6668。doi : 10.1128/ MCB.22.19.6663-6668.2002。PMC 134041。PMID 12215523。
^ Kiss-Laszlo, Z; Henry Y; Bachellerie JP; Caizergues-Ferrer M; Kiss T (1996). 「プレリボソームRNAの部位特異的リボースメチル化：小さな核小体RNAの新しい機能」. Cell . 85 (7): 1077–1088. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81308-2 . PMID 8674114. S2CID 10418885.
^ Tanaka, R; Satoh H; Moriyama M; Satoh K; Morishita Y; Yoshida S; Watanabe T; Nakamura Y; Mori S (2000). 「タンパク質コード能のないイントロンU50小核小体RNA（snoRNA）宿主遺伝子はヒトB細胞リンパ腫の染色体切断点t(3;6)(q27;q15)にマッピングされる」。Genes Cells . 5 (4): 277–287. doi : 10.1046/j.1365-2443.2000.00325.x . PMID 10792466。
^ Mourtada-Maarabouni M、Pickard MR、Hedge VL、Farzaneh F、Williams GT（2008年10月）。「非タンパク質コードRNAであるGAS5はアポトーシスを制御し、乳がんではダウンレギュレーションされる」。Oncogene。28 （ 2 ）：195–208。doi：10.1038 /onc.2008.373。PMID 18836484。
^ Dong XY、Guo P、 Boyd J、他 (2009年8月)。「ヒト乳がんにおけるsnoRNA U50の影響」。J Genet Genomics。36 ( 8): 447–54。doi : 10.1016 /S1673-8527(08) 60134-4。PMC 2854654。PMID 19683667。

外部リンク

Rfamの Small nucleolar RNA SNORD50 のページ
snoRNABaseの SNORD50 へのエントリー
snoRNABaseの SNORD50B のエントリ

[1] Galardi, S.; Fatica, A.; Bachi, A.; Scaloni, A.; Presutti, C.; Bozzoni, I. (2002 年 10 月)。「精製 Box C/D snoRNP は、in Vitro で標的 RNA の部位特異的 2'-O-メチル化を再現できる」。分子細胞生物学。22 (19): 6663–6668。doi : 10.1128/ MCB.22.19.6663-6668.2002。PMC 134041。PMID 12215523。

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